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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre5g05308 ATGGCATCAACAAACCCTCAACCTCCCCAAATGCTTCCCACCATCACAACCACTCCCACAAGACTCACCACCATACAAAAAGTAAAAAGCAACTTACTTTTCCATTCAACATTATCTGAACTCAATGGAGCCATGGGTGACCTTGGCACATACATACCAATAGTACTTTCTCTCACTCTTTCCAAAAACCTCAACCTTGGCACCACTTTGATTTTCACTGGCTTCTATAACTTTCTCACTGGTGCCATGTATGGTGTTCCTATGCCAGTTCAGCCCATGAAATCAATAGCCGCCGTTGCACTATCCGACCCCTCTTTCGGTATCCCGGAAATCATGGCTTCTGGTATCTTAACCGGAGGGATTTTATTGGTTTTGGGTTTTACTGGTTTGATGAAATTAGCTTACAAACTTATACCTTTATGTGTTGTTAGAGGGATTCAGCTTGCACAGGGTTTGTCTTTTGCTTTAACTGCTATAAAATATGTTAGAAAAGTTCAAGACTTACCAAAGTCTAAATCTTTAAATTATAGGGATTGGTTTGGGTTTGATGGGTTGGTTATAGCTATTGTTTGTGTTTTCTTTGTTGTTGTTGTCAATGGTGCTGGTGAAAAGGAACATGAATTTGATGAGATTGAGGAAGAATTGGGAGATTCAATTGAAGGGAATGAGAGAAAAAAGAGTGGTAAATCATTTAAAAAGATTGTTTTTTCACTACCTTCTGCTTTTATAGTATTTGTTTTGGGTGTGATTTTGGGTTTTATAAGAAGGCCTAATGTGATACATGAAATTAAATTTGGACCTTCTAATATGGTGTTTGTGAAAATTTCTAAACATGCATGGAAACAAGGTTTTATAAAGGGTACAATTCCACAACTACCATTATCAATTTTGAACTCTGTAATAGCTGTTTGTAAACTATCTTCTGATTTATTTCCTACCAAGGACTTTTCAGTAACTTCACTTTCAGTAACAGTTGGGTTAATGAATCTTGTGGGTGGTTGGTTTGGTGCTATGCCATGTTGTCATGGTGCTGGTGGATTAGCAGGACAGTATAAATTTGGTGGAAGGAGTGGAGGGTGTGTTGCAATTCTTGGTGCAGCAAAATTGGTTTTGGGTTTTGTTTTGGGAAGTTCTTTGGCTCATTTTTTTCAACAGTTTCCAGTGGGAATTTTAGGAGTTTTGTTGTTATTTGCTGGGATTGAATTAGCTATGGCTTGTAGGGATATGAATAACAAAGAAGATTCTTTTGTTATGCTTCTTTGTACTGCTGTTTCACTTGTGGGATCTAGTGCTGCTCTTGGTTTTTTATGTGGGATGGTTGTTTTTGGAGTTCTTAAGGTAAGGAATTTAACAAGTGTTAAATCACTTTCTAGTATTTGGAAGCATGAAGGACACGAGCAAGTTTGA 1407 0.376 MASTNPQPPQMLPTITTTPTRLTTIQKVKSNLLFHSTLSELNGAMGDLGTYIPIVLSLTLSKNLNLGTTLIFTGFYNFLTGAMYGVPMPVQPMKSIAAVALSDPSFGIPEIMASGILTGGILLVLGFTGLMKLAYKLIPLCVVRGIQLAQGLSFALTAIKYVRKVQDLPKSKSLNYRDWFGFDGLVIAIVCVFFVVVVNGAGEKEHEFDEIEEELGDSIEGNERKKSGKSFKKIVFSLPSAFIVFVLGVILGFIRRPNVIHEIKFGPSNMVFVKISKHAWKQGFIKGTIPQLPLSILNSVIAVCKLSSDLFPTKDFSVTSLSVTVGLMNLVGGWFGAMPCCHGAGGLAGQYKFGGRSGGCVAILGAAKLVLGFVLGSSLAHFFQQFPVGILGVLLLFAGIELAMACRDMNNKEDSFVMLLCTAVSLVGSSAALGFLCGMVVFGVLKVRNLTSVKSLSSIWKHEGHEQV 468
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre5g05308 468 Pfam Molybdate transporter of MFS superfamily 284 402 IPR031563 GO:0015098|GO:0015689
Trre5g05308 468 Pfam Molybdate transporter of MFS superfamily 40 154 IPR031563 GO:0015098|GO:0015689
Trre5g05308 468 PANTHER - 20 456 IPR031563 GO:0015098|GO:0015689
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre5g05308 Trre-Chr5 53949668 53951074 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre5g05308 16 454 Inorganic Solute Cotransporters AT2G25680 64.027 0.0 555
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre5g05308 - - gmx:100793562 671.003
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Trre5g05308 5 53949668 53951074 Trre5g05308 5 53949668 53951074 ECH
Trre1g00756 1 5711513 5713182 Trre5g05308 5 53949668 53951074 PCT