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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vian3g00380 ATGGAGAAGTTGTTGGTGGGAATTAGTGTCTGCATAATGCTACTGTTGCTCAACACAAACAATAACACTGTTCAGGGCTTTCAGCACCAAAAACAGCAACACAGTTTCCGTGACTTGCTCATTCTTCCACCCGATTACGTTTGCTCCCAATATACTGTTGAAACGAAGGATGGCTTGTTGTTAGGTCTTGAGAGCGTGTTTTCTTCTTCTGTTGGGGTTGTGAAGGATGGTGAAGCTCCCCTTCTGCTGCTTCTGCTTCTGCGTGGCTTATTCATGGATTTAGCCATGCATGATTTTGCAGAAATGACCAATTACATTAATTCAGTAAGAAACACAAAGCTATTTGTACTCCAGCATTCACAGGGTAAAATGTCTTTTGCTGTTGCCTTCACTCAACTGGAGATACCAGAAAACTTTGTTGCAGCATCCAAGGACGTTCAGAAACTCAACCACAGAAGAACCAAATTAAGAGGTGCCAGAGTTTCTACAGTTTCTTCGTTTCAGTCTCAACCAAGTGCATGGGAAGGGTTTCAGACCGTTAATGCAAGAATAATGGAAATGGAGCACTTTAGTAATGTTACAAAGTTGCTGAATCTGCTTTTTATACGCCTAATGCTCACACTGCACTGCACTTTGAAAATGGATCTTGCTATGGCATTGGTATTTGTAATAGGCTATGTAGTCATCATATTTGAAGAATATCTAGCCTTCAATAAAAGTGGAGTGGGACTGTTGATGGCCGTAAGCTTATGGGTGATACGCAGTATAGGGGCTCCATCAACTGATATAGAAGTTTCAGAGTTAACACATGCATCTGCACAAGTCAGTGAAATAGTATTTTTCTTGCTTGCTGCAATGACCATTGTTGAGATAATTGACGCTCATCGAGGATTTAAGCTTGTTACGGACAATATAACAACCCAAAATCCACGCCTTCTCCTATGGGTGTTCAGTTCTGGACAGCTTGGCATCTACCGTAGTTATGATTTCTCTATTGCGAAAATTGTTACGTCTATCAGAGTTACGGAACATAGACATTCAGATGTGTCTGTAAATCTTTTAAGTTTTCTTTTTCCAGCATTTTCCGACTATTTGGAGGTTCAATTGGTACACTTCATCATATATGAAGAACTTGGTTTGGATTCTTTTGACAGGATATTGGGAGCTGTTGTTGTAATAGCAGCAAATGCTGGTGGTGCATGGAGTCCTATTGGTGCTGTTACCACTACTATGCTGTGGATACACGGATTTGTTTATACCTTCAGTCATTTCTCTGGCTGTTCCTCTAGTTCTGATGTCCCTGACAAGGTAGACACTCTTCTTCATACACTGCAAAAGTTAGCCTCAAAAGCTGAAATACTGATATTTAGCTTAACATATAGAATATGGATAACGTTGGTTCTTAACTTTGTCTTCACCAGTATAGTTAATGATGGAAAAGGACAAAACTCTCTCGGTGTATTTTCCTCTGAGGAGAGTGCTCCACAAGGACTGCTTGTTTTCTCATTGAGTTTAGGAGCTTTGCTTTTTGTCCCAGTGTTGAGGGCCCTCACAGGTTTACCTCCCTACATGGGAATGCTTCTCGGACTTGGCATGCTTTGGATCGTCACCGATGTTATCCATTATGGTGATTCTGAGAGGCAAAAGCTAAAAGTGCCACATGCTCTGTCAAGAATAGACACTCAGGGAGCACTGTTTTTCCTGGGAATTCTATTATCCGTTAGCAGCCTGGAGGCAGCAGGGATTCTGCAGGAAATAGCAAATTACTTTGATGCACATGTGCCGAGTAGTGAACTGATTGCAAGTGCTATTGGACTCATATCTGCTGTAATAGACAATGTTCCATTGGTTGCTGCAACAATGGGAATGTATGATGTCTCTGCTTTCCCTCAAGATTCTGAATTCTGGCAATTGATTGCATTATGTGCTAGTACTGGTGGATCCATATTAATTGCTGGTTCAGCTGCTGGAGTTGCGTTCATGGGGATGGAAAAGGTGAACTTCTGTTGGTACTTGCGGAAGGTTACTGGCTTTGCCTTAGCAGGTTATGCTGCTGGTATTGCTGCCTATTTAGTGCTTCATAAATTAAGAATTTGA 2097 0.4149 MEKLLVGISVCIMLLLLNTNNNTVQGFQHQKQQHSFRDLLILPPDYVCSQYTVETKDGLLLGLESVFSSSVGVVKDGEAPLLLLLLLRGLFMDLAMHDFAEMTNYINSVRNTKLFVLQHSQGKMSFAVAFTQLEIPENFVAASKDVQKLNHRRTKLRGARVSTVSSFQSQPSAWEGFQTVNARIMEMEHFSNVTKLLNLLFIRLMLTLHCTLKMDLAMALVFVIGYVVIIFEEYLAFNKSGVGLLMAVSLWVIRSIGAPSTDIEVSELTHASAQVSEIVFFLLAAMTIVEIIDAHRGFKLVTDNITTQNPRLLLWVFSSGQLGIYRSYDFSIAKIVTSIRVTEHRHSDVSVNLLSFLFPAFSDYLEVQLVHFIIYEELGLDSFDRILGAVVVIAANAGGAWSPIGAVTTTMLWIHGFVYTFSHFSGCSSSSDVPDKVDTLLHTLQKLASKAEILIFSLTYRIWITLVLNFVFTSIVNDGKGQNSLGVFSSEESAPQGLLVFSLSLGALLFVPVLRALTGLPPYMGMLLGLGMLWIVTDVIHYGDSERQKLKVPHALSRIDTQGALFFLGILLSVSSLEAAGILQEIANYFDAHVPSSELIASAIGLISAVIDNVPLVAATMGMYDVSAFPQDSEFWQLIALCASTGGSILIAGSAAGVAFMGMEKVNFCWYLRKVTGFALAGYAAGIAAYLVLHKLRI 698
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vian3g00380 698 PANTHER SODIUM/PROTON ANTIPORTER 1-RELATED 334 697 IPR045016 GO:0006814|GO:0015297
Vian3g00380 698 Pfam Citrate transporter 226 643 IPR004680 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vian3g00380 Vian-Chr3 3620004 3626599 Dispersed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vian3g00380 215 697 Antiporters AT3G19490 60.537 0.0 526
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vian3g00380 - - vra:106771718 724.161