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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre9g01028 ATGGGTAATGGTGTGAATCCTGCATGTTATATAGTAGATATGATTCATCCAAATCGAATATGGCAAAGTGATAATGTCCTAAAGAATGAGTTCCCCATTCTTGCCTTACAAGTTGGTTACGTTGTATTGTTGTCTCGTCTTTTCTTCTTTATCTATCAGCCCCTTTGTTTACCTCGTCTCATTTCACAACTTTCTGTTGGTTTTCTACTAATTCAAGTAGTTGGGCGGTTCCGATCTACGTACTTTTACGTTTTTCCTATAAATGGGGTGCTTAATGTTGAAGTTCTATCGCACATTGGTATCATCTATTACGCATTTCTCAGTGGTTTAGAAATGAATTTGAATGTCATTTTACATGTTAAAAAGAAGGCTGGAAGCATTGCTCTTTCTGGGATAATTTTTCCAATGGTGATGGGACCAGCTTTATACACTCTACATCGAAAATTTTATGGCAATGGTGATGGATCTGCACTTGAAGAAAGTACAAAAAGTGCTTATGTAATTTGGACTTTGGTTCTAACAGTAACAGGTTTTCCAGTTGTAGCTCACTCCCTTTCTGAGCTCAAGCTTCTTTATACCGGTCTTGGTGAGTCCGCATTAACAGCAGCTATGTTGAGTGACACATATGCTTGGGTTTTATTCACATTATTTGTTCCATTTTCAATTAATGGTAAAGGGGCAATATATTCAGTGGTATGCACAATACTATTTATTGTCATTTGTATCTTTGTGGTGCGTCCTATAATTATGAATGTCATTGATCGCAAGACAGAAAAGGATGAGTGGGATGATAACAAATTGCTATTTGTGGTGATGGGGCTTTTCATTTGTTCATACATAACAGATGTTCTTGGTACACATGCCGTTGTTGGGGCTTTTGTGTACGGGTTGATTTTACCTCATGGTAAATTTTCTGACATGGTGGTGTCAATCTCGGATGATTTTGCTGGCGGCACTATGTTTGCCACTTTCTTTTTTGGCATGCGTTCCCAAGACAATTTTGCTCTCGGATTGCTTCTCAATACCAAGGGTGCCATTGCTTTGATAATGCTCAATATTGCATGGGATAGATCGATTCTTTCTATGCCAACATATGCTGTTTTAACCTCTTCAGTCCTTCTAATGACTATAGTGGTGTCTCCCTTAATCAATGCCATATACAAGTCTAAAAAGAGATTTGAGCAAAACAAACTAAAGACTATTCAAAAGCTAAGATTTGATGCAGAACTTAGGATTCTAGCATGTGTTCACAATACTCGCCAAGCCACAGGAATTATAAGCCTTCTAGAATCTTTCAATGTAACTAGACTTTCCCCTATGCATGTTTTTGCACTTCACCTTGTTGAACTCACAGGAAGGGCTGCTGCACTTGTTGCTGCTCATATGGAGAAGCCTAGTGGCCAAATTGGAACACAAAATCTTACAAAATCACAAGAAGAGCAAGAGAACATTAACAATGCATTTGAAGCATTTGGAGAGACATATGATGCTATAAGAGTCCAAACCTTAAATGTTGTGTCAGCTTATTCAACCATTCACGAGGACATATACAACTCGGCCAATGAAAAACGCATAAGCTTGACTATCCTTCCATTCCACAAACAATTAAGTTCAGAAGGTGTTCTCGAAACAACAAGTGTTGTGTACAGAGATATAAACCTCGATGTGATGCAAAATGCGCCTTGCTCTGTGGGAATCTTTGTTGATCGTGATTTTGCGTCAATATCAAAAATGAACTTTCGTGTTTGTATGATTTTTGTTGGAGGTCCCGACGATCGTGAAGCCATGGCTGTTGCATGGAGGATGGCAGGGCATCCAGGAATGCAACTATCAGTAGTTAGGATTTTACTATTTGATGAAGCAACAAAAGTAGATACCTCAATTAATATTGAAGCATATAACGCACTATCTGCTGTGATGGATAATGCGAAACAAAAGGAGTTAGATGATGAATATGTGAATTCATTTAGACTCACAGCAGTTAACAATGATGATTCTATATCCTATTCAGAGATTGATGTGCATTCAGGTGAAGATATTCCCACAATCCTCAATGAGCTAAACACAATTGAATGTGATTTATACATAGTTGGACAGGGGAATTGTAGAAACTTAAGAGTCTTTTCAAATTTGTTGGAATGGTGTGATTGTCCAGAACTTGGAGTGATAGGGGATATTTTGACATCAAGCAATTTTATTTCACGTTCATCTGTGTTAGTTGTGCAACAATATGGGTATGGAGGAATGGTTTTTGGAAACCAATCCAACAACGTGACCACTAATAATGATGGTTTTGAGACACTGTGA 2307 0.3801 MGNGVNPACYIVDMIHPNRIWQSDNVLKNEFPILALQVGYVVLLSRLFFFIYQPLCLPRLISQLSVGFLLIQVVGRFRSTYFYVFPINGVLNVEVLSHIGIIYYAFLSGLEMNLNVILHVKKKAGSIALSGIIFPMVMGPALYTLHRKFYGNGDGSALEESTKSAYVIWTLVLTVTGFPVVAHSLSELKLLYTGLGESALTAAMLSDTYAWVLFTLFVPFSINGKGAIYSVVCTILFIVICIFVVRPIIMNVIDRKTEKDEWDDNKLLFVVMGLFICSYITDVLGTHAVVGAFVYGLILPHGKFSDMVVSISDDFAGGTMFATFFFGMRSQDNFALGLLLNTKGAIALIMLNIAWDRSILSMPTYAVLTSSVLLMTIVVSPLINAIYKSKKRFEQNKLKTIQKLRFDAELRILACVHNTRQATGIISLLESFNVTRLSPMHVFALHLVELTGRAAALVAAHMEKPSGQIGTQNLTKSQEEQENINNAFEAFGETYDAIRVQTLNVVSAYSTIHEDIYNSANEKRISLTILPFHKQLSSEGVLETTSVVYRDINLDVMQNAPCSVGIFVDRDFASISKMNFRVCMIFVGGPDDREAMAVAWRMAGHPGMQLSVVRILLFDEATKVDTSINIEAYNALSAVMDNAKQKELDDEYVNSFRLTAVNNDDSISYSEIDVHSGEDIPTILNELNTIECDLYIVGQGNCRNLRVFSNLLEWCDCPELGVIGDILTSSNFISRSSVLVVQQYGYGGMVFGNQSNNVTTNNDGFETL 768
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre9g01028 768 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 318 744 - -
Trre9g01028 768 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 42 326 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre9g01028 768 Gene3D - 33 329 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre9g01028 Trre-Chr9 8149695 8152780 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre9g01028 9 744 Antiporter Super Family AT2G13620 36.329 1.74e-167 502
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre9g01028 - - gmx:100804266 1145.18