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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vium3427g00010 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1892
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vium3427g00010 1892 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 131 1885 - -
Vium3427g00010 1892 SMART FKS1_dom1_2 336 450 IPR026899 -
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Vium3427g00010 1892 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 338 447 IPR026899 -
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Vium3427g00010 1892 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1028 1109 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vium3427g00010 Vium-Chr3427 52604 85919 Tandem
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vium3427g00010 1 1892 Cell Wall Biosynthesis AT3G07160 76.270 0.0 3041
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vium3427g00010 K11000 - gmx:100811473 3519.17