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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre6g04704 ATGGGGATAGTAAATATAAACGAAACATTATTTTCATCAATTCAAACTTTAAATGGTGCAGATATGTCCAACAATATGAATCTTAATACACTTTATAATGTTTGCATTACTGTCCCACCCAATATTCTATCAGATGGCATATGGGGTGTACATAAATCCCATAAGACTCCATTCAAGTGTTCTTTACCAATGTTCCTTCTTCAAGTTGTTCTAATTTATACCACAACAAGAATTTTAAATTTTCCTTTCAATAAATTGGGTTTACCCATCCTCTTTTCACAAATGATGGCAGGGCTAATTTTAGGACCAATGGTGCCGGTATTCAAGGACTACAAGAGGAAGTTGTTTCCTTATGGAAGTCAAGATACACTTGCATCAATAACAGCACTTGGTTATGTGTTTTTTCTATTTGAAACTGGTATAAAAATGGATTTTCACACGATCATGAAAACAGGAAAAAAAGCATGGGTGATTACGTTTTGCGGGTTAGTAACCCCTATTATAACTGGTTTTGTTACTCGAAATGTAAGGGCTATGAATGCTTTTAATAACAGTCCCCTTGAAGCAAATATAGTAATGATAGGACACAATACAACTTCATTCGCCGTAATTGTTGCTCTCTTAAATGACCTTAAGCTTCTAAACTCCGAACTTGGACGATTAGCATTATCTGTTTCCTTGATTGGTGACCTATTGAGTAACATTGTTGTAACTTTGTCCTCAACTTTGGTGAGTTTGAATAGTCATATTTCATTTGGCATGAGATTAGGATCTTTAATCGGCATAGCTATCTTCGTTTTGTTCATCTATCGTCCCGCAATGCTTTGGATTGTTCAACACACTCCTGAAGGAAAAGAAGTTGAGGATATTTACGTCAACATTGTTATCGGGATTTTGTTTGCATGTTTTATATGTTCACTCTCTTTCAACATGCCTCCAAAAGATGCTATCTCTCTTTCCTTGCTTTTGAACTGCAAAGGCGTTGTCGAAGTAACCATGTACGCTACCGCATTGGATAGAAATGATATCCTTTCACAAACATATTGTGTGATTATACTGATAATCATGGTTTCAATTTGCATAACTCACTTGTTGGTAAAACGTTTGTATGATCCTTCAAGAAAATATGCTGGCTACCAAAAGAGGAACTTGTTCAATTTGAAAAACAACTCAGAATTGAAGATACTAGTTGTCATTCATAAACAACACCATGTAACTCCTATCACTGGAGTAATCGATTTATGTCACCCTATAGCCGAGAATCCTATCATCGTAGACGCGTTGCATTTAATCGAGTTAGCTGGCAGATCCTCACCTATTTTCATTTCTCACAAGAAGAAGAAAGTTGTTGCTTTAAACTTGCATGATTCTTATTCTGATAATGTTGTTCTTAATCTCAAAATATATGAACATGATAAACAAGGTGGAGCAATAATAAACCCTTACACAGCTATATCTCCACTTAATTTAATGCATGAAGATGTTTGTCACTTAGCATTTGACAAACTTTCATCAATTATAATCCTTCCTTTTCATAAAAAATGGTTTAGTGATGGTAAGCTTGAATATGATGACAAGAACATTAGGGCTTTAAACTGCTCAGTCTTGGAAAAATCTCCATGCTCAGTTGGAATCCTAGTGACTCGCGGTATTCGTCAAACGGATTCATTATTTCGATTAGCTTTGGTATTTTTAGGTGGAAAAGATGATAGAGAGGCATTATGTTTGGCGAATCGGGCAGCACGAGACCCTAGCGTCGAGCTTGTGATATATCACATTGTAAACAAGAAGAGAACTTTACAGGACATGGAAAATATGGAGACAAGGTTTGATCTAGCAATGTTAAAAGATGGTAAAATAGAACACTCTAGATTGGGAAATGTAGCATATAGAGAAATTGAAGTGGAGGGTGGATCACAAACAATTGATGTTCTTAGACAAATGGTACAAGAACATGATTTTATTATAGTTGGGAGAAGAAATGGAATCAAATCTCCACAGACATCTGGGCTTCAAGAATGGAGTGAGTTTCCTGAGTTAGGTCCTGTTGGAGATTTTTTGGCTTCCTCTGATCTTGATTGCACAGCATCTATTTTAGTAGTTCAACAACAAATATGCATGTAG 2124 0.3578 MGIVNINETLFSSIQTLNGADMSNNMNLNTLYNVCITVPPNILSDGIWGVHKSHKTPFKCSLPMFLLQVVLIYTTTRILNFPFNKLGLPILFSQMMAGLILGPMVPVFKDYKRKLFPYGSQDTLASITALGYVFFLFETGIKMDFHTIMKTGKKAWVITFCGLVTPIITGFVTRNVRAMNAFNNSPLEANIVMIGHNTTSFAVIVALLNDLKLLNSELGRLALSVSLIGDLLSNIVVTLSSTLVSLNSHISFGMRLGSLIGIAIFVLFIYRPAMLWIVQHTPEGKEVEDIYVNIVIGILFACFICSLSFNMPPKDAISLSLLLNCKGVVEVTMYATALDRNDILSQTYCVIILIIMVSICITHLLVKRLYDPSRKYAGYQKRNLFNLKNNSELKILVVIHKQHHVTPITGVIDLCHPIAENPIIVDALHLIELAGRSSPIFISHKKKKVVALNLHDSYSDNVVLNLKIYEHDKQGGAIINPYTAISPLNLMHEDVCHLAFDKLSSIIILPFHKKWFSDGKLEYDDKNIRALNCSVLEKSPCSVGILVTRGIRQTDSLFRLALVFLGGKDDREALCLANRAARDPSVELVIYHIVNKKRTLQDMENMETRFDLAMLKDGKIEHSRLGNVAYREIEVEGGSQTIDVLRQMVQEHDFIIVGRRNGIKSPQTSGLQEWSEFPELGPVGDFLASSDLDCTASILVVQQQICM 707
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre6g04704 707 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 69 307 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre6g04704 707 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 300 704 - -
Trre6g04704 707 Gene3D - 63 303 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre6g04704 Trre-Chr6 49951214 49954132 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre6g04704 306 707 Antiporter Super Family AT5G22900 39.141 1.67e-96 314
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre6g04704 K26731 - gmx:100784321 504.212