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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre6g00819 ATGGGAGGAAGAAGTGAAAGACTAGATCAATTGATTTCAAAAGGAATAATTAATGATGAGAAATTAGTTTGCCAATATGTTACAAGACAAACAAACAAGGGTGTGTGGTATGGAGATAATCCCCTCCATGACACCTCGTCTATTCTAGCATTACAAATTATTCTTATGTTCTTGCTTAGTAGAATTACTCATTTCTTGTTAAGTCCTTGTCATCAAACTCTTCTTATTTCACAAATTGTGGCTGGTATCATGGTAGGTCCATTAATTTTGGGAACTACGAAATATGACATGTTATTTCCAACAGCAAGCATAATGATACTCTCAACATTTGCAGAATTTGGAATGATAATTTATTTCTTTAGGATGGGGGTGCAAATAAATTACAAACAAATTATGATGATTGAAAAGCGGGCAGTAATTATTGGAATATTAGGCCACATGTCTTCTACGGTATTTGGCACTATAGTATTAAAACTTGTTGAAAAATTATACCCTTTAGGACCTGAAAATCATGGTATTCAAGGTTTAATATATTTTGCTTCATTAACCTCATTTCCAGTTATAAGTAGCTTCCTAAGTGAGATGAACATTATAAATTCAGAAATTGGAAGAATGGCATTATCAGCATCTATGATTAGTGATGCATATGGTCCTCCTTTAGGTCCTATTTTGGCTGAAAAGCTTGATACTATTGGTTCTACTTTGATTGTTCCAGCTTATTGTACTACAAGTGGGTTAAGGACTGGTGTTCCTACATTAGTAGGAACAAAATCAGTATTTGTGGAGGTTATCTTAATTTCAGTGTATATAGGGAAGTTTGTTGGAACTATTTTACCATCACTTTACTTTAACATTGAATTAGGAGATTCTTTAGCTTTGGCTCTAATCATGTGTTGCAAAGGCCTTATGGATCTCTGTTTGTTCAACATATTATTGAACAGTAAGACAATAGGTGAACTTCCATTCACCCTCATGATATATACAATGGTGGCCATGACAGGATTTGCAACTCTAGTTGTTTATTACATATATGACCCTTCAAGGAGATACAAAACATACATTAGAAGATCAATTAAAGACTACAAAAAAGATTTTGATCTCAAAATACTTGTATGCATCCAAGGTGAAGAAAATGTACATCCAATGATTAACCTTCTACAAGCCACAAATCCTACAAACACTACACCTCTCTCAATCTATGTTCTACATCTCATGGAATTAAAAGGCAGAGCAGCTTCAATCCTTACCAAAAATGAGTATAATAATAAATCATATAGATCAAATTCTTATAAAGAGACATCAACTCAACGCATAAGCAATGTGTTTAATCAATTTTTATTTCATAATGAAGGAAGTGTTGCATTGCAATTTTTTACAGCAATTGCACCATATGCTAGCATGCATGATGATATATGCTACATGGCAATGGATACAAAGTCAAACATTATAATTGTGCCATTTCATAAACAATTGTCAATGAATGGAAATGTTGAAGTTACCAATAGGTCGATTCGGTCGGTGAACCAAAAAGTACTAAACAAAGCGCCTTGTTCGATTGGAGTTTTAATCGATCGAAGTCAGATGAGGGGAAACTTATCGGTTATTCACGAGAAGTGTTTTTGTGAAATTGCTATGATTTTCTTAGGTGGAGCCGATGATCAAGAGGCATTGGTTTACGCTATGCGTATCGCAGAACATTCGAACATACGACTCACGGTGATTTGGGTACGGTTCAAATTGCAACAAAAACAATATAATATAAAAAATCCTTACATTGATTTGATGGAACATGTAAGGTATACAAGTAACCTTGTAGACAAGATATTTTTTAAGGAGGAGATTGTAGAAGATGGGGCAGGAACAACTAGTGTTATTTGTAGGATGGAAGGTTATTTTACCTTAGTTATAGTTGGTAGACATCATGTAGCAAATTCTCCATGTGTAATGGGCTTGACTGAATGGTGTGAACTTCCTGAGCTTGGGCCTGTGGGGAACCTCTTAGCCACATCAGATTTTTCTTTTTCTGTTTTAGTTGTGCAACAACAACCATTTAATGATTTTTGGTATGTTAGGTAA 2076 0.3444 MGGRSERLDQLISKGIINDEKLVCQYVTRQTNKGVWYGDNPLHDTSSILALQIILMFLLSRITHFLLSPCHQTLLISQIVAGIMVGPLILGTTKYDMLFPTASIMILSTFAEFGMIIYFFRMGVQINYKQIMMIEKRAVIIGILGHMSSTVFGTIVLKLVEKLYPLGPENHGIQGLIYFASLTSFPVISSFLSEMNIINSEIGRMALSASMISDAYGPPLGPILAEKLDTIGSTLIVPAYCTTSGLRTGVPTLVGTKSVFVEVILISVYIGKFVGTILPSLYFNIELGDSLALALIMCCKGLMDLCLFNILLNSKTIGELPFTLMIYTMVAMTGFATLVVYYIYDPSRRYKTYIRRSIKDYKKDFDLKILVCIQGEENVHPMINLLQATNPTNTTPLSIYVLHLMELKGRAASILTKNEYNNKSYRSNSYKETSTQRISNVFNQFLFHNEGSVALQFFTAIAPYASMHDDICYMAMDTKSNIIIVPFHKQLSMNGNVEVTNRSIRSVNQKVLNKAPCSIGVLIDRSQMRGNLSVIHEKCFCEIAMIFLGGADDQEALVYAMRIAEHSNIRLTVIWVRFKLQQKQYNIKNPYIDLMEHVRYTSNLVDKIFFKEEIVEDGAGTTSVICRMEGYFTLVIVGRHHVANSPCVMGLTEWCELPELGPVGNLLATSDFSFSVLVVQQQPFNDFWYVR 691
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre6g00819 691 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 54 217 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre6g00819 691 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 217 682 - -
Trre6g00819 691 Gene3D - 47 221 IPR038770 -
Trre6g00819 691 Gene3D - 222 352 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre6g00819 Trre-Chr6 6251932 6255290 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre6g00819 185 682 Antiporter Super Family AT1G06970 38.703 1.97e-114 362
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre6g00819 K26731 - gmx:100787550 662.914