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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre5g01641 ATGACCGGGTTTCTTCTGGGTCCGTCGATACCGACAGGACCACTAGAAAAATATAAAAAGATGTTATTCCCATTTGGTGGTCCAGATATACTAAACACCATATCATGTTATGGTTACATATTTTTCTTATTTATAAATTCTGTTAAAATGGACTTGACCTTAATAACAAAAACAGGCAAAAAAGCTTGGGTAATTGCACTCCTCTCATATTTCGGAACCACCGGAATTAGCTTCATCTTCTTTATGTTTACCCACCGGATTTGGTCAGGTTTAATTGGCGTAGAAGAAACATTCGGTTTACCGGTTGTTTTTATATCTCATAGTGGTTGTTCTTTCGCTGTCGTTGCTTCTTTCCTATGTGAGCTTGGAATCCTCAACTCCGAACTTGGCCGCCTTGCAATGTCATCAGCTTTCCTGATCGACATCTCAGGCGGTGTCTTCGCCGGTATAGGAACTGCGATTGTGAGTGGCATTGATGATGGATGGTTAACAAGTGTAATATACTTATTTCTATTTATTTTTTATCTCTTGGGGATTCCATTAATTGGGAGACCAATAATGATGTTGATGGTGAAAAACACACCAGAAGGGAAACCAATTAACAAGATATACATACACTTAATTGTGTTTGCATTATTCATGTTAGGCCTATTAGCTGGACAATTCAACCAACCTTTTATGGCAGGTGCAATTGTTTTAGGACTTGCTGTTCCTGAAGGACCACCATTAGGGTCAGAGTTGGTTAACCAATTAGAATTGTTCTCTTCATGGATTTTTACACCTATTTTTGTGACTTGTTGTGTAATGAAAGTGAATCTAACTATGTGTGGACCTCCTATTCTTATTGTTGTTATCACTGGATTCATTATTTTGGTGCATACTATTAAGCTATTTGAATGTATCATTGTTTGCAAGTATTGCAATATGCCTTCAAGTGATGGTCTTTGCCTAGCTCTCATTTTGAGTTGCAAAGGTGTCATTGATACTTGCTCCTTCATTCTTGTCTACGACGGAATGAAGCAATCTCAAAAAGCAATAGGCGTTATGGTAATATCAACCTTAATCTTGTCAACAATCTCAAGAACCGGAGTGAAATTACTATATGATCCATCAAGAAAATATGCAGGGTATCAAAAAAGAAACATAGTGAATTCGAAAAAAAACTTAGAGATTCGTTTAGTTGCGGTTGTACACAAAGCAAGTCATATGGTTTACATCAAGAATTTCCTAAACCTTTGTTCTCCGACACCAGACAACACACTCGTTGCAGATGTGTTACATTTGAGGGAATTAATTGGAAGAACAACGCCTATTTTCATATCACATCGTCTCCAACAAAGAAAAGGATCCACACATAACTACTCGGGAGATTTTGTTGTTACATTCGACCTTTTTGAGCGTGACCATGCTGGTTTAGCAACGGTTAACACATACACAGCGATATCACCACCAACGTTTATGCCCGAAGATGTTTGTTACCTTGCATTAGACAAAAATGCAGCTATTATAATTCTACCATTCCATGTAAGATGGGAACTAAATGGTTCAATTGAATCAGAAGACAACAATGTAAGATTATTGAATTCAAAGGTTTTGGAAAGAGCGCCTTGTTCGATTGGGATTTTGGTTAACCGTGCATCCACAACCACCAACATTTCAAATGCTTATAAAGTAGCTATGATTTTCCTCGGTGGACCGGATGATAGAGAAGCGTTGTGTTTGGCTAAAAGGTTTTCTAAAAATGTAGACAACACTTTGTTTGTTTATAGATTGCGTTCGTGTGATCACGATATAACTGGTTGGGAGCAAATGATTGATGATGAGGAGTTAAGGGAAGTGCGCGGAGCCTATGTTAAACTCGAAAATGTCAAGTATGAAGAAAAAACTATAGAGGATGCATCTCAGACAACTAGTTTTATAAAGGAAATAGCTAATAATAAATTTGATTTTATTATAGTTGGGAGACGTTATGGACTTAAATCACCTCAAACAACTGGTTTGGAAAATTGGACTGAATATCCTGAATTAGGTGTCATTGGTGATTTGCTTGCTTCACGAGATATGAAAAGTAAAGCTTCAATTTTAGTTGTGCAACAACAACAACAAACCAAGTCTATTTCCTCCTAA 2127 0.3719 MTGFLLGPSIPTGPLEKYKKMLFPFGGPDILNTISCYGYIFFLFINSVKMDLTLITKTGKKAWVIALLSYFGTTGISFIFFMFTHRIWSGLIGVEETFGLPVVFISHSGCSFAVVASFLCELGILNSELGRLAMSSAFLIDISGGVFAGIGTAIVSGIDDGWLTSVIYLFLFIFYLLGIPLIGRPIMMLMVKNTPEGKPINKIYIHLIVFALFMLGLLAGQFNQPFMAGAIVLGLAVPEGPPLGSELVNQLELFSSWIFTPIFVTCCVMKVNLTMCGPPILIVVITGFIILVHTIKLFECIIVCKYCNMPSSDGLCLALILSCKGVIDTCSFILVYDGMKQSQKAIGVMVISTLILSTISRTGVKLLYDPSRKYAGYQKRNIVNSKKNLEIRLVAVVHKASHMVYIKNFLNLCSPTPDNTLVADVLHLRELIGRTTPIFISHRLQQRKGSTHNYSGDFVVTFDLFERDHAGLATVNTYTAISPPTFMPEDVCYLALDKNAAIIILPFHVRWELNGSIESEDNNVRLLNSKVLERAPCSIGILVNRASTTTNISNAYKVAMIFLGGPDDREALCLAKRFSKNVDNTLFVYRLRSCDHDITGWEQMIDDEELREVRGAYVKLENVKYEEKTIEDASQTTSFIKEIANNKFDFIIVGRRYGLKSPQTTGLENWTEYPELGVIGDLLASRDMKSKASILVVQQQQQTKSISS 708
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre5g01641 708 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 2 702 - -
Trre5g01641 708 Gene3D - 1 374 IPR038770 -
Trre5g01641 708 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 2 359 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre5g01641 Trre-Chr5 11884235 11886873 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre5g01641 16 697 Antiporter Super Family AT3G44900 36.173 1.17e-134 415
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre5g01641 K26731 - gmx:100797272 922.539