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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre9g01024 ATGGGTAATGGTGTGAATCCTGCATGTTATACAGTAGATATGATTAATCCAAATCGAATATGGCAAAGTGATAATGTCCTAAAGAATGAGTTTCCCATTCTTGCCTTACAAGTTGGTTACGTTGTATTGTTGTCTCGTCTTTTCTTCTTTATCTATCGGCCCCTTTGTTTACCTCGTCTCATTTCACAACTTTCTGTTGGTTTTCTACTAATTCAAGTAGTTGGGCATTTCCGATCTACGTACTTTTACGTTTTTCCTATAAATGGGGTGCTTAATGTTGAAGTTCTATCGCACATTGGTATCATCTATTACGCATTTCTCAGTGGTTTAGAAATGAATTTGAATGTCATTTTACATGTTAAAAAGAAGGCTGGAAGCATTGCTCTTTCTGGGATAATTTTTCCAATGGTGATGGGACCAGCTTTATACACTCTACATCGAAAATTTTATGGCAACGGTGATGGATCTGCACTTGAAGAAAGTACAAAAAGTGCTTATGTAATTTGGACTTTGGTTCTAACAGTAACAGGTTTTCCAGTTGTAGCTCACTCCCTTTCTGAGCTCAAGCTTCTTTATACCGGTCTTGGTGAGTCCGCATTAACAGCAGCTATGTTGAGTGACACATATGCTTGGGTTTTATTCACATTATTTGTTCCATTTTCAATTAATGGTAAAGGGGCAATATATTCAGTGGTATGCACAATAATATTTATTGTCATTTGTATCTTTGTGGTGCGTCCTATAATTATGAATGTCATTGATCACAAGACAGAAAAGGATGAGTGGGATGATAACAAATTGCTATTTGTGGTGATGGGGCTTTTCATTTGTTCATACATAACGGATGTTCTTGGTACACATGCCGTTGTTGGGGCTTTTGTGTATGGGTTGATTTTACCTCATGGTAAATTTTCTGATATGGTGGTGTCAATCTCAGATGATTTTGCTGGCGGGTTTTTGGCACCGCTCTTCTTTAGTGGCACGGGAATGAGACTCATGGTGGATAAACTTTTCGATCATCATTATTGGCCTATGACGCTCGTGATCATTTTCCTCTTGTGTTCTATAAAGATTTTAAGCACTATGTTTGCCACTTTCTTTTTTGGCATGCGTTCCCAAGACAGTTTTGCTCTCGGATTGCTTCTCAATACCAAGGGTGCCATTGCTTTGATAATGCTCAATATTGCATGGGATAGATCGATTCTTTCTATGCCAACATATGCTGTTTTAACCTCTTCAGTCCTTCTAATGACTATAGTAGTGTCTCCCTTAATCAATGCCATATACAAGTCTAAAAAGAGATTTGAGCAAAACAAACTAAAGACTATTCAAAAGCTAAGATTTGATGCAGAACTCAGGATTCTAGCATGTGTTCACAATACTCGCCAGGCCACAGGAATTATAAGCCTTCTAGAATCTTTCAATGTAACTAGACTTTCCCCTATGCATGTTTTTGCACTTCACCTTGTTGAACTCACAGGAAGGGCTGCTGCACTTGTTGCTGCTCATATGGAGAAGCCTAGTGGCCAAATTGGAACACAAAATCTTACAAAATCACAAGAAGAGCAAGAGAACATTAACAATGCATTTGAAGCATTTGGAGAGACATATGATGCTATCAGAGTCCAAACCTTAAATGTTGTGTCAGCTTATTCAACCATTCATGAGGACATATACAACTCGGCCAATGAAAAACGCATAAGCTTGACTATCCTTCCATTCCACAAACAATTAAGTTCAGAAGGTGTTCTCGAAACAACAAGTGTAGTGTACAGAGATATAAACCTCAATGTGATGCAAAATGCGCCTTGCTCCGTGGGAATCTTTGTTGATCGTGATTTTGCGTCAATATCGAAGATGAACTTTCGTGTTTGTATGATTTTTGTTGGAGGTCCCGACGATCGCGAAGCCATGGCTGTTGCATGGAGGATGGCAGGGCATCCAGGAATGCAACTATCAGTAGTTAGGATTTTACTATTTGATGACGCAACAAAAGTAGATACCTCAATTAATATTGAAGAACATAACGCATTATCTGCTGTGATGGATAATGCGAAACAAAAGGAGTTAGATGATGAATATGTGAATTCATTTAGACTCACAACAGTTAACAATGATGATTCTATATCCTATTCAGAGATTGATGTGCATTCTGGTGAAGATATTCCCACAATCCTCAATGAGCTAAACACAATTGAATGTGATTTATACATAGTTGGACAGGGGAATTGTAGAAACTTAAGAGTGTTTTCAAATTTGTTGGAATGGTGTGATTGTCCAGAACTTGGAGTGATAGGGGATATTTTGACATCAAGCAATTTTATTTCACGTTCATCTGTGTTAGTTGTGCAACAATATGGGTATGGAGGAATGGGTTTTGGAAACCAATCCAACAACGTGACCACTAATAATGATGGTTTTGAGACACTGTGA 2433 0.3814 MGNGVNPACYTVDMINPNRIWQSDNVLKNEFPILALQVGYVVLLSRLFFFIYRPLCLPRLISQLSVGFLLIQVVGHFRSTYFYVFPINGVLNVEVLSHIGIIYYAFLSGLEMNLNVILHVKKKAGSIALSGIIFPMVMGPALYTLHRKFYGNGDGSALEESTKSAYVIWTLVLTVTGFPVVAHSLSELKLLYTGLGESALTAAMLSDTYAWVLFTLFVPFSINGKGAIYSVVCTIIFIVICIFVVRPIIMNVIDHKTEKDEWDDNKLLFVVMGLFICSYITDVLGTHAVVGAFVYGLILPHGKFSDMVVSISDDFAGGFLAPLFFSGTGMRLMVDKLFDHHYWPMTLVIIFLLCSIKILSTMFATFFFGMRSQDSFALGLLLNTKGAIALIMLNIAWDRSILSMPTYAVLTSSVLLMTIVVSPLINAIYKSKKRFEQNKLKTIQKLRFDAELRILACVHNTRQATGIISLLESFNVTRLSPMHVFALHLVELTGRAAALVAAHMEKPSGQIGTQNLTKSQEEQENINNAFEAFGETYDAIRVQTLNVVSAYSTIHEDIYNSANEKRISLTILPFHKQLSSEGVLETTSVVYRDINLNVMQNAPCSVGIFVDRDFASISKMNFRVCMIFVGGPDDREAMAVAWRMAGHPGMQLSVVRILLFDDATKVDTSINIEEHNALSAVMDNAKQKELDDEYVNSFRLTTVNNDDSISYSEIDVHSGEDIPTILNELNTIECDLYIVGQGNCRNLRVFSNLLEWCDCPELGVIGDILTSSNFISRSSVLVVQQYGYGGMGFGNQSNNVTTNNDGFETL 810
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre9g01024 810 Gene3D - 33 439 IPR038770 -
Trre9g01024 810 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 9 786 - -
Trre9g01024 810 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 42 425 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre9g01024 Trre-Chr9 8078233 8080946 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre9g01024 9 786 Antiporter Super Family AT2G13620 37.927 0.0 550
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre9g01024 - K26731 gmx:100804266 1207.97