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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre9g01027 ATGGGTAATGGTGTGAATCCTGCATGTTATATAGTAGATATGATTCATCCAAATCGAATATGGCAAAGTGATAATGTCCTAAAGAATGAGTTCCCCATTCTTGCCTTACAAGTTGGTTACGTTGTATTGTTGTCTCGTCTTTTCTTCTTTATCTATCAGCCCCTTTGTTTACCTCGTCTCATTTCACAACTTTCTGTTGGTTTTCTACTAATTCAAGTAGTTGGGCGGTTCCGATCTACGTACTTTTACGTTTTTCCTATAAATGGGGTGCTTAATGTTGAAGTTCTATCGCACATTGGTATCATCTATTACGCATTTCTCAGTGGTTTAGAAATGAATTTGAATGTCATTTTACATGTTAAAAAGAAGGCTGGAAGCATTGCTCTTTCTGGGATAATTTTTCCAATGGTGATGGGACCAGCTTTATACACTCTACATCGAAAATTTTATGGCAATGGTGATGGATCTGCACTTGAAGAAAGTACAAAAAGTGCTTATGTAATTTGGACTTTGGTTCTAACAGTAACAGGTTTTCCAGTTGTAGCTCACTCCCTTTCTGAGCTCAAGCTTCTTTATACCGGTCTTGGTGAGTCCGCATTAACAGCAGCTATGTTGAGTGACACATATGCTTGGGTTTTATTCACATTATTTGTTCCATTTTCAATTAATGGTAAAGGGGCAATATATTCAGTGGTATGCACAATACTATTTATTGTCATTTGTATCTTTGTGGTGCGTCCTATAATTATGAATGTCATTGATCGCAAGACAGAAAAGGATGAGTGGGATGATAACAAATTGCTATTTGTGGTGATGGGGCTTTTCATTTGTTCATACATAACAGATGTTCTTGGTACACATGCCGTTGTTGGGGCTTTTGTGTACGGGTTGATTTTACCTCATGACAATTTTGCTCTCGGATTGCTTCTCAATACCAAGGGTGCCATTGCTTTGATAATGCTCAATATTGCATGGGATAGATCGATTCTTTCTATGCCAACATATGCTGTTTTAACCTCTTCAGTCCTTCTAATGACTATAGTGGTGTCTCCCTTAATCAATGCCATATACAAGTCTAAAAAGAGATTTGAGCAAAACAAACTAAAGACTATTCAAAAGCTAAGATTTGATGCAGAACTTAGGATTCTAGCATGTGTTCACAATACTCGCCAAGCCACAGGAATTATAAGCCTTCTAGAATCTTTCAATGTAACTAGACTTTCCCCTATGCATGTTTTTGCACTTCACCTTGTTGAACTCACAGGAAGGGCTGCTGCACTTGTTGCTGCTCATATGGAGAAGCCTAGTGGCCAAATTGGAACACAAAATCTTACAAAATCACAAGAAGAGCAAGAGAACATTAACAATGCATTTGAAGCATTTGGAGAGACATATGATGCTATAAGAGTCCAAACCTTAAATGTTGTGTCAGCTTATTCAACCATTCACGAGGACATATACAACTCGGCCAATGAAAAACGCATAAGCTTGACTATCCTTCCATTCCACAAACAATTAAGTTCAGAAGGTGTTCTCGAAACAACAAGTGTTGTGTACAGAGATATAAACCTCGATGTGATGCAAAATGCGCCTTGCTCTGTGGGAATCTTTGTTGATCGTGATTTTGCGTCAATATCAAAAATGAACTTTCGTGTTTGTATGATTTTTGTTGGAGGTCCCGACGATCGTGAAGCCATGGCTGTTGCATGGAGGATGGCAGGGCATCCAGGAATGCAACTATCAGTAGTTAGGATTTTACTATTTGATGAAGCAACAAAAGTAGATACCTCAATTAATATTGAAGCATATAACGCACTATCTGCTGTGATGGATAATGCGAAACAAAAGGAGTTAGATGATGAATATGTGAATTCATTTAGACTCACAGCAGTTAACAATGATGATTCTATATCCTATTCAGAGATTGATGTGCATTCAGGTGAAGATATTCCCACAATCCTCAATGAGCTAAACACAATTGAATGTGATTTATACATAGTTGGACAGGGGAATTGTAGAAACTTAAGAGTCTTTTCAAATTTGTTGGAATGGTGTGATTGTCCAGAACTTGGAGTGATAGGGGATATTTTGACATCAAGCAATTTTATTTCACGTTCATCTGTGTTAGTTGTGCAACAATATGGGTATGGAGGAATGGTTTTTGGAAACCAATCCAACAACGTGACCACTAATAATGATGGTTTTGAGACACTGTGA 2217 0.3775 MGNGVNPACYIVDMIHPNRIWQSDNVLKNEFPILALQVGYVVLLSRLFFFIYQPLCLPRLISQLSVGFLLIQVVGRFRSTYFYVFPINGVLNVEVLSHIGIIYYAFLSGLEMNLNVILHVKKKAGSIALSGIIFPMVMGPALYTLHRKFYGNGDGSALEESTKSAYVIWTLVLTVTGFPVVAHSLSELKLLYTGLGESALTAAMLSDTYAWVLFTLFVPFSINGKGAIYSVVCTILFIVICIFVVRPIIMNVIDRKTEKDEWDDNKLLFVVMGLFICSYITDVLGTHAVVGAFVYGLILPHDNFALGLLLNTKGAIALIMLNIAWDRSILSMPTYAVLTSSVLLMTIVVSPLINAIYKSKKRFEQNKLKTIQKLRFDAELRILACVHNTRQATGIISLLESFNVTRLSPMHVFALHLVELTGRAAALVAAHMEKPSGQIGTQNLTKSQEEQENINNAFEAFGETYDAIRVQTLNVVSAYSTIHEDIYNSANEKRISLTILPFHKQLSSEGVLETTSVVYRDINLDVMQNAPCSVGIFVDRDFASISKMNFRVCMIFVGGPDDREAMAVAWRMAGHPGMQLSVVRILLFDEATKVDTSINIEAYNALSAVMDNAKQKELDDEYVNSFRLTAVNNDDSISYSEIDVHSGEDIPTILNELNTIECDLYIVGQGNCRNLRVFSNLLEWCDCPELGVIGDILTSSNFISRSSVLVVQQYGYGGMVFGNQSNNVTTNNDGFETL 738
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre9g01027 738 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 301 714 - -
Trre9g01027 738 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 42 304 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre9g01027 738 Gene3D - 33 302 IPR038770 -
Trre9g01027 738 Gene3D - 303 367 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre9g01027 Trre-Chr9 8149695 8152780 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre9g01027 9 714 Antiporter Super Family AT2G13620 35.063 1.34e-154 468
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre9g01027 - K26731 gmx:100804266 693.345