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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vian5g00487 ATGAACTTAAATACCATTCTAAACGTGAACAAGAAAGCTGCAAGTATTGCAATTGCTGGAATCGTCTTTCCCATACTCGTTGCACCATGCTTGTATGCTTTGTTTCGAAAAGTTTATGGACATAATATGATGTTTCCCCTTGAGGAAAATACAAATAATGCTTATATACTTTGGACTTTAATTCTCATTGTTACAAGTTTTCCTGTGGTAGCACACACACTTTCTGAGCTTAAGCTCATTTATACTGGTCTTGGCAAAGAGGCTTTAACAGCTACCATGATAGGTGACACCTATGGTTGGATTCTTTTCACTTTATTTGTTCCCTTTTCAATTAATGGTAAAGAAGCCATCTACACCGTGTTATGCACGATAATATTCATTGTTGTGTGCATATTTGTGGTACGTCAACTCATTCAATGGTTTATTGATCGCAAGGCAAACAAAGATGAATGGAATGATAACCAATTGCTCTTTATAATCATGGGGGTTTTAGCTTGTTCATGTATTTCAGATTTTCTTGGTGCACATGCCATTGTTGGGGCTTTTATTTTTGGATTAATTTTACCTCATGGAAAATTTGCTGAATTGGTCATGTCAATTTCAGATGATTATGGTTTGACCTTGGACATGATTTTGAATAATAAAGGTGCCATGGCATTAATAATGCTGAATATTGCTTGGGATAGAACGATATTTTCTTTACCTACCTATGCCGTTATAACTTCTGCTGTTCTTTTGAGTACCATAGTTGTGTCTCCCGTCATCAATGCCATCTACAAAACAAGACAAATATTTGAACAAAACAAGCTAAAGACCATACAAAAACTAAGACTTAATGCAGAGCTTCGATTTATAGCGTGTGTTCACAATACTCGCCAAGCTACAAGCATGATTAGCATAATTGAATGTTTTAACCCTATGAGAGTTTCCCCTGTGCATGTATTTGCCTTGTACCTTGTTGAACTTACTGGACGTGTTGCTGCCTTAGTTGTTACACATATAGGGAAGCCTAGTAGCCAACTTAGAGAACAAAACCTGACTAAGTCACAAGAAGAGTTAGAAAGCATTCACAATACATTTGATGCACTTGGAGAGGCATATAATGCTATTAGAGTTGAGACCTTAAATGTGGTGTCAGCATATACAACTATTCATGAGGACATATACCACTTAGCATATGAGAAACGCACAACCTTAATTCTTCTTCCATTTCACAAACAATTAACTTTAGAAGGTACTCTAGAAGTAACCAGTGTTGTATATAAAGATATAAATCAAAATGTAATGAAAGGTGCTCCCTGCTCCGTGGGAATATTTGTTGATCGTGATTTTGGTTTAGTTCCCAAAATGAACCTTCATATTTGTGTGGTCTTTGTTGGGGGTCCTGATGATCGTGAAGCCTTAGCCATTGCATGGAGGATGGCAGGACGTTCAGGAACACAACTCTCACTGGTTCGAATTCTTCTATTGGGTGAAGCGGCAGAAATAGATGCTTCAGTTCACAATGAATCACAAGGGATATTATCTACGATAATAGATACGGACAAGCAAAAAGAGTTAGATGAAGAGTATATAAGCGCATTTAGACTTATAACAGTTAACAATAGCGATACAATATCCTACTCAGAGATTGATGTTTATAGTGATAAAGATATCCCTGTAGTCCTCAAAGAGATAGAAAAAATTGGTTGTGATATTTACATAGTTGGACAAGGGAATTGTAGGAACTCTAAGGTCTTCTCAAATTTGTTTGAGGGGTGTGAGTGCTTAGAACTTGGAGTTATTGGGGATATTTTGGTGTCAAACAATTTTGGTTCACGCTCGTCTGTGCTAGTTGTTCAACAATATGGATATGGAGGAATGGTTTATGGAAATAATCTTAACCATAAGGCCACCGACAAAGGCACATTTGAATCTATTGTTTGA 1926 0.3681 MNLNTILNVNKKAASIAIAGIVFPILVAPCLYALFRKVYGHNMMFPLEENTNNAYILWTLILIVTSFPVVAHTLSELKLIYTGLGKEALTATMIGDTYGWILFTLFVPFSINGKEAIYTVLCTIIFIVVCIFVVRQLIQWFIDRKANKDEWNDNQLLFIIMGVLACSCISDFLGAHAIVGAFIFGLILPHGKFAELVMSISDDYGLTLDMILNNKGAMALIMLNIAWDRTIFSLPTYAVITSAVLLSTIVVSPVINAIYKTRQIFEQNKLKTIQKLRLNAELRFIACVHNTRQATSMISIIECFNPMRVSPVHVFALYLVELTGRVAALVVTHIGKPSSQLREQNLTKSQEELESIHNTFDALGEAYNAIRVETLNVVSAYTTIHEDIYHLAYEKRTTLILLPFHKQLTLEGTLEVTSVVYKDINQNVMKGAPCSVGIFVDRDFGLVPKMNLHICVVFVGGPDDREALAIAWRMAGRSGTQLSLVRILLLGEAAEIDASVHNESQGILSTIIDTDKQKELDEEYISAFRLITVNNSDTISYSEIDVYSDKDIPVVLKEIEKIGCDIYIVGQGNCRNSKVFSNLFEGCECLELGVIGDILVSNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMVYGNNLNHKATDKGTFESIV 641
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vian5g00487 641 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 205 616 - -
Vian5g00487 641 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 1 195 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Vian5g00487 641 Gene3D - 1 204 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vian5g00487 Vian-Chr5 14003534 14008229 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vian5g00487 1 616 Antiporter Super Family AT2G13620 31.287 1.60e-111 352
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vian5g00487 - - var:108320251 843.958