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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre9g04720 ATGAATCAGACAATAGATGCAGAAAGTGTAAAATATTTTACAAATTTGATATTAGACAGAACAATTTTCAATTGTTCAAGTATTAATACAACCTTATCAGATAAAGATTTGAGATTCTTAGTTATAAATGTGTGTGCTGATTTACCACCTAAGGTTGTATCTGATGGCATTTGGGCTAATCATGATGAAGGTGTAAAGCCTATGAAATCAACTTTGCCATTATTAGAGTTACAAATTCTTACAATCTTTGCCATTACACAATGTTTCCATTTGGTACTCAAACGTCTTGGAGTCCCTTATTTCGTTTCACAAATCATGGCTGGTTTAGTTTTAGGACCATCTTTCAAGATATCAAATACATGGACTGAATTCAAAAACTATTTGTTTCCTTATGGTACCGAAGATGTAATAAGTGTAATATCCATAATTGGCTATGGATTTTTCCTGTTTCTAAATGGTGTTAAAATGGATCTTACCATGATAACAAGAACAGGTAGAAAAGCATGGACAATAGCATTTTGTTCCTTTGTTATTCCAACAGTTCTTGGTCTTACAATGATTTACAGATTCTTAGGATATTGGAACAATTACCTTGGAGAGTATGAAGCAAAAAATCTACCGGTTATAGTTATCGGACAAAGTGGATGTTACTTTGCTGTCATAGCTTCTTTGCTATCTGATCTTGAGATTCTTAACTCGGAACTTGGACGTTTAGCACTCTCAACGGCTTTGGTTATGGATGCTTTCAACTCAATTGTTTCAGGATTCGGCACAGCTGCAATTAGCAGCCTAAAAACTGATTCACATGATGATGGTAGTGGAAAAGGACCAATTGCAGCTCTTTTAACCAGTTTCTATTACTTCTGTTTTCTAGTATTGACTCCTCTTCTGTTGCGTCCGATAATGAAGCGGTTTGTTAGAAACACACCAGAAGGTAGACCAGTGAATAAATTATACACAAATATTGTGTTCATTATGGCTCTTGCAGTTGGAATGTTTGGACTTGTGGCAAACCAAAGTGTTTTAGCTGGATTGTTAGTTCTTGGTCTTATTGTGCCTGAAGGTCCTCCATTAGGAACAGAAATGATTAAGCAATTGGAATTGTTTAGTACTTGGTTCCTTTGTCCTATTTTTGTCACAAGTTGTGCTATGAAGGTTGATATTGGTGTACATGTTGATAGAAGTTTGATTCTTGTTTGGCTTTTGATTATTGTTGTTGTTCATTTGTTTAAAATGTTGATGACAATTGGAATCTGTTGGCATTGTAACATGCCTAAGACTGATGGATTGTGCCTAGCTCTCATGTTAAGTTGCAAGGGTGTTGTGGATTTTTGCACCAATGTGTTTCTTCATGATGCCATGATTATGAGCAATGAATCATTATCTGTTATGACTATAAATGTGCTGGTGATGGGAACCATGGCGCGTATTGGTGTGAAGTTCTTGTATGATCCATCACGAAAATATGCAGGTTATCAAAAAAGAAACATCGTGAACTTGAAACCAAACTCGGATCTTAGGATAGTTTCATGCATTCACAAACCAAGTCACATAATTCCAATCAAGAATGTTATTGACATTTCAAATCCAACACAAAGCAATCCATTGGTAGTTCATGTCTTGCATCTCATGGAACTCGTTGGACGATCCTCTCCCATTTTCATCTCACATCGCCTTCAAGAGCGATTTGGTTCAGGTCGTCACACTTTCTCTGAGGATGTCATTGTTACCTTTGATCTTTTCGAACACGACAATGCTGGTACTGTATCAGTGAGTACCTACACAGCTATATCGCTTCCACGGTTCATGCACGACGATATTTGTTATCTTGCATTGGACAAACTTGCATCCATCATCATTCTTCCTTTTCATCTAAGATGGTCAGAAGATGGTTCTGTTGAATCGGCGGACGAGAACATAAGGTCTTTGAACACCAAAGTTCTCGAAAGAGCGCCTTGTTCAGTAGCAATCCTTGTCAATAGGGGATGCTCTTCTACTACCAATGACATTGGTAATACAAAGCAAATTGCCATGATATTCATAGGGGGTCCAGACGACAGAGAAGCGTTGTGTTTCGCCAAAAGGACAATCAAAGATGATACTTATCACTTGGTTGTGTATCACTTGGTTTCAACAATCAAGAATGATGAGTTCACTAATTGGGATGTTATGCTTGATGAGGAGGTACTAAAGGGTGTTAAGGGAGCTTATGGTAGAATACATAATGTGACATATGAAAAAATTGGTGTTGAAAACACTTCAGATACAACTGCGTTTATCTCCGATATAGCGAATCAACATGATTTCATTATAGTTGGAAGACGTAACGGGGCAAAATCATCTCAAACACAAGCACTTGAAAATTGGACAGAATATCCTGAATTAGGTGTAATTGGAGATTTGCTTGCTTCACAAGATACTAATACCAAAGCTTCAATATTAGTTGTGCAGCAACAACTAATGCCTAAGTCATGA 2475 0.3709 MNQTIDAESVKYFTNLILDRTIFNCSSINTTLSDKDLRFLVINVCADLPPKVVSDGIWANHDEGVKPMKSTLPLLELQILTIFAITQCFHLVLKRLGVPYFVSQIMAGLVLGPSFKISNTWTEFKNYLFPYGTEDVISVISIIGYGFFLFLNGVKMDLTMITRTGRKAWTIAFCSFVIPTVLGLTMIYRFLGYWNNYLGEYEAKNLPVIVIGQSGCYFAVIASLLSDLEILNSELGRLALSTALVMDAFNSIVSGFGTAAISSLKTDSHDDGSGKGPIAALLTSFYYFCFLVLTPLLLRPIMKRFVRNTPEGRPVNKLYTNIVFIMALAVGMFGLVANQSVLAGLLVLGLIVPEGPPLGTEMIKQLELFSTWFLCPIFVTSCAMKVDIGVHVDRSLILVWLLIIVVVHLFKMLMTIGICWHCNMPKTDGLCLALMLSCKGVVDFCTNVFLHDAMIMSNESLSVMTINVLVMGTMARIGVKFLYDPSRKYAGYQKRNIVNLKPNSDLRIVSCIHKPSHIIPIKNVIDISNPTQSNPLVVHVLHLMELVGRSSPIFISHRLQERFGSGRHTFSEDVIVTFDLFEHDNAGTVSVSTYTAISLPRFMHDDICYLALDKLASIIILPFHLRWSEDGSVESADENIRSLNTKVLERAPCSVAILVNRGCSSTTNDIGNTKQIAMIFIGGPDDREALCFAKRTIKDDTYHLVVYHLVSTIKNDEFTNWDVMLDEEVLKGVKGAYGRIHNVTYEKIGVENTSDTTAFISDIANQHDFIIVGRRNGAKSSQTQALENWTEYPELGVIGDLLASQDTNTKASILVVQQQLMPKS 824
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre9g04720 824 Gene3D - 75 490 IPR038770 -
Trre9g04720 824 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 84 473 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre9g04720 824 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 52 819 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre9g04720 Trre-Chr9 53984194 53986826 Wgd
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre9g04720 44 816 Antiporter Super Family AT3G44900 36.205 3.84e-160 485
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre9g04720 K26731 - mtr:11429863 1230.31