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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre9g01020 ATGGGTGGTAGTGTTGGGCATTCAATTGCATGTTATCAAGTGGATGTGCGTAATCCAAGTCGAATATGGCAAACTGAAAAAATTCTAACAACTGAGCTCTCTGTTCTTGCCATTCAACTTGTTTTTACTGTAGTTTTGTCTCGTTTTCTATTCGTTATCTATAAACCCCTTCATCAACCTCGTCTCATTTCTCAAATCTCTGTTGGTTTTCTACTGATTCAAATACTTGGGATATTTCCATCTATTTTCGTCTTTATTTATCCTGCATCGGGGGTGCATAACATTGACGTTCTAACACATACTGGTATTGTATACTACGCATTCCTTACGGGTTTGGAGATGAATTTGAATACCATTTTACATGCAACGAGGAAAGCAGCAACCATTGCGATTTCAGGAATCATCTTCCCCATATTGATGGGACCAATTTTATACGCTCTACATCGAAAATTTTATGCCAATGGTGTTCTATATCCACTTGAAGAAAGTACGATGAATGCTTATGTACTATGGACTTTAGTTCTCACTGTAACAGGTTTTCCAGTTGTAGTTCACTCACTTTCCGAGCTCAAACTTCTTTATACTGGTCTTGGTAAGGATGCATTAACAGCAGCTATGATAAGTGACACATATGCTTGGATTTTATTCACATTATTTGTTCCATTTTCAATTAATGGTACAAGGGCAATATATTCGATATTAAGCACCATAATATTTGTTTTTATATGCATCTACATGGTGCGTCCTATCGTTGTAAAAGTCATTGATCAAAACACAGAAAATGATGAATGGGATAATAACCAATTACTCTTTGTGGTGATGGGGATTTTTGTTTGTGCATACATAACGGATAGTCTTGGCACACATGGTGTTGTTGGGGCTTTTGTGTACGGTTTGATTTTACCTCACGGTAAATTTGCTGACATGGTGGCGTCAATGACTGATGATTTTGCTGGCGCATTTCTTGCGCCTCTTTTCTTTAGTGGCAGTGGAATGCGACTCTCGATGAGTACCATTTTGGTCCAGAAGAATTGGCCTTTGACTCTTATGGTTATAATCTTGTTGTGTCTTCCAAAGATTTTAAGCACTTTGTTTGCCACTTTCTTTTTTGGCATGCGTATTCGTGATGGTTTTGCTCTAGGCTTAATTCTTAATACAAAAGGTGCCGTTGCACTAATAATGCTCAATACTGCTTGGGATAAATCGATTCTTTCTGGACCAACTTACACTGTCTTAACCTCTGGAGTCCTTTTAATGACTATAGTGGTGTCTCCCATTGTTAATGCCATACACAAGCCTAGAAAGCGATTTGAGCAAAACAAGCTAAAGACTATACAAAAGCTAAGACTTGATGCAGAGCTCAGAATTCTAGCATGTGTTCACAATACTCGACAGGCTACAGGGATTCTTAGCCTCATCGAATCTTTTAATCCCACCAGACTTTCACCTATACATGTTTTTTCACTTTACCTTGTTGAGCTCACAGGACGTGTGGGTGCACTTGTTGCAGCTCATATGGAGAAGCCTAGTGGCCAACTTGGAGCACAAAATCTTACAAGATCCCAGGAAGAGCTAGAAAGCATTAACGGCACCTTTGGAGCATTTGGAGAAAAATATGATGCAGTCAGAGTGGAAACATTAAATGTTGTGTCATCTTATGCAACCATTCACGAGGATATATACAACTCTGCTAATGATAAACGAACAAGCTTGATTATCCTTCCATTCCACAAACAAGTAAGTTCAGAAGGTGAACTTGAAACAACGAATATTGTGCACAAAGATATAAACGTGAATGTGATGCAAAGTGCACCTTGCTCTGTGGGAATCTTTGTTGATCGTGATTTTGGGCTATTATCAAAAATGAAATTTTGTATTCGTATGATCTTTATCGGAGGTCCTGACGATCGTGAAGCCTTAGCTGTTGCATGGAGGATGGCTAGGCACCCAGGAACTCAATTATCAGTGGTTCGAATGTTCTTGTTTGATGAAGCTGCAGAAGTAGACACCTCATGTCACACTGAAGCACAAGGCATACTATCTGTTGTAATGGATAGTGATATGCAAAATGACTTAGATGACGAGTACGTGAATTCTTTTAGACTCACAGCAGTAAACAACAATGATTCTATATCCTATTCAGAGGTTGATGTTCATTCAGGTGAAGATATTCCCATAGTCCTCAACGAGCTAGAGAATTTGGACTGTGATTTATACATAATTGGACAAGGGAATCGTAGGAGCTCTCGAGTCTTTTCGAATTTATTGGATTGGTGTGATTGTTCAGAACTTGGAGTTATAGGGGACATGTTGGCCTCAAACAATTTTGGTTCCCGCTCATCTGTGCTAGTTGTGCAACAATATGGGTATGGAGGAATGGTTTTGCGAAATCAACACAGCCACATGACAACTAATAACAATGATATTGAGGCACTTGTCGTGAAGACAGAATAA 2454 0.3904 MGGSVGHSIACYQVDVRNPSRIWQTEKILTTELSVLAIQLVFTVVLSRFLFVIYKPLHQPRLISQISVGFLLIQILGIFPSIFVFIYPASGVHNIDVLTHTGIVYYAFLTGLEMNLNTILHATRKAATIAISGIIFPILMGPILYALHRKFYANGVLYPLEESTMNAYVLWTLVLTVTGFPVVVHSLSELKLLYTGLGKDALTAAMISDTYAWILFTLFVPFSINGTRAIYSILSTIIFVFICIYMVRPIVVKVIDQNTENDEWDNNQLLFVVMGIFVCAYITDSLGTHGVVGAFVYGLILPHGKFADMVASMTDDFAGAFLAPLFFSGSGMRLSMSTILVQKNWPLTLMVIILLCLPKILSTLFATFFFGMRIRDGFALGLILNTKGAVALIMLNTAWDKSILSGPTYTVLTSGVLLMTIVVSPIVNAIHKPRKRFEQNKLKTIQKLRLDAELRILACVHNTRQATGILSLIESFNPTRLSPIHVFSLYLVELTGRVGALVAAHMEKPSGQLGAQNLTRSQEELESINGTFGAFGEKYDAVRVETLNVVSSYATIHEDIYNSANDKRTSLIILPFHKQVSSEGELETTNIVHKDINVNVMQSAPCSVGIFVDRDFGLLSKMKFCIRMIFIGGPDDREALAVAWRMARHPGTQLSVVRMFLFDEAAEVDTSCHTEAQGILSVVMDSDMQNDLDDEYVNSFRLTAVNNNDSISYSEVDVHSGEDIPIVLNELENLDCDLYIIGQGNRRSSRVFSNLLDWCDCSELGVIGDMLASNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMVLRNQHSHMTTNNNDIEALVVKTE 817
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre9g01020 817 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 26 788 - -
Trre9g01020 817 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 42 427 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre9g01020 817 Gene3D - 34 440 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre9g01020 Trre-Chr9 8049080 8052043 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre9g01020 4 788 Antiporter Super Family AT2G13620 36.637 1.17e-173 520
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre9g01020 - K26731 gmx:100804266 1185.24