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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre6g02154 ATGCCTCATAATGAATCCTTTCTCTCAAATTTATTGGATAAAACTAAACCCTTTATATCTATCTCTAATGCTTCTCATAATGATGCATTCCAGGTTTGTTACAAGAATAATAGAACTGTAGGTTCTTTAGGTATGTGGATTGGAGATAATCCATTGGACTTTGTGCTCCCTATCACATTGTGCCAAATTATTTTATCCTTTATGGTTTCTAGAGTACTTTATTTTCTCCTAAGGCCTCTTCAAACACCAAGATTCATATGTTGTGTCCTTGGTGGTGTTCTGTTAGGGCCAACATTTTTAGGGCGCAACACTGCATTAATGCAGACATTTTTTCCTCTAAAACAAGCTTCATTCTTAGCAACATTGTCAAAAATAGGAGCTGCATATTTTGTGTTCATCTATGCATTGAAATTAGATATAACAACATCCTTAAAAGCAGCTAAACGTAGTTGGAGATTTGGTGTAATTCCCTTCTTCTCTTCATATATTGTTACAGCAATTCTCTTGTCTTTGTATAAACCACATGGTGAAAAAAAAGATGAAATTACAGGATCAGTATATTCAATTCCAAATGTTTTCACTACTACAGCTTTTGCTGTTGTTTCTGAAGCCCTAACAGAACTCAATCTTATAAGCACAGAGTTAGGGCAAATTGCTTTATCTTCAGCAATGATCACTGAACTAATGCAATGGGTTACTATAACACTACGTTTCAATTCAAAAGACAGTTTTGTCCTTTCACTTGGATTTCTAACTTGTTCTGTTCTGTTCGTTTTATCGTTCTTTATCATTGTAAGACCGATGGCCAAGTTTATTATTCGAAGAACACCGGTTGGGAAACCGGTGAATGAAATGTATATTGTCATGATACTTTTGGGTGTTATGGTTATGTGTGCTCTTAGTGATGCACTTGGTTTATATTTTATTATTGGACCTATTCTTTTTGGTTTGGTTATGCCTAATGGTCGTCCTTTGGCTACAACAATTATTGACAAAATTGAATTAATCAACAAAGAATTTCTTATGCCATTCTTTTTTCTATATATTGGTCTACACACAAATTTTGGTGAAATTAAAAAAAATTGGAAGCTGGCAGTTACTTTTCAAAGTATCTTATTTGCTGGATTCATCACAAAGATTCTTGCTTGTGTCTTTATTTCTCCAACATATAATATGAAGCGTAAACATGGTTTGGTGCTTGGCCTTATATTGAGCATCAAGGGCATCATTGAATTGATCTTTTTTGCTAGACTCAGGGAACTCAAGGTTATTAATGATGAAGTATACAGCCAAATGGTTTTGTATGTGGTGTTGATGACCGGTATATGCATACCATTGATCAAAATTCTATATAAGCATCGATCTCGTGTGTTGATAGAACAAAGCATACACAATGATCGAGTGAGAACGATCCAGAATAGTCCTGATAATTCAAAGTTCAACGTTATTTCTTGCGTACACAATGATGCAAATGTGCATAGCATGATTGGTTTATTAGAGGCTTGTAACCCATCAAAAGAAAGCCCCTTATGTGTCCATGTCATTCATCTAATTGATTTATTAGGAAAAAGCACACCAATTCTTCTTCCTATAAATATGCGAAACAGAAAAACCTTGTCCATCAATAGCAACCATATTTTACGTGCTTTTGAGAATTACTCCCAAAATTCTAAAGGTCCGGTCACAATTAATTCATATGTTAATGTTTGTCCATACATTAACATGCATGAAGCAATTTGTAACCTCGCCCAAGACAAATTAGTTCATTTTCTCATCATTCCATTTCATGAAAATGATCAAAGTTTGTGTAGCGGTACGGTTGGATCTTCAATTCGTGACCTCAATGCTAATTTTCAAGCGAACGCACAATGTACTATCGGGATATTGGTTGATAGATATTCGCGAATGAGTATGAGTAGTACCAAAATGTTGTTTAATGTTGCTGTCTTCTTCGTCGGTGGACCAGATGATAGAGAAGCATTGGCGTTGGGTATTCGAATGTTGGAGCGTCCTAACACAAGTGTCACATTATTTTCTTTCGTCATTAATAATTCAAGCATTGTCAATTTTAAAGTTAATGAAGAAGACGATGAAGTATTAGAGAGTATGTTAGATGAAAGTTTAATAGATGAGTTTAAGGCTAAGAAAATGAATGTTGATAATGTTGTTTGCCATGAGATTGTGGTGGATGATTGTATACAAGTTTTGGAAGCCATTAGGGGTTTAGAGAATGAAGACTATGATCTAGTGATGGTGGGAAAGAGACACAATATTGGGGATTTAACTGATGAAGAAATGTCAAATTTTATGGATAATGCAAATTTGTTGGGGATTTTTGGAGATATGTTAGTATCTACTGAATTTTGTAATGGAGGAGTTCCTGTATTGGTGTTGCAATGTGGTGAGAAGAGGGTAAAACAGTGTGATAAATTATCTCACATGAGTTTATTATTTTAG 2457 0.3464 MPHNESFLSNLLDKTKPFISISNASHNDAFQVCYKNNRTVGSLGMWIGDNPLDFVLPITLCQIILSFMVSRVLYFLLRPLQTPRFICCVLGGVLLGPTFLGRNTALMQTFFPLKQASFLATLSKIGAAYFVFIYALKLDITTSLKAAKRSWRFGVIPFFSSYIVTAILLSLYKPHGEKKDEITGSVYSIPNVFTTTAFAVVSEALTELNLISTELGQIALSSAMITELMQWVTITLRFNSKDSFVLSLGFLTCSVLFVLSFFIIVRPMAKFIIRRTPVGKPVNEMYIVMILLGVMVMCALSDALGLYFIIGPILFGLVMPNGRPLATTIIDKIELINKEFLMPFFFLYIGLHTNFGEIKKNWKLAVTFQSILFAGFITKILACVFISPTYNMKRKHGLVLGLILSIKGIIELIFFARLRELKVINDEVYSQMVLYVVLMTGICIPLIKILYKHRSRVLIEQSIHNDRVRTIQNSPDNSKFNVISCVHNDANVHSMIGLLEACNPSKESPLCVHVIHLIDLLGKSTPILLPINMRNRKTLSINSNHILRAFENYSQNSKGPVTINSYVNVCPYINMHEAICNLAQDKLVHFLIIPFHENDQSLCSGTVGSSIRDLNANFQANAQCTIGILVDRYSRMSMSSTKMLFNVAVFFVGGPDDREALALGIRMLERPNTSVTLFSFVINNSSIVNFKVNEEDDEVLESMLDESLIDEFKAKKMNVDNVVCHEIVVDDCIQVLEAIRGLENEDYDLVMVGKRHNIGDLTDEEMSNFMDNANLLGIFGDMLVSTEFCNGGVPVLVLQCGEKRVKQCDKLSHMSLLF 818
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre6g02154 818 Gene3D - 58 458 IPR038770 -
Trre6g02154 818 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 33 799 - -
Trre6g02154 818 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 64 442 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre6g02154 Trre-Chr6 18225377 18228592 Dispersed/Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre6g02154 19 799 Antiporter Super Family AT2G13620 33.909 8.32e-146 447
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre6g02154 - - psat:127080272 1212.21