Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre6g05504 ATGGCATCAACAAACCCCCAACCTCCCCAAATGCTTCCCACCATCACAACCACTCCCACAAGACTCACCACCATACAAAAAGTAAAGAGCAATTTACTTTTCCATTCAACATTATCTGAACTCAATGGAGCCATGGGTGACCTTGGCACATACATACCAATAGTACTTTCTCTCACCCTTTCCAAAAACCTCAACCTTGGCACCACTTTGATTTTCACTGGCTTCTATAACTTTCTCACTGGTGCCATGTATGGTGTTCCTATGCCAGTTCAGCCTATGAAATCAATAGCAGCCGTTGCACTATCCGACCCCTCTTTCGATATCCCGGAAATCATGGCTTCTGGTATCTTAACCGGAGGGATTTTATTGGTTTTGGGTTTTACTGGTTTGATGAAATTAGCTTACAAACTTATACCTTTATGTGTTGTTAGAGGGATTCAGCTTGCACAGGGTTTGTCTTTTGCTTTAACTGCTATTAAATATGTTAGAAAAGTTCAAGACTTACCAAAGTCTAAATCTTTAAATTATAGGGATTGGTTTGGGTTTGATGGGTTGGTTATAGCTATTGTTTGTGTTTTCTTTGTTGTTGTTGTCAATGGTGCTGGTGAAAAGGAACATGAATTTGATGAGATTGAGGAAGAATTGGGTGATTCAATTGAAGGGAATGAGAGAAAAAAGAGTGGTAAATCATTTAAAAAGATTGTTTTTTCACTACCTTCTGCTTTTATAGTATTTGTTTTGGGTGTGATTTTGGGTTTTATAAGAAGGCCTAATGTGATACATGAAATTAAATTTGGACCTTCTAATATGGTGTTTGTGAAAATTTCTAAACATGCATGGAAACAAGGTTTTATAAAGGGTACAATTCCACAACTACCATTATCAATTTTGAACTCAGTGATAGCTGTTTGTAAACTATCTTCTGATTTATTTCCTACCAAGGACTTTTCAGTAACTTCACTTTCAGTAACAGTTGGGTTAATGAATCTTGTGGGTGGTTGGTTTGGTGCTATGCCATGTTGTCACGGTGCCGGTGGATTAGCAGGACAGTATAAATTTGGTGGAAGAAGTGGAGGGTGTGTTGCAATTCTTGGTGCAGCAAAATTGGTTTTGGGTTTTGTTTTGGGAAGTTCTTTGTCTCATTTTTTTCAACAGTTTCCAGTGGGAATTTTAGGAGTTTTGTTGTTATTTGCTGGGATTGAATTAGCTATGACTTGTAGGGATATGAATAACAAAGAAGATTCTTTTGTTATGCTTCTTTGTACTGCTGTTTCACTTGTGGGATCTAGTGCTGCTCTTGGTTTTTTATGTGGGATGGTTGTTTTTGGAGTTCTTAAGGTAAGGAATTTAACAAGTGTTAAATCACTTTCTAGTATTTGGAAGCATGAAGGACACGAGCAAGTTTGA 1407 0.3753 MASTNPQPPQMLPTITTTPTRLTTIQKVKSNLLFHSTLSELNGAMGDLGTYIPIVLSLTLSKNLNLGTTLIFTGFYNFLTGAMYGVPMPVQPMKSIAAVALSDPSFDIPEIMASGILTGGILLVLGFTGLMKLAYKLIPLCVVRGIQLAQGLSFALTAIKYVRKVQDLPKSKSLNYRDWFGFDGLVIAIVCVFFVVVVNGAGEKEHEFDEIEEELGDSIEGNERKKSGKSFKKIVFSLPSAFIVFVLGVILGFIRRPNVIHEIKFGPSNMVFVKISKHAWKQGFIKGTIPQLPLSILNSVIAVCKLSSDLFPTKDFSVTSLSVTVGLMNLVGGWFGAMPCCHGAGGLAGQYKFGGRSGGCVAILGAAKLVLGFVLGSSLSHFFQQFPVGILGVLLLFAGIELAMTCRDMNNKEDSFVMLLCTAVSLVGSSAALGFLCGMVVFGVLKVRNLTSVKSLSSIWKHEGHEQV 468
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre6g05504 468 Pfam Molybdate transporter of MFS superfamily 40 154 IPR031563 GO:0015098|GO:0015689
Trre6g05504 468 Pfam Molybdate transporter of MFS superfamily 284 402 IPR031563 GO:0015098|GO:0015689
Trre6g05504 468 PANTHER - 20 456 IPR031563 GO:0015098|GO:0015689
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre6g05504 Trre-Chr6 56424724 56426130 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre6g05504 16 454 Inorganic Solute Cotransporters AT2G25680 63.575 0.0 551
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre6g05504 - - gmx:100793562 662.914