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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre5g00897 ATGGGAGGAAGAAATGAAAGACTAGATCAATTGATTTCAAAAGGAATAATTAATGATGAGAAACTAGTTTGTCAATATGTTACAAGACAAACAAACAAGGGTGTGTGGTATGGAGATAATCCCCTCCATGACACCTCATCTATTCTAGCATTACAAATTATTCTTATGTTCTTGCTTAGTAGAATTACTCATTTCTTGTTAAGTCCTTGTCATCAAACTCTTCTTATTTCACAAATTGTGGCTGGTATCATGGTAGGTCCATTATTTTTGGGAACTACGAAATATGAGATGTTATTTCCAACAGCAAGCATAATGATACTCTCAACATTTGCAGAATTTGGAATGATAATTTATTTCTTTAGGATGGGGGTGCAAATAAATTACAAACAAATTATGATGATTGAAAAGCGGGCAGTAATTATTGGAATATTAGGCCACATGTCTTCTACGGTATTTGGCACTATAGTATTAAAACTTGTTGAAAAATTATACCCTTTAGGACCTGAAAATCATGGTATTCAAGGTTTAATATATTTTGCTTCATTAACCTCATTTCCAGTTATAAGTAGCTTCCTAAGTGAGATGAACATTATAAATTCAGAAATTGGAAGAATGGCATTATCAGCATCTATGATTAGTGATGCATGTATGTGGATATTTTATTTTGTCATACTCAATGGAGCTAAAGCCTTGGAAAAAAATTCATATGAATATATTCTACAATTAGGTTTAACATTTTGCTATTTCGCGGTTTTATTTTATTTATTAAGGCCATTAATTATATGGATTTCGAACCGTCATCCCAAAGAAAAGACAATGAGGGAAAGTCATTTCATAGCTATAATTTGTATACTTTTGTTTGTTGGATTGTCCGCACAATTGACAGGACAACCTGCTTTTGTTGTTGCATTTTGGTTTGGTTTGGTTTTACCGGATGGTCCTCCTTTAGGTCCTATTTTGGCCGAAAAGCTTGATACTATTGGTTCTACTTTGATTGTTCCAGCTTATTGTACTACAAGTGGGTTAAGGACAGGTGTTCCTAAATTAGTAGAAACAAAATCAGTATTTGTGGAGGTTATCTTAATTTCAGTGTATATAGGGAAGTTTGTTGGAACTATTTTACCTTCACTTTACTTTCACATTGAATTAGGAGATTCTTTTGCTTTGGCTCTAATCATGTGTTGCAAAGGCCTTATGGATCTCTGTTTGTTCAACATATTATTGAACAGTAAGACAATAGGTGAACTTCCATTCACCCTCATGATATATACAATGGTGGCCATGACCGGATTTGCAACTCTAGTTGTTTATTACATATATGACCCTTCAAGGAGATACAAAACATACATTAGAAGATCAATTAAAGACTACAAAAAAGATTTTGATCTCAAAATACTTGTATGCATCCAAGGTGAAGAAAATGTACATTCAATGATTAACCTTCTACAAGCCACAAATCCTACAAACACTACACCTCTCTCAATCTATGTTCTACATCTCATGGAATTAAAAGGCAGAGCAGCTTCAATCCTTACCAAAAATGAGTATAATAATAAATCATCATATAGATCAAATTCTTATAAAGAGACATCAACTCAACGTATAAGCAATGTGTTTAATCAATTTTTATTTCATAATGAAGGAAGTGTTGCATTGCAATTTTTTACAGCAATTGCACCATATGGTAGCATGCATGATGATATATGTTACATGGCAATGGATACAAAATCAAACATTATAATTGTGCCATTTCATAAACAATTGTCAATGAATGGAAATGTTGAAGTTACCAATAGGTCGATTCGGTCGGTGAACCAAAAAGTACTAAACAAAGCGCCTTGTTCGATTGGAGTCTTAATCGATCGAAGCCAAATGAGGGGAAACTTGTCAGTTATTCGCGAGAAATGTATTTGTGAAATTGCTATGATTTTCTTAGGTGGAGCCGATGATCAAGAGGCATTGGCTTACGCTATGCGTATCGCAGAACATTCGAACATACGACTCACGGTGATTTGGGTACGGTTCAATTTACAACAAAAACAATATAACATAAAAAATCCTTACATTGATTTGATGGAGCAGGTAAGGTATACAAGTAACCTTGTAGACAAGGTATTTTTTAAGGAGGAGATTGTAGAAGATGGGGCAGGAACAACTAGTGTTATTTGTAGGATGGAAGGTTATTTTACCTTAGTTATAGTTGGTAGACATCATGTAGCAAATTCTCCATGTGTATTGGGCTTGACTGAATGGTGTGAACTTCCTGAGCTTGGGCCTGTGGGGAACCTCTTAGCCACATCAGATTTTACTTTTTCTGTTTTAGTTGTGCAACAACAACCATTTAATGATTTTTGGTATGTTACGTAA 2367 0.3418 MGGRNERLDQLISKGIINDEKLVCQYVTRQTNKGVWYGDNPLHDTSSILALQIILMFLLSRITHFLLSPCHQTLLISQIVAGIMVGPLFLGTTKYEMLFPTASIMILSTFAEFGMIIYFFRMGVQINYKQIMMIEKRAVIIGILGHMSSTVFGTIVLKLVEKLYPLGPENHGIQGLIYFASLTSFPVISSFLSEMNIINSEIGRMALSASMISDACMWIFYFVILNGAKALEKNSYEYILQLGLTFCYFAVLFYLLRPLIIWISNRHPKEKTMRESHFIAIICILLFVGLSAQLTGQPAFVVAFWFGLVLPDGPPLGPILAEKLDTIGSTLIVPAYCTTSGLRTGVPKLVETKSVFVEVILISVYIGKFVGTILPSLYFHIELGDSFALALIMCCKGLMDLCLFNILLNSKTIGELPFTLMIYTMVAMTGFATLVVYYIYDPSRRYKTYIRRSIKDYKKDFDLKILVCIQGEENVHSMINLLQATNPTNTTPLSIYVLHLMELKGRAASILTKNEYNNKSSYRSNSYKETSTQRISNVFNQFLFHNEGSVALQFFTAIAPYGSMHDDICYMAMDTKSNIIIVPFHKQLSMNGNVEVTNRSIRSVNQKVLNKAPCSIGVLIDRSQMRGNLSVIREKCICEIAMIFLGGADDQEALAYAMRIAEHSNIRLTVIWVRFNLQQKQYNIKNPYIDLMEQVRYTSNLVDKVFFKEEIVEDGAGTTSVICRMEGYFTLVIVGRHHVANSPCVLGLTEWCELPELGPVGNLLATSDFTFSVLVVQQQPFNDFWYVT 788
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre5g00897 788 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 54 433 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre5g00897 788 Gene3D - 47 448 IPR038770 -
Trre5g00897 788 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 23 779 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre5g00897 Trre-Chr5 6109390 6113477 Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre5g00897 20 779 Antiporter Super Family AT1G06970 36.481 1.51e-169 508
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre5g00897 K26731 - gmx:100787550 1045.42