Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vian2g02693 ATGACAGACACACTACCTGCATGTTACAACGTATTTATAGTTAATCGTAATCAATTTTGGAAAACTGATAAAGTCTTGCAAACAGAGCTTCCTATTCTGGCCATTCAAATTGCTTTTGTTGCTGTGTTATCTCGTCTTTTTTCCATAATTTACAAACCTCTACATCAAACTCGTCTCATTTCACAAATATCTGTTGGTTTCCTACTAACACCGCCATTACTTGGAAGATTCACGCCCATTTTTGAGTTCATTTTTCCAGTAAACGGGATTGTCAATGTTGAGGTTCTTTCCCATATTGGTCTCATTTATTATGCATTCCTTAGTGGATTGGAGATGAACTTAAATACCATTTTACACATGAAAAAGAAACCTGCAAGCATCACTATTGTTGGGATCATCTTTCCCATGCTTATTGCACCATGCTTATATGCTTTGTTTCGAAAAGTTTATGGGCATATTATGATGTTTCCCCTTGAGGAAAGTACAGATAATACTTATATACTTTGGACTTTAATTCTCACTGTTACAAGTTTTCCTGTGGTAGCACACACACTTTCTGAGCTTAAGCTCCTTTATACTGGTCTTGGTAAAGCGGCTTTAACAGCAGCCATGATTGGTGACACCTATGGTTGGATTCTTTTCACTTTATTTGTTCCATTTTCAACTAATGGTAAAGGAGCTATCTACACTGTGCCATGCACGATAATCTTCATTGTTGTGTGCATCTTTGTGGTACGTCCAATCATTCAATGGTTTATTGATCGTAAGGCAGACAAAGATGAATGGAATGATAATCAATTGCTTTTTATAATCATGGGGGTTTTAGCTTGCTCATGTATTTCAGATTTTCTTGGTGCACATGCCATTGTTGGAGCTTTTGTTTTTGGATTAATTTTACCTCATGGAAGATTTGCTGAATTGGTCATGTCAATTTCAGATGATTTTGTTGGAGGATTTTTAGTTCCCCTCTTCTTTACTGGAACTGGAATGAGACTTATGTTGGCCTCAATTTTTTCCCAACAAAGTTGGCCCTTTGTAGTTGTGATTATACTCTTATTGTGTGCTCTAAAGATTTTAAGCACTTTAATTGTCACCTTGTTCTTCGGTATGCGTATTCGAGATGGTTTAACCTTGGGCTTAATTTTGAATAATAAAGGTGCCATGGCATTAATAATGTTGAACATTGCTTGGGATAGAATGATATTTTCAGTACCTACTTATGCCGTTATAACTTCTGCTGTTCTTCTGATGACCATAGTTGTGTCTCCCGTCATCAATGTTGTCTACAAACCAAGACAAAGATTTGAACAAAACAAGCTAAAGACCATACAAAAACTAAGAGTTGATGCAGAACTTCGAATTATATCATGTGTTCACAATACTCGCCAAGCTACAAGCATGATTAGCATAGTTGAGTGTTTTAATGCCATGAGAGTTTCCCCTATCCATGTTTTTGCCTTGTACCTTGTTGAACTTACTGGACGAACTGCTGCCCTAGTTGCTGCACATATAGGGAAGCCTAGCAGCCAACCTGGAGAACAAAACCTAACTAGGTCACAGGAAGAGTTAGAAAGCATTCACAATGCATTTGATGCCCTTGGAGAGGCATATGACGCTATTAGAGTTGAGACCTTAAATGTGGTGTCAACATATACAACTATTCATGAGGACATATACCACTCAGCAGATGAGAAACACACAAGCTTAATTCTTCTTCCATTTCATAAACAATTAACTTTAGAAGGTACTCTAGAAGTAACAAGTGTTGTATACAAAGATATAAACCAAAATGTAATGCAAGGTGCTCCATGCTCTGTGGGAATATTTGTTGATCGTGATTTTGGGTTAGTTCCTAAAAGGAATCTTCATGTTCGTGTGGTCTTTGTTGGGGGCCCTGATGATCGTGAAGCTTTGGCCATTGCATGGAGGATGGCAGGATGTTCAGGAACACAACTCTCAGTGGTTCGAATTCTTCTATTGGGTGAAGCGGCAGAAGCAGATGCATCGGTTCATGATGAAGCACAAGGGATATTATCTGCAGTAATAGATACAGAGAAGCAAAAAGAGTTAGATGATGAGTATATAAGCACATTCAGACTTACCGGGGTTCACAATAACGATTTAATATCCTACTCAGAGATTGATGTTCGTAGTGGTGAAGATATTCCTGCAATCCTAAATGAGATAGAAAAATTTGGTTGTGATCTTTACATAGTTGGACAAGGAAATTGTAGGAACTCTAAGGTCTTCTCAAATTTGCTGGAGTGGTGTGAGTGCTTAGAACTTGGAGTTATAGGAGACATTTTAGTGTCAAACAATTTTGGTTCACGTTCGTCTGTGCTAGTTGTTCAACAATACGGATATGGAGGAATGAATTTTAGAAATAATCTTAACCAGAAAGACACGAACAATAACAAGTTTGAATCTGTTGTTTGA 2436 0.376 MTDTLPACYNVFIVNRNQFWKTDKVLQTELPILAIQIAFVAVLSRLFSIIYKPLHQTRLISQISVGFLLTPPLLGRFTPIFEFIFPVNGIVNVEVLSHIGLIYYAFLSGLEMNLNTILHMKKKPASITIVGIIFPMLIAPCLYALFRKVYGHIMMFPLEESTDNTYILWTLILTVTSFPVVAHTLSELKLLYTGLGKAALTAAMIGDTYGWILFTLFVPFSTNGKGAIYTVPCTIIFIVVCIFVVRPIIQWFIDRKADKDEWNDNQLLFIIMGVLACSCISDFLGAHAIVGAFVFGLILPHGRFAELVMSISDDFVGGFLVPLFFTGTGMRLMLASIFSQQSWPFVVVIILLLCALKILSTLIVTLFFGMRIRDGLTLGLILNNKGAMALIMLNIAWDRMIFSVPTYAVITSAVLLMTIVVSPVINVVYKPRQRFEQNKLKTIQKLRVDAELRIISCVHNTRQATSMISIVECFNAMRVSPIHVFALYLVELTGRTAALVAAHIGKPSSQPGEQNLTRSQEELESIHNAFDALGEAYDAIRVETLNVVSTYTTIHEDIYHSADEKHTSLILLPFHKQLTLEGTLEVTSVVYKDINQNVMQGAPCSVGIFVDRDFGLVPKRNLHVRVVFVGGPDDREALAIAWRMAGCSGTQLSVVRILLLGEAAEADASVHDEAQGILSAVIDTEKQKELDDEYISTFRLTGVHNNDLISYSEIDVRSGEDIPAILNEIEKFGCDLYIVGQGNCRNSKVFSNLLEWCECLELGVIGDILVSNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMNFRNNLNQKDTNNNKFESVV 811
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vian2g02693 811 CDD USP_Like 630 741 - -
Vian2g02693 811 Gene3D - 32 439 IPR038770 -
Vian2g02693 811 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 38 426 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Vian2g02693 811 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 8 787 - -
Vian2g02693 811 Gene3D - 482 747 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Vian2g02693 Vian-Chr2 47815931 47818568 Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Vian2g02693 2 786 Antiporter Super Family AT2G13620 36.842 6.86e-180 535
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vian2g02693 - - gmx:100800072 1280.39
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Vian2g02693 2 47815931 47818568 Vian2g02693 2 47815931 47818568 ECH