Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vimu2g00125 TTTGTTGCCTTCAGCTCATTTTTGCTATTCCATTCGTTCTTGTTTCTTCAAGAAAAAATTAATGTGGAAATGGAAGCTCTTCGATCTCGTGTTTCCAGTTTTGTTTCGATCAAAGTGAAGTTTCGGAACCGCATCATTTCATATGTTTTACTGAACTTGGAAGAGAATTTGGCTCGTTGTGGATTGTTTACTGATGCTACTGATTTGATTGTGTATGCAGAGGTTGAAGTAGATCCACTTGTTCCAAAAATGTCTCGAGCTGAGGAACTTTGGGAGCGGTTAGTCCGTGCTGCATTGAGAAGGGAAAGGACTGGTGAAGATGCATATGGACGACCGGTTGGTGGCATTGCTGGAAATGTACCATCTGCACTAGCTAAAAATAGGGATATAGATGAAATTTTGAGAGTTGCTGACGAAATTCAAGACGATGATCCCAGTGTCTCAAGAATATTATGTGAGCATGCATATTCTTTATCTCAAAATTTGGACCCTAACAGTGAAGGCCGAGGTGTGTTACAATTCAAGACTGGTTTGATGTCTGTCATCAAGCAAAAGCTGGCTAAAAGAGAAGCTGGAACCATAGACAGAAGTCAGGACGTAGCTCGGTTACAAGAGTTCTACAAAAGTTATAGAGAAAAGAATAATGTGGATAGATTACGTGAGGAAGAAATGAAGTTGAGGGAATCTGGTGCTTTTAGTCGGGATCTTGGCGAATTCCTTTACGCCACCCATGTGGATAAATACAGGTTGGAGCGCAAAACTGTGAAGAGGAAAAGGGTTTTTGCCACCTTAAAGGTTTTGGGAACAGTACTTGAGCAGCTGAGTGACGAAATTCCGGATGAGCTGAAGCGGGTTATGGACTCAGATTCTGCTTTGACAGAGGATCTGATTGCATACAACATCATCCCCTTAGACACATCTTCTTCAACAAATGCTATTGTTGCTTTACCTGAGGTGCAAGCAGCAATGTCAGCTTTGAAGTATTTCAATGGCTTGCCAGAGTTGCCCAGGGGCTATTTCATTCCTTCATCGAGGAACACTAATGTGTTTGACTTTTTGCAGTGTATTTTTGGTTTTCAGAAAGATAATGTAGCTAATCAGCACGAACACATAGTCCACCTGCTTGCAAACGAGCAATCTCGTCTTAGAATTCCAGATGAAGCTGAACCTAAATTGGATGAAGCTGCTGTACTGGCAGTATTCCTCAAGTCCCTTCAGAATTACATTAGCTGGTGTAATTATTTATGTATTCAGCCAGTTTGGAGCAGTTTGGAGGCTCTCAGTAAAGAGAAGAAAATATTATATGTTTCTTTGTACTTCCTAATATGGGGTGAAGCTGCAAATATCAGGTTTCTAGCAGAATGCTTGTGCTACATATTCCATCATATGGCTAGAGAGATGGATGAAATTTTAAGACAGCAGATTGCACAGCCTGCTAATAGTTGCACTTCTGAGTCTGTGGAGGGTGTCTCGTTTCTTGATAATGTTATCTTTCCTGTATATGATATTGTTTCTGCAGAAGCTGCAAACAATGATAATGGGAAAGCACCACATTCATCCTGGAGAAACTATGATGATTTTAACGAGTATTTCTGGTCACTCCATTGCTTTGAGCTTAGTTGGCCTTGGCGCAAAACTTCTGATTTTTTCCAAAAGCCTCATCCCAGATCAAAGAAAATGCTTATTTCTGGCAGCAGCAGGCATCAGGGAAAAACATCTTTTGTGGAACATCGAACCTTTTTTCATCTTTATCATAGTTTCCACCGATTGTGGATATTTCTTGTGATGATGTTTCAGGGCTTAGCAATCCTTGCATTCAATGATGGACAGTTCAATGCCAAGACTTTGCGAGAGGTTCTTAGTCTTGGACCTACATTTTTTGTGATGAAATTTTTTGAGAGTGTTCTTGATATTTTCATGATGTACGGTGCATATTCAACAACAAGACGCTTAGCCATCTCTAGAATTTTTTTACGTTTTCTTTGGTTCAGCCTGGCTTCAGTTTTCTTAACTTTCATTTATGTGTACGTAAAAGCACTCCAGGAAGAGAGTAAAGCAAATGGAAACTCGGTTGTTTTCAAATTATATGTAATTGTCATAGGGATTTATGCTGGTGTCCAAGTTTTTATTAGTTTCCTCATGCGGATACCAGCATGTCATCGTCTGACAAATCAATGTGATCGTTGGCCTTTAATTCGGTTTGTGAAGTGGTTGCGGCAGGAACGACATTATGTAGGACGGGGAATGTATGAAAGGAGTTCAGATTTCATAAAGTATATGCTGTTTTGGCTTGTTGTTTTGAGTGGAAAATTTGCATTTGCTTACTTTCTTCAGATAAGGCCACTGGTGGACCCGACAAAGGATATTATAAAAGAGAATAATATAGTTTACTCTTGGCACGATTTTGTCTCTAAAAATAATCATAATGCTTTGACAGTTGTTAGTGTGTGGGCTCCTGTGATTGCTATGTATCTTCTAGATATTTATATCTTTTACACAGTTGCATCGGCTGTCTTGGGATTCTTGCTCGGTGCAAGAGATAGACTAGGAGAGATTAGATCATTGGAGGCACTACACAAACTTTTTGAGCAGTTTCCTGGAGCTTTTATGAACACACTTCATGTTCCTCTACCCAACAGGAGTTCTCATCAGTCTTCTGTTCAGGTTGTGGAGAATAGCAAGGTTGATGCTGCCCGGTTTGCCCCCTTTTGGAATGAGATCATAAGAAATCTAAGGGAGGAGGATTATGTAACTAACTTTGAAATGGAGTTGCTTTTAATGCCTAAGAATTCTGGGGATCTTCCGATGATTCAGTGGCCACTCTTTCTACTTTCAAGCAAGATATTTTTGGCTAGGGATATTGCTGTTGAGAGTAAAGATACTCAAGATGAGCTCTGGGATAGGATTTCCCGGGATGATTATATGATGTATGCCGTTCAGGAGTGTTACTATGCTATAAAATTCATTTTGACAGAAATACTAGATGATGTGGGAAGGAAGTGGGTTGAGAGGATATATGAAGATATTTATTCTAGTATCACAAAGAGGAGTATTCATCTGGACATCAATCTAAATAAGTTAGCTCTCGTGATATCAAGAGTAACGGCATTGATGGGGATCCTGAGAGAGACTGAAACACCTGAATTGGAAAGGGGTGCTGTTAGGGCCATTCAGGATCTATATGATGTTATGCGACTTGATGTCCTTTCTGTAAATATGAGGGAAAATTATGACACCTGGAGTTTACTGACAAAGGCTAGGGAGGAAGGGCGTTTGTTTGAGAAGCTGAAATGGCCCAAGAATACAGATTTAAAAATGCAAGTGAAAAGATTGTATTCTTTGCTGACTATCAAAGAATCTGCCTCAAGCATTCCTAAAAATCTTGAGGCCAGGCGAAGGCTACAGTTTTTCACAAACTCCCTTTTTATGAAGATGCCTAGTGCAAAGCCAGTTCGAGAGATGTTATCCTTTAGTGTTTTCACTCCTTATTATTCTGAGATTGTGCTTTATAGCATGTCTGAACTCCTAAAGAAAAATGAAGATGGAATATCAATTCTGTTCTACCTTCAGAAGATATATCCAGATGAATGGAAAAACTTTCTTGCTAGAATTGGCCGTGATGAAAATTCCCTTGAGAGTGAACTTTATGATAATCCTAGTGATATTCTTGAATTGCGATTTTGGGCTTCATATAGGGGGCAAACATTGGCCAGAACAGTTCGGGGTATGATGTATTATAGGAAAGCTCTCATGCTTCAAACCTATTTGGAGAGGACTACAACAGGAGATTTGGAGGCTGCAGTAGGTTGCGATGAAGTAACTGATACACGTGGCTTTGAATTATCCCCTGAGGCACGTGCCCAGGCAGATCTTAAGTTCACTTATGTTGTGACATGTCAAATATATGGTAAACAGAAAGAAGAGCAAAAGCCTGAGGCTGCTGATATTGCTTTACTTATGCAAAAAAATGAAGCTCTACGGGTCGCCTTCATTGATGTTGTTGAAACTTTAAAAGAGGGAAAAGTGAACACAGAATACTACTCAAAGCTGGTGAAAGCTGATATTAATGGGAAAGACAAGGAGATATACTCTGTGAAGTTACCTGGAAATCCCAAATTGGGTGAAGGGAAGCCTGAGAATCAAAATCATGCTGTTATATTTACCCGTGGCAATGCAGTCCAAACAATTGACATGAATCAGGATAACTATTTTGAGGAGGCTTTAAAGATGAGGAACCTTCTTGAGGAATTTCATTCTGATCACGGGCTTCGTCCTCCTACTATTCTTGGTGTTAGAGAACATGTCTTTACTGGAAGTGTCTCATCTTTGGCATCATTTATGTCCAGTCAAGAAACTAGTTTTGTGACTATGGGGCAGCGGGTTTTAGCAAGTCCATTGAAGGTTCGCATGCATTATGGGCATCCTGATGTTTTTGATCGAATTTTTCACATAACCCGTGGTGGTATCAGTAAGGCTTCCCGTGTTATCAATATTAGTGAAGACATCTATTCTGGATTCAATTCAACCTTACGTCAGGGAAATATTACACATCATGAATATATTCAGGTTGGTAAGGGAAGAGATGTTGGGCTCAATCAGATTGCACTATTTGAAGGAAAAGTTTCAGGTGGTAATGGTGAACAAGTTCTCAGCCGTGATGTATACAGACTTGGGCAGCTTTTTGATTTTTTCCGGATGATGTCGTTTTATTTTACAACAGTTGGATACTACTTCTGTACCATGCTAACAGTGCTGACTGTGTATGCCTTTCTATATGGGAAAGCCTATCTGGCACTATCTGGTGTTGGCGAAACCATTGCAGAAAGGGCTGCGATAACTAAGAACACTGCACTGAGTGCTGCTTTGAATACACAATTTCTCTTTCAAATTGGTATGTTCACTGCTGTGCCAATGGTTTTGGGCTCCATTCTTGAGCAAGGTTTCTTGAGGGCCATTGTCAGTTTTGTCACAATGCAGTTTCAGCTATGCACTGTCTTTTTCACATTTTCCTTGGGTACAAGAACACATTATTTTGGCCGGACCATTCTTCATGGTGGTGCAAGGTATCAAGCTACTGGCCGTGGGTTTGTTGTCCGCCATATCAAGTTTTCAGAGAACTACAGACTCTACTCTCGTAGTCATTTTGTTAAAGGGTTGGAGGTGGCACTTTTATTGATAGTTTATCTTGCATATGGCTATAATGAAGGTGGTGCTCTCTCGTATATTCTTCTGAGCATAAGCAGTTGGTTTATGGCTCTATCCTGGTTGTTTGCACCATATTTATTCAACCCATCTGGATTTGAATGGCAGAAGGTGGTGGAAGACTTTCGAGATTGGACAAATTGGCTACTATACAGAGGTGGAATTGGTGTTAAGGGAGAAGAAAGCTGGGAAGCTTGGTGGGAAGAAGAACTGGCTCATATCAGGAGCTTCGGTTCAAGGATAGCTGAAACTATTTTGAGTCTCAGATTTTTCATCTTTCAGTATGGCATTGTGTACAAGCTTGACGTGAAAGGAACTAGCACTTCACTGACGCCTTCATTCATTGTTGCCAGAATCTCTGGCAGCAGTGCACACCTTCTATGCAAATGGTTTGTGGAGTTGAAGTTGAATGGTGCCCTCACTTTTGATGCTCTAGAGCCTCACTGCCATGCCAAGTCCTTCCTTGGCGAGGCTGTCTATCCCCGAAATAATGCCTTTACTTTTCTCTGCCTTGTGGCGGAACCCTCAATAAGCAAGATCTACAAGGTTTATGGACTTTCGTGGGTAGTTCTGGCAGTACTCATAATTCTTTTCAAGGTGTTCACATTCAGCCAGAAGATATCAGTCAATTTCCAGCTTCTTTTGCGCTTTATACAAGGAGTCTCCCTTTTGTTAGCACTGGCTGGTTTGGTTGTAGCAGTTCTATTGACTGAGCTGTCTTTACCTGACGTATTTGCTTCTATGTTGGCTTTCATTCCTACTGGATGGGGAATTCTGTCTATTGCTGCTGCATGGAAGCCTCTGATGAAGAAGCTAGGACTATGGAAATCTGTTCGATCAATTGCTCGACTGTATGACGCTGGTATGGGAATGCTCATCTTTGTACCCATTGCATTCTTTTCGTGGTTCCCTTTTGTATCAACATTCCAAACTCGCCTCATGTTTAACCAGGCTTTTAGCCGAGGGTTAGAAATTTCTCTAATTCTAGCTGGGAACAATCCAAATACTGGGATATGA 6219 0.4067 FVAFSSFLLFHSFLFLQEKINVEMEALRSRVSSFVSIKVKFRNRIISYVLLNLEENLARCGLFTDATDLIVYAEVEVDPLVPKMSRAEELWERLVRAALRRERTGEDAYGRPVGGIAGNVPSALAKNRDIDEILRVADEIQDDDPSVSRILCEHAYSLSQNLDPNSEGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKREAGTIDRSQDVARLQEFYKSYREKNNVDRLREEEMKLRESGAFSRDLGEFLYATHVDKYRLERKTVKRKRVFATLKVLGTVLEQLSDEIPDELKRVMDSDSALTEDLIAYNIIPLDTSSSTNAIVALPEVQAAMSALKYFNGLPELPRGYFIPSSRNTNVFDFLQCIFGFQKDNVANQHEHIVHLLANEQSRLRIPDEAEPKLDEAAVLAVFLKSLQNYISWCNYLCIQPVWSSLEALSKEKKILYVSLYFLIWGEAANIRFLAECLCYIFHHMAREMDEILRQQIAQPANSCTSESVEGVSFLDNVIFPVYDIVSAEAANNDNGKAPHSSWRNYDDFNEYFWSLHCFELSWPWRKTSDFFQKPHPRSKKMLISGSSRHQGKTSFVEHRTFFHLYHSFHRLWIFLVMMFQGLAILAFNDGQFNAKTLREVLSLGPTFFVMKFFESVLDIFMMYGAYSTTRRLAISRIFLRFLWFSLASVFLTFIYVYVKALQEESKANGNSVVFKLYVIVIGIYAGVQVFISFLMRIPACHRLTNQCDRWPLIRFVKWLRQERHYVGRGMYERSSDFIKYMLFWLVVLSGKFAFAYFLQIRPLVDPTKDIIKENNIVYSWHDFVSKNNHNALTVVSVWAPVIAMYLLDIYIFYTVASAVLGFLLGARDRLGEIRSLEALHKLFEQFPGAFMNTLHVPLPNRSSHQSSVQVVENSKVDAARFAPFWNEIIRNLREEDYVTNFEMELLLMPKNSGDLPMIQWPLFLLSSKIFLARDIAVESKDTQDELWDRISRDDYMMYAVQECYYAIKFILTEILDDVGRKWVERIYEDIYSSITKRSIHLDINLNKLALVISRVTALMGILRETETPELERGAVRAIQDLYDVMRLDVLSVNMRENYDTWSLLTKAREEGRLFEKLKWPKNTDLKMQVKRLYSLLTIKESASSIPKNLEARRRLQFFTNSLFMKMPSAKPVREMLSFSVFTPYYSEIVLYSMSELLKKNEDGISILFYLQKIYPDEWKNFLARIGRDENSLESELYDNPSDILELRFWASYRGQTLARTVRGMMYYRKALMLQTYLERTTTGDLEAAVGCDEVTDTRGFELSPEARAQADLKFTYVVTCQIYGKQKEEQKPEAADIALLMQKNEALRVAFIDVVETLKEGKVNTEYYSKLVKADINGKDKEIYSVKLPGNPKLGEGKPENQNHAVIFTRGNAVQTIDMNQDNYFEEALKMRNLLEEFHSDHGLRPPTILGVREHVFTGSVSSLASFMSSQETSFVTMGQRVLASPLKVRMHYGHPDVFDRIFHITRGGISKASRVINISEDIYSGFNSTLRQGNITHHEYIQVGKGRDVGLNQIALFEGKVSGGNGEQVLSRDVYRLGQLFDFFRMMSFYFTTVGYYFCTMLTVLTVYAFLYGKAYLALSGVGETIAERAAITKNTALSAALNTQFLFQIGMFTAVPMVLGSILEQGFLRAIVSFVTMQFQLCTVFFTFSLGTRTHYFGRTILHGGARYQATGRGFVVRHIKFSENYRLYSRSHFVKGLEVALLLIVYLAYGYNEGGALSYILLSISSWFMALSWLFAPYLFNPSGFEWQKVVEDFRDWTNWLLYRGGIGVKGEESWEAWWEEELAHIRSFGSRIAETILSLRFFIFQYGIVYKLDVKGTSTSLTPSFIVARISGSSAHLLCKWFVELKLNGALTFDALEPHCHAKSFLGEAVYPRNNAFTFLCLVAEPSISKIYKVYGLSWVVLAVLIILFKVFTFSQKISVNFQLLLRFIQGVSLLLALAGLVVAVLLTELSLPDVFASMLAFIPTGWGILSIAAAWKPLMKKLGLWKSVRSIARLYDAGMGMLIFVPIAFFSWFPFVSTFQTRLMFNQAFSRGLEISLILAGNNPNTGI 2072
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vimu2g00125 2072 SMART FKS1_dom1_2 430 544 IPR026899 -
Vimu2g00125 2072 PANTHER LYST-INTERACTING PROTEIN LIP5 DOPAMINE RESPONSIVE PROTEIN DRG-1 244 2065 - -
Vimu2g00125 2072 Pfam 1,3-beta-glucan synthase component 1124 1813 IPR003440 GO:0000148|GO:0003843|GO:0006075|GO:0016020
Vimu2g00125 2072 Gene3D - 117 281 IPR023175 -
Vimu2g00125 2072 Pfam 1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1 432 541 IPR026899 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vimu2g00125 Vimu-Chr2 736932 770993 Dispersed/Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vimu2g00125 1915 2072 Cell Wall Biosynthesis AT3G07160 77.215 6.29e-72 266
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vimu2g00125 K11000 - gmx:100811473 3266.09