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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu9g01852 ATGATTATGATTATGATTATTATTATTATCATAATTGTCATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAGGATTATTATTATTATTATTATTATTTTTATTATTATTAATAATATCATCATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTGTTATTATTATGACTATTATGATGATAATTATTATTATTATGATTATTATTATGAGTATTATTTTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTAACAATAAAAATAATAATAATAATAAGTTTGTCACGCAAATGACATTTATATGTGATAATCAGACTGCTCTTCATATTAGTTCTAATCTTGTCTTTCATGAACACATTGAAATTGATTGTCATTTCATTCGAGAGAAGATTGAATCTAGAGATACCAAGATTGAATTCTATATTCAATATTATTATTATTATGATTATAATAATTATAATTATGATTATTATGCTTATTATTATTATTATTATGATGATGATTATTATTATTTTATTATTATTATTATGATTATTATTATAACTATTATTATTATTATTTTTATTGTTGTTGTTATGATTATGATTATTATTATGATTATGATTATTATTATTATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTATTGTTGTTATTATTATTATTATTATATCTATTCTTATTAATATTATTATTATTTTTATTATTATTATTATCACTATAAAAATATTAAATTTTTGTAGAGCGGTCATTTTCATCGGAATGTGCGACATCTCTCCCGCCGTGAACTCGATGCTTCTCCGCTCCATCGAGGATCGAAGTCGCCAAGCTCTCTCTCACTCTCTTTGTCTGTTAGGGTTTTCTTCTAGGTCTAGACACACCTACTCTGAATTCAACATTTGCGTGGTGGATATGAAGTTATCCGATTGTCATGGTAACTCTCATCTGAAAGGTCCTCCACCCTCCTCCAAGCCCGCTAAATTTGGCGGTGGCAAGCAACCTTCCATTCTCTCCGAGCGTCTGAGGACACAATCACCAGCCACTACCGGAAGCATTCAAGGGAAGAGAAACCCTATTGTGTGTGCCGAGCTTGGTGTAATGGCAATTTTGGGTATCCAACTCAATGCAGTGTCTGTTGTAAACCCTATTATGGTAATATGGATTGCTGTGGAATTTTGTGTGCATATAGTCCATGCTTTCACGAGTATGGGCAGTAGTGAGATGGATAAAGCTCCAAAAGAGAAGGAGTCAAAGACGCCACCACCTATGTCACAGGAGCAGTCTTCAACCACCGCTACTGGAACAATTAATCCTGATTGGCCTGGATTTCAGGCATATTCTCCTATACCTCCACACAGTTTCTTGGCATCAAGTCCACAAGCTCACCCTTATATGTGGGGTCCAGTTTTGAGCAACCCCGGTAATTATCGGCGGTTTTGGGCAACCCCGTGTATGATTATTATTAATATTATTATTATTGTTATTATTATGACTATTATAGTTTGGTTTAAAGGATGGAACCCTGGTTGTAAGTTGACCTACGTGGACGTTGGGTTCAGACCTAGGAGAGACGAGTGTGAAAAGTGGAATTTTGATGTGAGAATTTTGCATGGGAAGGAAGTAAATGGCTATGTGAGGAACAAAGTGTGTAGAATGGATGATGGGTTAGTTGTTATCATGCATGGTGAAGAGAGAAATAGAAGACAGCTCTTTGATGAAGGTTTCATTATTCATAGTGAAAGTTTGAGAGTTGTGCTTAGCATAGAAGAAGGGTGGGTTGTTGCATTTGTGATTATGGAAGGGGTGGATAAAAGGGTTGGAGTTTGGTTGAAAAAAAAATGGGAAGAAGAGAAAGAAGATATAATTGGGTTACGTAAGAATGATGAGGTAAAAGAAAGAGTGATCCTTGGGGGTATATTTTTAGTTTCTGATAATGCAGAGTTTAAAAGGAAAGAAAGGTTAGAAGGGGAGATAGTAAATGGAGTGAGTGGATTGGAAGAAAATGATATGAGGTTGGAAGAAGAGGAAATAAAGAGGATGCATGGAAGCTGCATGCAACGTGTTATTGGTGAGAGAAGAGTGAAAATTGCATTCAATTCCTTGATTTAG 2241 0.2999 MIMIMIIIIIIIVIIIIIIIIIIIIIIIRIIIIIIIIFIIINNIIIIITIIIIIIIIIIIIIVIIIIIVIIMTIMMIIIIIMIIIMSIIFIIIIIIIIIIIIINNKNNNNNKFVTQMTFICDNQTALHISSNLVFHEHIEIDCHFIREKIESRDTKIEFYIQYYYYYDYNNYNYDYYAYYYYYYDDDYYYFIIIIMIIIITIIIIIFIVVVMIMIIIMIMIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIVIVVIIIIIISILINIIIIFIIIIITIKILNFCRAVIFIGMCDISPAVNSMLLRSIEDRSRQALSHSLCLLGFSSRSRHTYSEFNICVVDMKLSDCHGNSHLKGPPPSSKPAKFGGGKQPSILSERLRTQSPATTGSIQGKRNPIVCAELGVMAILGIQLNAVSVVNPIMVIWIAVEFCVHIVHAFTSMGSSEMDKAPKEKESKTPPPMSQEQSSTTATGTINPDWPGFQAYSPIPPHSFLASSPQAHPYMWGPVLSNPGNYRRFWATPCMIIINIIIIVIIMTIIVWFKGWNPGCKLTYVDVGFRPRRDECEKWNFDVRILHGKEVNGYVRNKVCRMDDGLVVIMHGEERNRRQLFDEGFIIHSESLRVVLSIEEGWVVAFVIMEGVDKRVGVWLKKKWEEEKEDIIGLRKNDEVKERVILGGIFLVSDNAEFKRKERLEGEIVNGVSGLEENDMRLEEEEIKRMHGSCMQRVIGERRVKIAFNSLI 746
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu9g01852 746 Pfam G-box binding protein MFMR 447 512 IPR012900 -
Vimu9g01852 746 MobiDBLite consensus disorder prediction 451 478 - -
Vimu9g01852 746 PANTHER NPC INTRACELLULAR CHOLESTEROL TRANSPORTER 1 403 449 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu9g01852 Vimu-Chr9 28221525 28228867 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vimu9g01852 447 511 bZIP Transcription Factor Family AT1G32150 57.895 2.36e-19 89.0
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu9g01852 K09060 - gmx:100101882 129.028