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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu5g00892 ATGACGGACACAATACCTGCATGTTACAATATATCTATAGTTAATCCTAATCAATTTTGGAAAACTGATAAAGTCTTGAAAACAGAGCTACCTATTTTGGCCATTCAAATTGCTTTTACTGTTGTGTTATCTCGTCTCTTTTCCATAATCTATAAACCTCTGCATCAAACTCGTCTCATTTCACAAATCTCTGTTGGTTTCCTACTGACACCACCATTACTTGGAAGATTCATGCCATTTTTTGAATTCATTTTTCCAGTAAATGGGATTATTAATGTCGAGATCCTTTCCCACATTGGTCTCATTTATTATGCATTCCTTAGTGGATTGGAGATGAACTTAAATACCATTCTAAATGTGAATAAGAAAGCTACAAGCATTGCAATTGTTGGGATCATCTTTCCCATACTCGTTGCACCGTGCTTGTATGCTTTGTTTCGAAAAGTTTATGGACATGTTATGATGTTTCCCCTTGAGGAAAATACAAATAATGCTTATATACTTTGGACTTTAATTCTTACTGTTACAAGTTTTCCTGTGGTAGCACACACACTTTCTGAGCTTAAGCTCCTTTATACTGGTCTTGGCAAAGAGGCTTTAACAGCAGCCATGATTGGTGACACCTATGGTTGGATTCTTTTCACTTTATTTGTTCCCTTTTCAATTAATGGTAAAGGAGCCATCTACACTATGTTATGCACGATAATATTCGTTGTTGTGTGTATCTTTGTGGTACGTCCACTCATTCAATGGTTTATTGATCGCAAGGCAAACAAAGATGAATGGAATGATAACCAATTGCTCTTCATAATCATGGGCGTTTTAGCTTGTTCATGTATTTCAGATTTTCTTGGTGCACATGCCATTGTTGGGGCTTTTACTTTTGGATTAATTTTACCTCATGGAAAATTTGCTGAATTGGTCATGTCAATTTCAGATGATTGTGTTAGCGGCTTTTTAGTACCCCTCTTCTTTAGTGGAACTGGAATGAGACTTATGTTGATCACAATTTTCTCCCAAGAAAGTTGGCCCTTTATAATTATGATTATACTCTTGTTGTGTGCTCTAAAGATTTTAGGCACTTTATTTGTCACATTTTTCTTTGGTATTCGTATTCGAGATGGTTTGACCTTGGGCTTGATTTTGAATAATAAAGGTGCCATGGCCTTAATAATGCTGAACATTGCTTGGGATAGAACGATATTTTCTGTACCTACCTATGCTGTTTTAACTTCTGCTGTTCTTTTGATGACCATAATTGTGTCTCCCATCATCAATGCCATCTACAAACCAAGACAAATATTTGAACAAAACAAGCTAAAGACCATACAAAAATTAAGAGTTGATGCAGAGCTTCGAATTATAGCGTGTGTTCACAATACTCGCCAAGCTGCAAGCATGATTAGCATAATTGAATGTTTTAACCCCACGAGAGTTTCCCCTATGCATGTTTTTGCCTTGTACCTTGTCGAACTTACTGGACGTGTTGCTGCCTTAGTTGCTGCACATATAAGGAAGCCTAGTAGCCAACTCGGAGAACAAAACCTGACCAGGTCACAGGAAGAGTTAGAAAGCATTCACAATACATTTGATGGACTTAGAGAGACATATAATGCTATTAGAGTTGAGACCTTAAATGTGGTGTCAGCATATACAACTATTCATGAGGACATATATCACTCAGCAGATGAGAAACGCACAAGCTTAATTCTTCTTCCATTTCACAAACAATTAACTTTGGAAGGTAGTCTAGAAGTAACTAATGTTGTATACAAAGATATAAATCAAAATGTAATGCAAGGTGCTCCTTGCTCTGTGGGAATATTTGTTGATCGTGATTTTGGGTTAGTTCCCAAAATGAACCTTCATGTTCGTGTGGTCTTTGTTGGGGGTCCTGATGATCGTGAAGCCTTAGCCATTGCATGGAGGATGGCAGGACGATCAGGAACACAACTCTCACTAGTTCGAATTCTTCTATTGGGTGAAGCAGCAGAAGTAGATGCTTCAGTTCACAATGAATCACAAGGGATATTATCTGCGGTAATAGATACAGACAAGGAAAAAGAGTTAGATGAAGAGTATATAAGTGCATTCAGACTTACAACAGTTCACAATAGCGATATAATATCCTACTCAGAGATTGATGTTTATAGTGATGAAGATATTCCTGTAGTCCTCAAAGAGATAGAAAAAATTGATTGTGATATTTATATAGTTGGACAAGGGAATTGTAGGAACTCTAAGGTCTTCTCAAATTTGTTGGAGTGGTGTGAATGCTTAGAACTTGGAGTTATTGGGGATATTTTGGTGTCAAACAATTTTGGTTCACGTTCGTCTGTGCTAGTTGTTCAACAATATGGATATGGAAGAATGGTTTGTGGAAATAATCTTAACCAGAAGGCCACTAACAAAGGCATGTTTGAATCTATTGTTTGA 2436 0.3695 MTDTIPACYNISIVNPNQFWKTDKVLKTELPILAIQIAFTVVLSRLFSIIYKPLHQTRLISQISVGFLLTPPLLGRFMPFFEFIFPVNGIINVEILSHIGLIYYAFLSGLEMNLNTILNVNKKATSIAIVGIIFPILVAPCLYALFRKVYGHVMMFPLEENTNNAYILWTLILTVTSFPVVAHTLSELKLLYTGLGKEALTAAMIGDTYGWILFTLFVPFSINGKGAIYTMLCTIIFVVVCIFVVRPLIQWFIDRKANKDEWNDNQLLFIIMGVLACSCISDFLGAHAIVGAFTFGLILPHGKFAELVMSISDDCVSGFLVPLFFSGTGMRLMLITIFSQESWPFIIMIILLLCALKILGTLFVTFFFGIRIRDGLTLGLILNNKGAMALIMLNIAWDRTIFSVPTYAVLTSAVLLMTIIVSPIINAIYKPRQIFEQNKLKTIQKLRVDAELRIIACVHNTRQAASMISIIECFNPTRVSPMHVFALYLVELTGRVAALVAAHIRKPSSQLGEQNLTRSQEELESIHNTFDGLRETYNAIRVETLNVVSAYTTIHEDIYHSADEKRTSLILLPFHKQLTLEGSLEVTNVVYKDINQNVMQGAPCSVGIFVDRDFGLVPKMNLHVRVVFVGGPDDREALAIAWRMAGRSGTQLSLVRILLLGEAAEVDASVHNESQGILSAVIDTDKEKELDEEYISAFRLTTVHNSDIISYSEIDVYSDEDIPVVLKEIEKIDCDIYIVGQGNCRNSKVFSNLLEWCECLELGVIGDILVSNNFGSRSSVLVVQQYGYGRMVCGNNLNQKATNKGMFESIV 811
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu5g00892 811 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 39 425 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Vimu5g00892 811 Gene3D - 32 436 IPR038770 -
Vimu5g00892 811 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 12 786 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu5g00892 Vimu-Chr5 12113238 12115881 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vimu5g00892 2 786 Antiporter Super Family AT2G13620 36.146 0.0 541
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu5g00892 - - var:108320251 1343.95