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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre8g05160 ATGGTTGAATTTAAAAACAAAACATTAGATGAAATGGTGTGTTATTCACCAACTATGATAACAACAAATGGGATATGGCAAGGAGATAACCCTTTGGACTATGCTCTCCCTCTCTTCATCCTACAAGTTATTTTAGTTGTTATTGCCACCCGCATCTTTGTCTTCATACTCAAGCCCATTCGTCAACCACGCGTTATAGCTGAAATCTTGGGAGGGATAGTATTGGGTCCTTCTGTTCTCGGACGAAACAAAGCATTTGCAGAAGCAGTTTTTCCATTAAGAAGTGTGATGGTGATTGAAACAATGGCAAATGTTGGTCTTTTATATTTTCTATTCTTGGTTGGAGTAGGGATGGATGCATCTTCATTACGACGCATTGGTAAAAAAGCATTTACCATAGCAATTGCTGGTATGATATTACCATTTGGAACTGGGGCAATATTTTCCATTTTTTGGTTGAGAAATGTTGAGGATAACACCAATACTGCAGCTTATATCATATTGCTTGGTGTTATTCTTTCGGTCACTGCATTTCCTGTTCTTGCTAGGATCCTTGCTGAGCTAAAACTAATCAACACGGAGTTGGGAAGAGTTGCTCTTTCATCTGCACTTATTAATGATGTTCTATCATGGGTACTTTTGGCTATAGCAATTGCTTTGGCAGAGAATGAAAGAGTATCATTTGCATCTTTTATGGTGGTATTGTCAAGTGCAGCATTTGTTGCTTTTAATGCTTTTGTTGTTAGACCAATAATCATGTGGATAATAAGGAAAACACCTGAAGGTGAATCATTTAGTGATTTCTACATATGTTTGATACTAGCAGGTGTAATGATCTCAGGTTTTATCACTGATGCTATTGGAACTCATTCTGTTTTTGGAGCTTTTGTGTTTGGTTTGATCATCCCAAGTGGTCCACTTGGTTTTGCTCTTATTGAAAAGCTTGAAGACTTTGTTTCCGGCCTTCTACTTCCTCTATTTTTTGCAATTAGTGGATTAAAGACTAATGTTGGCCTCATCAATGGTTTTTCTACATGGGCAATTTTAATCATTCTTGTTATATTGGCTTGTGTTGGCAAAGTGGCTGGAACTTTAATTGTTGCTCTTAGTTATCAAATGTCATTAACTGAAGGTGCCGCGCTTGGTATGCTTATGAACACAAAAGGCCTTGTTGAAATTCTTGTTCTTAACATTGGTAGGGATCAAAAGGTTTTGGATGAAGGGTCATTTGCAACTATGGTGGTTATAACTGTAATTATGACTAGCATAATTGTACCTGGAATATCAATTATATATAGACCATCAAGGGGAATGATATCCTACAAAAGAAGAACAGTTCAAATGTCAAAAAAAGATACAGAGTTTAGAGTATTAGTGTGTATTCATACCCCAAGAAATGTTCCAACAATGATCAACCTCCTTGAAGCCTCTAATCCAACAAAAAAGTCACCAATATGTATATATATGCTCCATTTGGTTGAACTTACCGGTCGAACATCGGCATTACTCATTGTTCATACCTCTAGAAAATCAGACCACCCTGCTCTCAACAGAACTGAAGCTCAATCTGATCACATAATCAACGCCTTCGAAAACTATGAACAACACACCGAACATGTATCAGTACAACCTTTAACAGCAATATCCCCATACTCTACAATGCATGAAGATATATGCAATTTAGCTGAGGAAAAGCGTGTTGCATTTATAATTATCCCTTTTCATAAACAACAAACAGTTGATGGAGGGATGGAAGCAACAAACATGGCATTTCGAACGGTTAACCAAAATGTATTAGCGAATTCACCTTGTTCCGTCGGAATTCTAGTAGATAGAGGATTAAATAGTTCAAACCGTTTAGTTGCTGATCAAATGTCTCATCATGTAGCAGTTTTGTTTTTTGGTGGACCAGATGATAGGGAAGCGTTAAGTTACGGTTGGAGAATGTCAGAACATTCTGGAATAAGCCTAACCGTTATGCGTTTCGTTCCTGGAGAAGAAATAACGGCGATGAATGATAATGCTAACAATCAAGAGAAACAAAGAGTGTTGGATGTTGAAACAGATGAAAATAGTAATGAGAAGCAACTTGATGAAAAGTTTTTGCATTGGTTTATGATGTGTCATGTGAATGATGATTCAATTGCATATATTGAGAAAGTAGTTAATAATGGAGAGGAAACAGTTGGTGCTATAAGGTCAATGGGTGATGTTTTTGGACTTTTTATTGTCGGAAGAGGACAAGGAAATATATCACCACTTACAGCAGGACTCACTGATTGGAGTGAGTGTCCTGAGTTAGGAGCTATTGGTGATTTGTTAGCATCATCTGATTTTGCAACAATTGCTTCAGTTTTGGTAGTTCAACAATATGTTGGTGCTAGTTCGGATGATGGATTGGGAACACCAGTGTTAACAAATGAAGATTATGTTAATCACCATTCATCAGTTACCCCACCAAGGGGTCATCAAACTGTATTTAATACATAA 2490 0.3715 MVEFKNKTLDEMVCYSPTMITTNGIWQGDNPLDYALPLFILQVILVVIATRIFVFILKPIRQPRVIAEILGGIVLGPSVLGRNKAFAEAVFPLRSVMVIETMANVGLLYFLFLVGVGMDASSLRRIGKKAFTIAIAGMILPFGTGAIFSIFWLRNVEDNTNTAAYIILLGVILSVTAFPVLARILAELKLINTELGRVALSSALINDVLSWVLLAIAIALAENERVSFASFMVVLSSAAFVAFNAFVVRPIIMWIIRKTPEGESFSDFYICLILAGVMISGFITDAIGTHSVFGAFVFGLIIPSGPLGFALIEKLEDFVSGLLLPLFFAISGLKTNVGLINGFSTWAILIILVILACVGKVAGTLIVALSYQMSLTEGAALGMLMNTKGLVEILVLNIGRDQKVLDEGSFATMVVITVIMTSIIVPGISIIYRPSRGMISYKRRTVQMSKKDTEFRVLVCIHTPRNVPTMINLLEASNPTKKSPICIYMLHLVELTGRTSALLIVHTSRKSDHPALNRTEAQSDHIINAFENYEQHTEHVSVQPLTAISPYSTMHEDICNLAEEKRVAFIIIPFHKQQTVDGGMEATNMAFRTVNQNVLANSPCSVGILVDRGLNSSNRLVADQMSHHVAVLFFGGPDDREALSYGWRMSEHSGISLTVMRFVPGEEITAMNDNANNQEKQRVLDVETDENSNEKQLDEKFLHWFMMCHVNDDSIAYIEKVVNNGEETVGAIRSMGDVFGLFIVGRGQGNISPLTAGLTDWSECPELGAIGDLLASSDFATIASVLVVQQYVGASSDDGLGTPVLTNEDYVNHHSSVTPPRGHQTVFNT 829
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre8g05160 829 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 13 792 - -
Trre8g05160 829 FunFam Cation/H(+) antiporter 15 38 439 - -
Trre8g05160 829 Gene3D - 483 744 - -
Trre8g05160 829 Gene3D - 38 435 IPR038770 -
Trre8g05160 829 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 45 429 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre8g05160 Trre-Chr8 54032332 54035324 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre8g05160 12 813 Antiporter Super Family AT2G13620 67.162 0.0 1077
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre8g05160 K26731 - mof:131167764 1109.36