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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre5g02141 ATGCCTCATAATGAATCCTTTCTCTCAAATTTAGTGGATAAAACTAAACCCTTTATATCTATCTCTAATGCTTCTCATATTGATGCATTCCAAGTTTGTTACAAGAATAATAGAACTGTAGGTTCTTTAGGTATGTGGATTGGAGATAATCCATTGGACTTTGTGCTCCCTATCACATTGTGCCAAATTATTTTATCCTTTATGGTTTCTAGAGTACTTTATTTTCTCCTAAGGCCTCTTCAAACACCAAGATTCATATGTTCTGTCCTGGGTGGTGTTCTATTAGGGCCAACATTTTTAGGGCGCAACACTGCATTAATGCAGACATTTTTTCCTCTAAAACAAGCTTCAATCTTAGCAACATTGTCAAAAATAGGAGCTGCATATTTTGTGTTCATCTATGCATTGAAATTAGATATAACAACATCCTTAAAAGCAGCTAAACGTAGTTGGAGATTTGGTGTAATTCCCTTCTTCTCTTCATATATTGTTACAGCAATTCTCTTGTCTTTGTATAAACCACATGGTGAAAAAATAGATGAAATTACAGGATCAGTATATTCAATTCCAAATGTTTTCACTACTACAGCTTTTGCTGTTGTTTCTGAAGCCCTAACAGAACTCAATCTTATAAGCACAGAGTTAGGGCAAATTGCTTTATCTTCAGCAATGATCACTGAACTAATGCAATGGGTTACTATAACACTACGTTTCAATTCTAAAGACAGTTTTGTCCTTTCACTTGGATTTCTAACTTGTTCTGTTCTGTTCGTTTTATCGTTCTTTATCATCGTAAGACCGATGGCCAAGTTTATTATCCGAAGAACACCAGTAGGGAAATCGGTGAATGAAATGTATATTGTGATGATACTTTTGGGTGTTATGGTTATGTGTGCTCTTAGTGATGCACTTGGTTTATATTTTATTATTGGACCTATTCTTTTTGGTTTGGTAATGCCTAATGGTCGGCCTTTGGCTACAACAATTATTGACAAAATTGAATTAATCAACAAAGAATTTCTTATGCCATTCTTTTTTCTATATATTGGTCTACACACAAATTTTGGTGAAATTAAAAAAAATTGGAAGCTGGCTATTACTTTTCAAGGTATCTTATTTGCTGGATTCACCACAAAGATTCTTGCTTGTGTCTTTATTTCTCCAACATATAATATGAAGCGTAAACATGGGTTGGTTCTTGGCCTTATATTGAGCATCAAGGGCATCATTGAATTGATCTTTTTTGCTAGACTAAGGGAACTCAAGGTTATTAATGATGAAGTATACAGCCAAATGGTTTTGTATGTGGTGTTGATGACCGGTATATGCATACCCTTGATCAAAATTCTATATAAGCATCGATCTCGCGTGTTGATAGAACAAAGCATACACAATGATCGAGTGAGAACGATCCAGAATAGTCCTGATAATTCAAAGTTCAATGTTATATCTTGCGTGCACAATGATGCAAATGTGCATAGCATGATTGGTTTGTTAGAGGCTTGTAACCCATCAAAAGAAAGCCCCTTATGTGTCCATGTCATTCATCTAATTGATTTATTAGGAAAAAGCACACCAATTCTTCTTCCTATAAATATGCGAAATAGAAAAACTCTGTCCATCAATAGCAACCATATTTTACGTGCTTTTGAGAATTATTCCCAAAATTCTAAAGGTCCAGTCACAATTAATTCATATGTTAATGTTTGTCCATACATTAACATGCATGAAGCAATTTGTAACCTCGCCCAAGACAAATTAGTTCATTTTCTCATCATTCCATTTCATGAAAATGATCAAAGTTTGTGTAGCGGTACCGTTGGATCTTCAATTCGTGACCTCAATGCTAATTTTCAAGCGAACGCACAATGTACTGTCGGGATATTGGTTGATAGATATTCACGAATGAGTATGAGTAGTACCAAAATGTTGTTTAATGTTGCTGTCTTCTTCGTCGGTGGACCAGATGATAGAGAAGCATTGGCGTTGGGTATTCGAATGTTGGAGCGTCCTAACACAAGTGTCACATTATTTTCATTCGTCATTAATAATAATTCAGGCATTGCCGATTTTAAAGTTAATGACGAAGACGATGAAGTATTAGAGAGTATGTTAGATGAGAGTTTAATAGATGAGTTTAAGGCTAAGAAAATTAATGTTGATAATGTTGTTTGCCATGAGATTGTGGTGGATGATTGTTTACAAGTTTTGGAAGCCTTTAGGGGTTTAGAGAATGAAGACTATGATCTAGTATTGGTGGGAAAGAGACACAATATTGGGGATTTAACTGATGAAGAAATGTCAAATTTTATGGATAATGCAAATTTGTTGGGGATTTTTGGAGATATGTTGGTATCTACTGAATTTTGTAATGGAGGAGTTCCTGTATTGGTGTTGCAATGTGGTGAGAAGAGGGTAAAACAGTGTGATAAGTTATCCCACATGAGTTTATTATTTTAG 2460 0.3488 MPHNESFLSNLVDKTKPFISISNASHIDAFQVCYKNNRTVGSLGMWIGDNPLDFVLPITLCQIILSFMVSRVLYFLLRPLQTPRFICSVLGGVLLGPTFLGRNTALMQTFFPLKQASILATLSKIGAAYFVFIYALKLDITTSLKAAKRSWRFGVIPFFSSYIVTAILLSLYKPHGEKIDEITGSVYSIPNVFTTTAFAVVSEALTELNLISTELGQIALSSAMITELMQWVTITLRFNSKDSFVLSLGFLTCSVLFVLSFFIIVRPMAKFIIRRTPVGKSVNEMYIVMILLGVMVMCALSDALGLYFIIGPILFGLVMPNGRPLATTIIDKIELINKEFLMPFFFLYIGLHTNFGEIKKNWKLAITFQGILFAGFTTKILACVFISPTYNMKRKHGLVLGLILSIKGIIELIFFARLRELKVINDEVYSQMVLYVVLMTGICIPLIKILYKHRSRVLIEQSIHNDRVRTIQNSPDNSKFNVISCVHNDANVHSMIGLLEACNPSKESPLCVHVIHLIDLLGKSTPILLPINMRNRKTLSINSNHILRAFENYSQNSKGPVTINSYVNVCPYINMHEAICNLAQDKLVHFLIIPFHENDQSLCSGTVGSSIRDLNANFQANAQCTVGILVDRYSRMSMSSTKMLFNVAVFFVGGPDDREALALGIRMLERPNTSVTLFSFVINNNSGIADFKVNDEDDEVLESMLDESLIDEFKAKKINVDNVVCHEIVVDDCLQVLEAFRGLENEDYDLVLVGKRHNIGDLTDEEMSNFMDNANLLGIFGDMLVSTEFCNGGVPVLVLQCGEKRVKQCDKLSHMSLLF 819
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre5g02141 819 Gene3D - 58 458 IPR038770 -
Trre5g02141 819 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 33 800 - -
Trre5g02141 819 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 64 442 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre5g02141 Trre-Chr5 16036495 16039785 Wgd
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre5g02141 19 800 Antiporter Super Family AT2G13620 34.155 1.56e-147 452
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre5g02141 - - psat:127080272 1204.12