Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre5g02142 ATGTGGATTGGAGATAATCCATTGGACTTTGTGCTCCCTATCACATTGTGCCAAATTATTTTATCCTTTATGGTTTCTAGAGTACTTTATTTTCTCCTAAGGCCTCTTCAAACACCAAGATTCATATGTTCTGTCCTGGGTGGTGTTCTATTAGGGCCAACATTTTTAGGGCGCAACACTGCATTAATGCAGACATTTTTTCCTCTAAAACAAGCTTCAATCTTAGCAACATTGTCAAAAATAGGAGCTGCATATTTTGTGTTCATCTATGCATTGAAATTAGATATAACAACATCCTTAAAAGCAGCTAAACGTAGTTGGAGATTTGGTGTAATTCCCTTCTTCTCTTCATATATTGTTACAGCAATTCTCTTGTCTTTGTATAAACCACATGGTGAAAAAATAGATGAAATTACAGGATCAGTATATTCAATTCCAAATGTTTTCACTACTACAGCTTTTGCTGTTGTTTCTGAAGCCCTAACAGAACTCAATCTTATAAGCACAGAGTTAGGGCAAATTGCTTTATCTTCAGCAATGATCACTGAACTAATGCAATGGGTTACTATAACACTACGTTTCAATTCTAAAGACAGTTTTGTCCTTTCACTTGGATTTCTAACTTGTTCTGTTCTGTTCGTTTTATCGTTCTTTATCATCGTAAGACCGATGGCCAAGTTTATTATCCGAAGAACACCAGTAGGGAAATCGGTGAATGAAATGTATATTGTGATGATACTTTTGGGTGTTATGGTTATGTGTGCTCTTAGTGATGCACTTGGTTTATATTTTATTATTGGACCTATTCTTTTTGGTTTGGTAATGCCTAATGGTCGGCCTTTGGCTACAACAATTATTGACAAAATTGAATTAATCAACAAAGAATTTCTTATGCCATTCTTTTTTCTATATATTGGTCTACACACAAATTTTGGTGAAATTAAAAAAAATTGGAAGCTGGCTATTACTTTTCAAGGTATCTTATTTGCTGGATTCACCACAAAGATTCTTGCTTGTGTCTTTATTTCTCCAACATATAATATGAAGCGTAAACATGGGTTGGTTCTTGGCCTTATATTGAGCATCAAGGGCATCATTGAATTGATCTTTTTTGCTAGACTAAGGGAACTCAAGGTTATTAATGATGAAGTATACAGCCAAATGGTTTTGTATGTGGTGTTGATGACCGGTATATGCATACCCTTGATCAAAATTCTATATAAGCATCGATCTCGCGTGTTGATAGAACAAAGCATACACAATGATCGAGTGAGAACGATCCAGAATAGTCCTGATAATTCAAAGTTCAATGTTATATCTTGCGTGCACAATGATGCAAATGTGCATAGCATGATTGGTTTGTTAGAGGCTTGTAACCCATCAAAAGAAAGCCCCTTATGTGTCCATGTCATTCATCTAATTGATTTATTAGGAAAAAGCACACCAATTCTTCTTCCTATAAATATGCGAAATAGAAAAACTCTGTCCATCAATAGCAACCATATTTTACGTGCTTTTGAGAATTATTCCCAAAATTCTAAAGGTCCAGTCACAATTAATTCATATGTTAATGTTTGTCCATACATTAACATGCATGAAGCAATTTGTAACCTCGCCCAAGACAAATTAGTTCATTTTCTCATCATTCCATTTCATGAAAATGATCAAAGTTTGTGTAGCGGTACCGTTGGATCTTCAATTCGTGACCTCAATGCTAATTTTCAAGCGAACGCACAATGTACTGTCGGGATATTGGTTGATAGATATTCACGAATGAGTATGAGTAGTACCAAAATGTTGTTTAATGTTGCTGTCTTCTTCGTCGGTGGACCAGATGATAGAGAAGCATTGGCGTTGGGTATTCGAATGTTGGAGCGTCCTAACACAAGTGTCACATTATTTTCATTCGTCATTAATAATAATTCAGGCATTGCCGATTTTAAAGTTAATGACGAAGACGATGAAGTATTAGAGAGTATGTTAGATGAGAGTTTAATAGATGAGTTTAAGGCTAAGAAAATTAATGTTGATAATGTTGTTTGCCATGAGATTGTGGTGGATGATTGTTTACAAGTTTTGGAAGCCTTTAGGGGTTTAGAGAATGAAGACTATGATCTAGTATTGGTGGGAAAGAGACACAATATTGGGGATTTAACTGATGAAGAAATGTCAAATTTTATGGATAATGCAAATTTGTTGGGGATTTTTGGAGATATGTTGGTATCTACTGAATTTTGTAATGGAGGAGTTCCTGTATTGGTGTTGCAATGTGGTGAGAAGAGGGTAAAACAGTGTGATAAGTTATCCCACATGAGTTTATTATTTTAG 2328 0.3509 MWIGDNPLDFVLPITLCQIILSFMVSRVLYFLLRPLQTPRFICSVLGGVLLGPTFLGRNTALMQTFFPLKQASILATLSKIGAAYFVFIYALKLDITTSLKAAKRSWRFGVIPFFSSYIVTAILLSLYKPHGEKIDEITGSVYSIPNVFTTTAFAVVSEALTELNLISTELGQIALSSAMITELMQWVTITLRFNSKDSFVLSLGFLTCSVLFVLSFFIIVRPMAKFIIRRTPVGKSVNEMYIVMILLGVMVMCALSDALGLYFIIGPILFGLVMPNGRPLATTIIDKIELINKEFLMPFFFLYIGLHTNFGEIKKNWKLAITFQGILFAGFTTKILACVFISPTYNMKRKHGLVLGLILSIKGIIELIFFARLRELKVINDEVYSQMVLYVVLMTGICIPLIKILYKHRSRVLIEQSIHNDRVRTIQNSPDNSKFNVISCVHNDANVHSMIGLLEACNPSKESPLCVHVIHLIDLLGKSTPILLPINMRNRKTLSINSNHILRAFENYSQNSKGPVTINSYVNVCPYINMHEAICNLAQDKLVHFLIIPFHENDQSLCSGTVGSSIRDLNANFQANAQCTVGILVDRYSRMSMSSTKMLFNVAVFFVGGPDDREALALGIRMLERPNTSVTLFSFVINNNSGIADFKVNDEDDEVLESMLDESLIDEFKAKKINVDNVVCHEIVVDDCLQVLEAFRGLENEDYDLVLVGKRHNIGDLTDEEMSNFMDNANLLGIFGDMLVSTEFCNGGVPVLVLQCGEKRVKQCDKLSHMSLLF 775
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre5g02142 775 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 20 398 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre5g02142 775 Gene3D - 14 414 IPR038770 -
Trre5g02142 775 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 5 756 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre5g02142 Trre-Chr5 16036627 16039785 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre5g02142 1 756 Antiporter Super Family AT2G13620 34.522 1.30e-145 446
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre5g02142 - - psat:127080272 1177.93