Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tsu08g00678 atgaaggCTCTCAATGGGTTATTGGGATTAAGAAGCAAAAAAATTCATGGTGTTTTCAATGGTTTGTGTGTTATggttgtgtttttctttttttacaataggCAAGATATAATTCGTAATCCACTTCTTAGACAATCTGCTTATTTGGTTAATCATCATGGTTTATCTCAAAATTCGATTTTGAAAGATGGGGTTTCTGTGATTCACCGTAGAATGGGTGAGATTAGTACTAACACTTCACGTGTAGATGAGGACAAAGATTTGGTTGTTAATAAGCCTGGATTGTGTTTTGGATTGCTTCAACATGATGGTTATGGTAGCTCTTGTGAATTCTTAAAGGTTAATCCTCAGTGCACTTCTGAAGGGTATATTGATTACTTGAGGTTTTTCTATTgtaaatgtcaaaattttagGGTTCTTGGTTATCTAGTATTGGGTGTTTGGCTTGCTGCTTTGTTTTATCTCTTGGGGAACACTGCTGCGGATTATTTTTGTCCTTCGCTTGAGCATCTCTCAACGCTGTTGAAATTGCCTCCGACTGTTGCTGGCGTTGTGTTGCTTCCACTTGGGAATGGGGCACCTGATGTGTTTGCTAGTATAGCTTCGTTTGTTGGGACTGATACCGGTGAAGTTGGTCTTAACAGTGTGTTAGGCGGTGCTCTTTTTGTTACTACTGTTGTTGTTGGAACTGTTTCTCTTTGTGTTGCAGAGAGGGAGGTTCAGATTGATCGACGGTGCTTTATAAGGGATCTGTGTTTCTTTCTGTTCACTCTTTTTTCAttgcttttgattttgtttgttggTAAGATTGGTATCGGGGCAGCAATTGCGTTTGTATCGATTTATGTTGTTTATGCATTCATTGTTGCTGCCAATGAGATATTGCGGAAACATGCACGGAGGTTGAAATTGGATGCCGTGACACCTATGCTTCCTGTCCAAGGAAGTGTATTCTCGATTGGTTCCGAAGAGGATACTAATATATATAGCTCTTTGCTTGACATTGAGAGTGATCCTCCCCGTCTCCCTCCTTCCTTGCCTCAATGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATATATTCAAACCAGACAAGTAAAATCAGTTTTACAGATGAAAGGCCTCCTTGGGGATGGAGTGATGGATCCACGGAAAACACCAGGGCTTCGTTCACTGTATCAAAGCTTTTTTTACTCATGGAGTTGCCACTTACAATTCCTAGACGCTTAACAATTCCAATGGTTCACGAGGAAGTATGGTCGAAGCCGATTGGTATAGCCAGTGCTACATTGGCTCCTATTCTCTTGGCCTTTTTGTGGAGCACCCAAGATAATGCGAGTTCTACAAGTACTATACTTGCTTATTGTTTTGGTGTTTCTTTTGGATGCACCCTTGGTGTTCTTGCATACAAATACACAGAATCTGATCGCCCGCCATCTCAGTATTTGATTCCCTGGGTTCTTGGAGGATTTGTTATGAGCATAGTGTGGTTCTACATAATAGCAAATGAACTTGTGGCTCTGTTAGTAGCATTCGGTGTAATTTTTGGAATTAATCCATCAATTCTGGGATTAACTGTATTAGCATGGGGAAATTCAATGGGAGATTTAATGTCAAATATTGCATTGGCATTGGATGGACAAGATGGAGTTCAGATAGCTTTATCTGGATGCTATGCAGGTCCTATGTTCAACACACTTGTTGGTTTGGGGATCTCATTGCTGCTTGGTGCATTGTCGAAGAAACCTGCTTCTTACGTGGTGCCTGAAGACGGGAGCTTATTTTACACCATGGGATTTCTTATCACAGGACTTATATGGTCACTTGTTATTTTACCGCGCAACAACATGTATCCTAGCAAAACATTAGGAATGGGTCTCATCGCCCTTTACAtgatatttctttctttcagaGTGTGTACTTCTATGGGAATAATAACAATGGCTGGTTTACGTTAG 1950 0.3908 MKALNGLLGLRSKKIHGVFNGLCVMVVFFFFYNRQDIIRNPLLRQSAYLVNHHGLSQNSILKDGVSVIHRRMGEISTNTSRVDEDKDLVVNKPGLCFGLLQHDGYGSSCEFLKVNPQCTSEGYIDYLRFFYCKCQNFRVLGYLVLGVWLAALFYLLGNTAADYFCPSLEHLSTLLKLPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFASIASFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTTVVVGTVSLCVAEREVQIDRRCFIRDLCFFLFTLFSLLLILFVGKIGIGAAIAFVSIYVVYAFIVAANEILRKHARRLKLDAVTPMLPVQGSVFSIGSEEDTNIYSSLLDIESDPPRLPPSLPQWMWSSNVAIYSNQTSKISFTDERPPWGWSDGSTENTRASFTVSKLFLLMELPLTIPRRLTIPMVHEEVWSKPIGIASATLAPILLAFLWSTQDNASSTSTILAYCFGVSFGCTLGVLAYKYTESDRPPSQYLIPWVLGGFVMSIVWFYIIANELVALLVAFGVIFGINPSILGLTVLAWGNSMGDLMSNIALALDGQDGVQIALSGCYAGPMFNTLVGLGISLLLGALSKKPASYVVPEDGSLFYTMGFLITGLIWSLVILPRNNMYPSKTLGMGLIALYMIFLSFRVCTSMGIITMAGLR 649
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tsu08g00678 649 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 147 289 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tsu08g00678 649 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 484 635 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tsu08g00678 649 Gene3D - 417 637 IPR044880 -
Tsu08g00678 649 Gene3D - 177 310 IPR044880 -
Tsu08g00678 649 PANTHER CATION/CALCIUM EXCHANGER 4 11 645 - -
Tsu08g00678 649 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 11 645 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tsu08g00678 Tsu-Chr8 7260217 7262778 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tsu08g00678 73 643 Antiporters AT5G17860 42.234 6.78e-142 422
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tsu08g00678 K13754 - gmx:100796101 1050.43
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tsu08g00678 08 7260217 7262778 Tsu08g00678 08 7260217 7262778 ECH