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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vium3332g00001 ATGACGGACACAATACCAGCATGTTACAATGTGTCTATAGTTAATTCTAATCAATTTTGGAAAACTGACAAAGTCCTGAAAACAGAGCTCCCTATTTTGGCCATTCAAATTGCTTTTGTTGTTGGGTTATCTCGTATCTTTTCCATAATCTACAAACCTTTACATCAAACTCGTCTCATTTCACAAATCGCTGTTGGTTTCCTACTAACACCACCATTACTTGGAAGATTCACGCTCATTTTTGAGTTCATTTTTCCGGTAAACGGGGTTGTTAATGTCGAGGTCCTTTCGCACATTGGTCTTATTTATTATGCATTCCTTAGTGGATTAGAGATGAACTTAACTACCATCCTACACGTGAAAAGGAAAGCTGCAAGCATCGCAATTGCTGGGATCATCTTTCCCATGCTCATTGCACCATGGTTATATGGTTTGTTTCGAAAAGTTTACGGACATATTATGATGTTTCCCCTTGAGGAAAGTACAAATAAGGCTTATATACTTTGGACTTTAATTCTTACTGTTACAAGTTTTCCTGTGGTAGCACACACACTTTCTGAGCTTAAGCTCCTCTATACTGGTCTTGGAAAAGCGGCCTTAACAGCCTCTATGATTGGTGACACCTATAGTTGGATTCTTTTCACTTTATTTGTTCCATTTTCAATTAATGGTAAAGGAGCTATCTACACTGTGCCATGCACGATAATCTTTATTGTTGTGTGCATCTTTGTGGTACGTCCAGTCATTCAATGGTTTATTGATCGCAAGGCAGACAAAGATGAATGGAATGATAACCAATTGCTATTTATATTCATGGGTGTTTTAGCTTGTTCATGCATTTCAGATTTTCTCGGTGCACATGCCATTGTTGGGGCTTTTGTTTTTGGACTAATTTTACCTCATGGGAAATTTGCTGAAATGGTTATGTCAATTTCAGATGATTTTGTTGCCGGCTTTTTAGTACCCCTATTCTTTACTGGGACTGGGATGAAACTTATGCTGATTGCAATTTTCTTCCATGAAAATTGGCCCTTTATAATTATGATTATATTCTTGTTATGTGCTCTAAAGATTTTAAGCACTTTATTTGTTACTTTATTCTCCGGTATGCGTATCCGAGATGGTTTGACTTTGGGCTTGATTTTGAACAATAAAGGCGCCATGGCATTAATAATGTTGAACATTGCTTGGGATAGAACGATATTTTCTGTACCTACCTATGCTGTTATAACTTCTGCTGTTCTTCTAATGACCATAATTGTGTCTCCCGTCATCAATGCCATTTTCAAACCAAGAAAGAGATTTGAACAAAATAAGCTAAAGACCATACAAAAACTAAGGATTGATTCAGAGCTTCGACTTATAACATGTATCCATAATACTCGCCAAGATGCAAACATGATTAACATAATTGAATGTTTTAATGCCATGAGAGTTTCCCCTGTGCATGTTTTTGCCTTGTACCTTGTTGAACTTACTGGACGTGCTGCTGCCCTAGTTGCTGCACATATAGGGAAGCCTAGCAACCAACCTGGAGAACAAAACTTAACCAGGTCTCAAGAAGAGTTAGAAAGCATTCACAATGCATTTGATGCTCTTGGAGAGGCATATGACGCTATTAGAGTTGAGACCTTAAATGTGGTGTCAGCATATGCAACTATTCATGAGGACATATACCACTCAGCAGATGAGAAACGCACAAGCTTAATTCTTCTTCCATTTCACAAACAATTAACTTTAGAAGGTACTTTAGAAGTAACCAATGTTGTATACAAAGATATAAACCAAAATGTAATGCAAGGTGCTCCCTGCTCTGTGGGAATATTTATTGACCGTGATTTTGGGTTAGTTCCCAAAATGAACCTTCATGTTCGCATGGTCTTTGTTGGTGGTCCTGATGATCGTGAAGCATTGGCCATTGCATGGAGGATGGTAGGACGTCCAGGAACAGAACTCTCAGTGGTTCGAATACTTCTATTAGGTGAAGCAGCAGAAGTAGATGCCTCTGTTCATGATGAAACACAAGAGATATTATCTGTAGTTATAGACACAGATAAGCAAAAGGAGTTAGATGATGAATATATAAACACATTCAGACTTACAGCAGTTAACAATAATGATTCAATATCTTACTCAGAGATTGATGTTCATAATGGTGAAGATATTCCTATAGTCCTCAATGAAATAGAAAAATTTGGTTGTGATCTTTACATAGTTGGACAAGGGAATTGTAGGAACTCTAAGGTATTCACAGATTTGCTAGAGTGGTGTGAGTGCTTGGAACTTGGAGTCATAGGAGACATTTTGGTGTCAAATAATTTTGGTTCACGCTCGTCTGTGCTAGTTGTTCAACAATATGGATATGGAGGAATGATTTTTGGAAATAATCTAAACCATAAGGCCACTAACAAAGGCATATTTGAGTCTGTTGTTTGA 2436 0.3756 MTDTIPACYNVSIVNSNQFWKTDKVLKTELPILAIQIAFVVGLSRIFSIIYKPLHQTRLISQIAVGFLLTPPLLGRFTLIFEFIFPVNGVVNVEVLSHIGLIYYAFLSGLEMNLTTILHVKRKAASIAIAGIIFPMLIAPWLYGLFRKVYGHIMMFPLEESTNKAYILWTLILTVTSFPVVAHTLSELKLLYTGLGKAALTASMIGDTYSWILFTLFVPFSINGKGAIYTVPCTIIFIVVCIFVVRPVIQWFIDRKADKDEWNDNQLLFIFMGVLACSCISDFLGAHAIVGAFVFGLILPHGKFAEMVMSISDDFVAGFLVPLFFTGTGMKLMLIAIFFHENWPFIIMIIFLLCALKILSTLFVTLFSGMRIRDGLTLGLILNNKGAMALIMLNIAWDRTIFSVPTYAVITSAVLLMTIIVSPVINAIFKPRKRFEQNKLKTIQKLRIDSELRLITCIHNTRQDANMINIIECFNAMRVSPVHVFALYLVELTGRAAALVAAHIGKPSNQPGEQNLTRSQEELESIHNAFDALGEAYDAIRVETLNVVSAYATIHEDIYHSADEKRTSLILLPFHKQLTLEGTLEVTNVVYKDINQNVMQGAPCSVGIFIDRDFGLVPKMNLHVRMVFVGGPDDREALAIAWRMVGRPGTELSVVRILLLGEAAEVDASVHDETQEILSVVIDTDKQKELDDEYINTFRLTAVNNNDSISYSEIDVHNGEDIPIVLNEIEKFGCDLYIVGQGNCRNSKVFTDLLEWCECLELGVIGDILVSNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMIFGNNLNHKATNKGIFESVV 811
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vium3332g00001 811 Gene3D - 32 439 IPR038770 -
Vium3332g00001 811 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 7 786 - -
Vium3332g00001 811 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 39 428 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vium3332g00001 Vium-Chr3332 10134 12773 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vium3332g00001 2 786 Antiporter Super Family AT2G13620 37.484 0.0 550
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vium3332g00001 - - gmx:100800072 1266.91