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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre6g03095 ATGCTGAAATCCTTGAGGAAAATCTTATCCCTTCAATTGAAGGATTGTATCAAGAAAAGGAGTGAACATGGTACAAACTTAGTAGCTGTGCAGTTACCAAATTGCAATGTTTGTGTAGAGGAAAACAAAAGATGCAATTGCAATCACATCGTGGTTGAGGATAGAAAGAACACTACTGCTGTAGAAGGCGCCAATTTCGACGCTGAGCATGATGCTAATGCTGATAGTTCTTTTGTTCAAGCTGTCATCAACATGGTGGGAATGCTCATAGGTTTGGGGCAATTATCAACTCCATATGCTGTTGAAAAAGGAGGGTGGGCATCTACATTATTGCTTATAGGACTTGGGGTAATGTGTGCTTACACCTCTCATATACTTGGAAAATGTCTTGAAAATAATCCAAATTTAACAAGTTATGTGGATATTGGGAATCAAGCATTTGGATCAAAAGGAAGATACTTAGTTGCAACATTCATCTACATGGAAATTTTTATGGCACTTGTTTCCTACACCATCTCATTACATGACAACTTGATCATAGTATTTTTGGGGACACATTTGAAGCTGAAATTGGCTATGTTATCAACATCACAAATCTTAACCTTGGTGGCAATCTTAATTGCTCTGCCTAGTTTATGGATCAGAGATATGTCTTCTATATCTTTCCTTTCAACTGGTGGAATTCTTATGTCTCTTCTAATTTTTATGTGTGTAGCAGTTACTGCAATTTTTGGAGATGTTCAAGCTAATAATCATAGTATACCAGCTTTCAAGTTGCATAATATTCCATCAATATCTGGCCTTTATGTATTTGGTTATGGAGGACATATTGTTTTCCCTGATTTATATAAAGCCATGAAAGACCCTTCCAAGTTCACTAAGGTTTCAATTGTGAGCTTCACAATAGTTACAGCACTATACACCTCAATGGGATTAATGGGTGCAAAAATGTTTGGAAACAATGTTCAGTCTCAAATAACTCTCAACATGCCACCAAATCAAATAATAACAAAAATTGCTCTTTGGGCAACAGTATTGACACCAATGACCAAATATGCACTTGAATTTGCACCCTTTGCAATTCAGCTAGAACACTCACTTCCAAATTCTCTTAGTGGTAGGACAAAATTGGTAATAAGGGGTTGTGTGGCTTCATTTTTGCTATTGACCATACTAACCCTTGCATTGTCAGTTCCATATTTTGAGCATGTACTAAGCCTCACTGGTTCACTAGTTAGTGTAGCCATTTGTTTGATTTTTCCATGTGCTTTCTATATGAAGATTTTTTGGGGTAAAATAACAAGGCCTCTTTTAGTCCTTAATGTTTTTCTAGTCATGTTTGGGTTTCTTCTTGGGGTGATGGGCACTATTTCCTCCACAGAGTTAATATTGAAAAAATTTCTATCACATCATTCAACTTGA 1422 0.3643 MLKSLRKILSLQLKDCIKKRSEHGTNLVAVQLPNCNVCVEENKRCNCNHIVVEDRKNTTAVEGANFDAEHDANADSSFVQAVINMVGMLIGLGQLSTPYAVEKGGWASTLLLIGLGVMCAYTSHILGKCLENNPNLTSYVDIGNQAFGSKGRYLVATFIYMEIFMALVSYTISLHDNLIIVFLGTHLKLKLAMLSTSQILTLVAILIALPSLWIRDMSSISFLSTGGILMSLLIFMCVAVTAIFGDVQANNHSIPAFKLHNIPSISGLYVFGYGGHIVFPDLYKAMKDPSKFTKVSIVSFTIVTALYTSMGLMGAKMFGNNVQSQITLNMPPNQIITKIALWATVLTPMTKYALEFAPFAIQLEHSLPNSLSGRTKLVIRGCVASFLLLTILTLALSVPYFEHVLSLTGSLVSVAICLIFPCAFYMKIFWGKITRPLLVLNVFLVMFGFLLGVMGTISSTELILKKFLSHHST 473
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre6g03095 473 Pfam Transmembrane amino acid transporter protein 76 457 IPR013057 -
Trre6g03095 473 PANTHER AMINO ACID TRANSPORTER 67 456 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre6g03095 Trre-Chr6 28333979 28336088 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre6g03095 35 471 Amino Acid or Auxin Permease AAAP Family AT5G16740 58.636 3.80e-168 479
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre6g03095 - - lang:109342470 665.611