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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vian6g00031 ATGGGATACGCTGTGTTCTTGAACGCTTCTTTCCTCCTTGTGACGTGTTCTTTTATGATTATTCATTTCCACACCCCGGAAACACAAGTTGTGGCAGTGACCAAAATTTCTGGCTTTGGTAGCAGCAATGAGCAAGAATGTGAGAGCTTAGCCAGCCTCGATGACTTCAAAGCCAAGTGCCTGTACCTGAAATCCAATCATCCTTGTGCTCCTCAGGGCTATATTGATTATCTATACCTTTTCTATTGCCAAATTGGGAGTTACCCTTCATTAGGTTACACCCTTTTATTTCTTTGGCTCCTAATTCTGTTTTACTTATTGGCTAATACAACTTCTCAATACTTTTGTCCCTCCCTTGAAAGCATGTCCAAATTACTAAGGTTGTCCCCCACAATTGCTGGAGTCACCCTCCTCTCACTTGGCAATGGTGCCTGTGACGTTTTCTCTAGCCTTGTCTCTTTCCAGGGAAGTGGGACACGCAGCATAGGTTTTAACACGGTTCTTGGGGGTGTTTCTTTTGTGTCCTGTGTTGTGGTGGGGACTGTGAGTATCGCAGTACGTCAAAAGAGGGTTCAAATTGATAAGTCCGCGTTTCTGAGAGATGTTTATTCTCTCCTTTTAGTTCTTTTGACCTTGTTTGGTATTTTGATCTTTGGCAAGATCAATGTTGTTGGAGCAGTTGCTTTTACTATGATGTATGCTGTGTATGTGGCTATTGCTTATGTTTCTTCTACCAGATGGAAGGAAGGTGTTGCAGGTGATGGAGGTGGTGATGTTGGTTGCGGAAATGGTTTGAATTTGCCGCTTCTCGTTGGTGTGAAGAAAGAAGCAATTGATTGTGCGGAAAATGGTGCTGAAGAATATGGATTGAATGTGGATAAGTATTGTTGTTGTATGAGATATTTAATGTGTCGAGTGCCACTTTATGTTCTGGAGTTGCCCCTTTACTTGCCTAGGAGATTGACAATTCCTGTTGTGAGTGAAGAGAGATGGTCAAAGGTGTATGCAGTTTTTTCTGTCATACTAGCACCACTTCTAATGTCTGTCCTGTGGAGGAGTACTTATAAGAATGGAAACAGTTTCTTCAGCAAGAACCTTATTGTTTATGGAATTGGAGTTTTGGTGGGAAGTATACTTGGAGTAACTGCATATTTGACAACCAAAAAGGTAGGGCCACCAAAGAAGTTCTTATTTGGTTGGCTTGCTGGTGGGTTTGTGATGAGTGTGACATGGAGTTATATAATAGCTCAAGAGTTGGTGGGGTTGCTTGTTTCAATTGGGTACATATGTGGAATAAGTCCTTCTATACTAGGGTTAACAGTTATGGCTTGGGGGAATTCAATTGGGGATTTGATGACAAATTTAACTATGGCTTTAAATGGAGGAGCAGAGGGTGCTCAAGTAGCAATATCAGGTTGCTATGCTGCTCCCATCTTCAATATCCTTATTGGTTTGGGTTTGTCTCTTGTCACTACTACATGGTCAGAGTACCCTCAACATGTTGTGATTCCTAGAGACCCTTATCTTTGGGAGACAATGGTGTTTTTGGTGGTTGGATTAGTTTGGGCACTTTTGGTTTTGATAAAAAGAGATATGAAGCTTGACAGACTCTTAGGAGGAGGGCTTTTGTTTCTTTACTTTCTTTCTCTGTTTTCAAGACTGATTCATGCAGAAGCTCACTCCAATACTCTAATTTTATGA 1701 0.4145 MGYAVFLNASFLLVTCSFMIIHFHTPETQVVAVTKISGFGSSNEQECESLASLDDFKAKCLYLKSNHPCAPQGYIDYLYLFYCQIGSYPSLGYTLLFLWLLILFYLLANTTSQYFCPSLESMSKLLRLSPTIAGVTLLSLGNGACDVFSSLVSFQGSGTRSIGFNTVLGGVSFVSCVVVGTVSIAVRQKRVQIDKSAFLRDVYSLLLVLLTLFGILIFGKINVVGAVAFTMMYAVYVAIAYVSSTRWKEGVAGDGGGDVGCGNGLNLPLLVGVKKEAIDCAENGAEEYGLNVDKYCCCMRYLMCRVPLYVLELPLYLPRRLTIPVVSEERWSKVYAVFSVILAPLLMSVLWRSTYKNGNSFFSKNLIVYGIGVLVGSILGVTAYLTTKKVGPPKKFLFGWLAGGFVMSVTWSYIIAQELVGLLVSIGYICGISPSILGLTVMAWGNSIGDLMTNLTMALNGGAEGAQVAISGCYAAPIFNILIGLGLSLVTTTWSEYPQHVVIPRDPYLWETMVFLVVGLVWALLVLIKRDMKLDRLLGGGLLFLYFLSLFSRLIHAEAHSNTLIL 566
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vian6g00031 566 Gene3D - 128 254 IPR044880 -
Vian6g00031 566 Gene3D - 334 553 IPR044880 -
Vian6g00031 566 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 401 551 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Vian6g00031 566 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 97 241 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Vian6g00031 566 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 304 556 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vian6g00031 Vian-Chr6 1066165 1067865 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vian6g00031 22 550 Antiporters AT5G17860 47.664 3.96e-157 458
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vian6g00031 K13754 - gmx:100813848 754.592