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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tsu05g03611 ATGAATCAAACGTTAGATGCAAagagtgtaaaatattttacagaATTGATATTAGAGAGAACAATTTTCAATTATTCAAGTATTAATACAACTTTCTCAGATAAAGACTTGAGATTCTTAGTCATaaatgtttgtgttgatttacCACCTAAGGTTGTATCTGATGGCATTTGGGCTAATCATGATCAAGGTGTAAAGCCTATGAAATCAACTTTGCCATTATTAGAGTTGCAAATTCTTACAATCTTTGCCATTACTCAATGCTTTCATTTGGTACTCAAACGTATTGGAGTCCCTTATTTTGTTTCACAAATCATGGCTGGTGTAGTTTTGGGACCATCTTTTGAGATATCAAATACATGGACTGAATTCAAAAACTACTTGTTTCCTTATGGTACCGAAGATGTAATAAGTTTAATATCGATAATTGGCTATggatttttcttgtttttaaatGGTGTAAAAATGGATCTCACCATGATAACAAGAACCGGTAGAAAAGCATGGACAATAGCATTTTGTTCCTTTGTGATTCCAACGGTTCTTGGTCTCACAGTGAGTTACAGATTCTTAGGATTTTGGAACAATTACATTGGAGAGTATGATGCAAAAAATCTTCCAGTTATAGTTATTGGACAAAGTGGCTGTTACTTTGCTGTCATAGCTTCTTTGCTCTCTGATCTTGAGATTCTTAACTCAGAACTTGGACGTTTAGCACTCTCAACGGCTTTGGTTATGGATGCTTTCAACTCAATTGTTTCTGGAATTGGCACAGCTGCAATTAGCAGCCTCAAAACTGATTCACACGATGATAGTAGCGGAAAAGGGCCCATTGCAGCTCTTTTAACCACTTTCTATTACTTATGTTTTCTGGTATTGACTCCTCTTCTGTTGCGTCCTATAATGAAGCGGTTTGTTAGAAACACACCAGAAGGTAGACCGGTGAAAAAATTATATGcaaatatagtgtttattctgGCACTTGCAGTTGGATTGTTTGGAGCTGTGGCAAACCAAAGTGTTTTAGCTGGATTGCTAGTTCTTGGTCTTATTGTACCAGAAGGTCCTCCATTAGGAACTGAAATGATCAAACAATTGGAATTGTTTAGTACTTGGTTCCTTTGTCCTATTTTTGTCACAAGTTGTGCTATGAAGGTTGATATCGGTATAGCCGTCAATAGAAGGTTGATTCTTGTTTGGTTTTTGACTATTGTTGTTGTTAACTGGCTTAAAATTCTGATGACAATTGGAATTTGTCGGCATTGTAACATGCCTAAGACCGACGGTTTGTGCCTAGCTCTCATGTTAAGTTGTAAGGGTGTTGTGGATTTTTGCACCAATGTATTTCTTCATGATGCCATGCTTATGAGCAATGAATCTCTATCGGTTATGACTATAAATGTGTTGGTGATGGGAACCATAGCGCGTATCGGTGTGAAGTTCTTGTATGACCCTTCAAGAAAATATGCAGGTTATCAAAAAAGGAACATCATGAGCTTGAAACCAAACACAGATCTTAAGATAGTTTCATGTATCTACAAACCAAGTCACATAATACCTATCAAGAATGTTATTGACATTTGTAGTCCTACATCAAGCAATCCATTGGTAGTTCATGTCTTACATCTCATGGAACTCGTCGGaagatcctctccaattttcatCTCACATCGCCTTCAAGAGCGAGTCGGTTCAGGTCGCTACACTTTCTCTGAGGATGTAATTGTTACTTTTGATCTTTTTGAACACGACAATGCCGGTTGTGTATCAGTGAATACCTACACAGCTATATCTCCACCGCGTTTCATGCACGACGATATTTGTTATCTTGCCTTGGACAAACTTGCATCCATTATCATTCTTCCTTTTCATCTAAGATGGTCTGAAGATGGTTGTGTTGAATCGGCAGACGAGAACATAAGGTCTTTGAACACCAAAGTTCTTGAAAGAGCACCTTGTTCGGTAGCGATTTTGGTCAATAGGGGAAGCTCTTCTTCTACCAACCACATTGATAATACAAAGCAAATTGCCATGATTTTCATAGGGGGTTCAGATGACAGAGAAGCATTGTGTTTAGCCAAAAGAACAATCAAAGATGATACTTATCATTTAGTTGTATATCACTTAGTTTCAACAATCAAGAATGGTGAGTTCACTAATTGGGATGTTATGCTTGATGAGGAGTTACTAAAGAGTGTTAACGGAGTTTATGGTAGTGTCGATAACGTAACATATGAAAGAGTTGGTGTTGAAAACACTTCAGATACCAGTACATTTATCGCAGATATAGCGAATCAACACGATTTCTTTATAGTTGGGAGACGTAACGGGGTAAAGTCGTCTCAAACACAAGCACTTGAAAATTGGACGGAGTATCCTGAATTAGGCGTGATCGGAGATTTGCTTGCTTCACCGGATACTAGTACCAAAGCTTCAATATTAGTTGTGCAGCAACAACTAATGCCTAAGTTATGA 2475 0.3648 MNQTLDAKSVKYFTELILERTIFNYSSINTTFSDKDLRFLVINVCVDLPPKVVSDGIWANHDQGVKPMKSTLPLLELQILTIFAITQCFHLVLKRIGVPYFVSQIMAGVVLGPSFEISNTWTEFKNYLFPYGTEDVISLISIIGYGFFLFLNGVKMDLTMITRTGRKAWTIAFCSFVIPTVLGLTVSYRFLGFWNNYIGEYDAKNLPVIVIGQSGCYFAVIASLLSDLEILNSELGRLALSTALVMDAFNSIVSGIGTAAISSLKTDSHDDSSGKGPIAALLTTFYYLCFLVLTPLLLRPIMKRFVRNTPEGRPVKKLYANIVFILALAVGLFGAVANQSVLAGLLVLGLIVPEGPPLGTEMIKQLELFSTWFLCPIFVTSCAMKVDIGIAVNRRLILVWFLTIVVVNWLKILMTIGICRHCNMPKTDGLCLALMLSCKGVVDFCTNVFLHDAMLMSNESLSVMTINVLVMGTIARIGVKFLYDPSRKYAGYQKRNIMSLKPNTDLKIVSCIYKPSHIIPIKNVIDICSPTSSNPLVVHVLHLMELVGRSSPIFISHRLQERVGSGRYTFSEDVIVTFDLFEHDNAGCVSVNTYTAISPPRFMHDDICYLALDKLASIIILPFHLRWSEDGCVESADENIRSLNTKVLERAPCSVAILVNRGSSSSTNHIDNTKQIAMIFIGGSDDREALCLAKRTIKDDTYHLVVYHLVSTIKNGEFTNWDVMLDEELLKSVNGVYGSVDNVTYERVGVENTSDTSTFIADIANQHDFFIVGRRNGVKSSQTQALENWTEYPELGVIGDLLASPDTSTKASILVVQQQLMPKL 824
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tsu05g03611 824 PANTHER CATION/H+ EXCHANGER 2 28 822 - -
Tsu05g03611 824 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 84 480 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Tsu05g03611 824 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 28 822 - -
Tsu05g03611 824 Gene3D - 75 490 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tsu05g03611 Tsu-Chr5 47486717 47489372 Dispersed/Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tsu05g03611 44 816 Antiporter Super Family AT3G44900 37.189 5.09e-158 479
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tsu05g03611 - - gmx:100778180 1052.35