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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vium2861g00014 ATGGATTTAGCCATGCATGATTTTGCAGAAATGACCAATTACATTAATTCAGTAAGAAACACAAAGCTATTTGTACTCCAGCATTCACAGGGTAAAATGTCTTTTGCTGTTGCCTTCACTCAACTGGAGATACCAGAAAACTTTGTTGCAGCATCCAAGGACGTTCAGAAACTCAACCACAGAAGAACCAAATTAAGAGGTGCCAGAGTTTCTACAGTTTCTTCGTTTCAGTCTCAACCAAGTGCATGGGAAGGGTTTCAGGATCTTGCTATGGCATTGGTATTTGTAATAGGCTATGTAGCCATCATATTTGAAGAATATCTAGCCTTCAATAAAAGTGGAGTGGGACTGTTGATGGCAGTAAGCTTATGGGTGATACGCAGTATTGGGGCTCCATCAACTGATATAGAAGTTTCAGAGTTAACACATGCATCTGCACAAGTCAGTGAAATAGTATTTTTCTTGCTTGCTGCAATGACCATTGTTGAGATAATTGACGCTCATCGAGGATTTAAGCTTGTTACGGACAATATAACAACCCAAAATCCACGCCTTCTCCTATGGGTGATTGGATTTGTTACGTTCTTTCTAAGTTCAGTTCTGGACAGCTTGGCATCTACCGTAGTTATGATTTCTCTATTGCGAAAATTGTTACGTCTATCAGAGTTACGGAAGATATTGGGAGCTGTTGTTGTAATAGCAGCAAATGCTGGTGGTGCATGGAGTCCTATTGGTGCTGTTACCACTACTATGCTGTGGATACACGGTCAAATATCTGTTGTACAAACAATGAAGGATTTGTTTATACCTTCAGTCATTTCTCTGGCTGTTCCTCTAGTTCTGATGTCCCTGACAAGTATAGTTAATGATGGAAAAGGACAAAACTCTCTCGGTGTATTTTCCTCTGAGGAGAGTGCTCCACAAGGACTGCTTGTTTTCTCATTGAGTTTAGGAGCTTTGCTTTTTGTCCCAGTGTTCAGGGCCTTCACAGGTTTACCTCCCTACATGGGAATTCTTCTCGGACTTGGCATGCTTTGGATCGTCACCGATGTTATCCATTATGGTGATTCTGAGAGGCAAAAGCTAAAAGTGCCACATGCTCTGTCAAGAATAGACACTCAGGGAGCACTGTTTTTCCTCGGAATTCTATTATCCGTTAGCAGCCTGGAGGCAGCAGGGATTCTGCAGGAAATAGCAAATTACTTTGATGCACATGTGCCTAGTAGTGAACTGATTGCAAGTGCTATTGGACTCATATCTGCTGTAATAGACAATGTTCCATTGGTTGCTGCAACAATGGGAATGTATGATGTCTCTTCTTTCCCTCAAGATTCTGAATTCTGGCAATTGATTGCATTATGTGCTAGTACTGGTGGATCCATATTAATTGCCGGTTCAGCTGCTGGAGTTGCGTTCATGGGGATGGAAAAGGTGAACTTCTGTTGGTACTTGCGGAAGGTTAGTGGCTTTGCCTTAGCAGGTTATGCTGCTGGTGTTGCTGCCTATTTAGTGCTTCATAAATCAAGAATTTGA 1533 0.4181 MDLAMHDFAEMTNYINSVRNTKLFVLQHSQGKMSFAVAFTQLEIPENFVAASKDVQKLNHRRTKLRGARVSTVSSFQSQPSAWEGFQDLAMALVFVIGYVAIIFEEYLAFNKSGVGLLMAVSLWVIRSIGAPSTDIEVSELTHASAQVSEIVFFLLAAMTIVEIIDAHRGFKLVTDNITTQNPRLLLWVIGFVTFFLSSVLDSLASTVVMISLLRKLLRLSELRKILGAVVVIAANAGGAWSPIGAVTTTMLWIHGQISVVQTMKDLFIPSVISLAVPLVLMSLTSIVNDGKGQNSLGVFSSEESAPQGLLVFSLSLGALLFVPVFRAFTGLPPYMGILLGLGMLWIVTDVIHYGDSERQKLKVPHALSRIDTQGALFFLGILLSVSSLEAAGILQEIANYFDAHVPSSELIASAIGLISAVIDNVPLVAATMGMYDVSSFPQDSEFWQLIALCASTGGSILIAGSAAGVAFMGMEKVNFCWYLRKVSGFALAGYAAGVAAYLVLHKSRI 510
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vium2861g00014 510 PANTHER SODIUM/PROTON ANTIPORTER 1-RELATED 67 508 IPR045016 GO:0006814|GO:0015297
Vium2861g00014 510 Pfam Citrate transporter 99 455 IPR004680 GO:0016020|GO:0055085
Vium2861g00014 510 NCBIfam sodium:proton antiporter NhaD 116 346 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vium2861g00014 Vium-Chr2861 133229 139190 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vium2861g00014 87 507 Antiporters AT3G19490 78.385 0.0 650
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vium2861g00014 - - vra:106771718 872.078