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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre4g03527 ATGCCTATAAAAAATTCTTTGTCCAAATACATGACTTTGTTCATGAACACCTCTTTCCTTTTGGTGATTTGTGTTTTCATGATTATTCACTTCAACACACCAAAAGAACTTAGTGTAGTTGTAAGCAACAATCACTCTACCTTTGATGATGGAAGTGATGATGAACAAGATTGCAATAAATTAGACAACATAGGTAACAACAAAGACAAGTGTTTGTACCTTAAATCCAACAATTCATGTGTCTCACAAGGCTACATTGATTACCTTTACATTTTCTATTGCAAATTTGGAAAATTTCCTTTATTAGGTTACACCCTTTTGTTTCTTTGTCTCTTAGTTCTTTTTTATTTATTGGCTAATACAACTTCTTATTATTTTTGTCCTTCACTTGAAAAATTGTCCAAATTGTTAAAATTGTCACCAACAATTTCTGGTGTTACTCTTCTCTCTCTTGGTAATGGTGCTTGTGATGTTTTCTCTAGTCTTGTCTCTTTTCAAGAAAGTGAGACACGTAATATTGGCTTAAACACAATTATTGGAGGTGTTTTTTTTGTGTCATGTGTTATTGTTGGGATAATTAGCATTTCAATTCATCAAAGAAATGTTCATGTTATAAAGTATGATTTTGTAAGAGATGTTTGTGTTCTACTTTTTGTTCTTCTTTGTTTGTTTTGTGTTTTGATAATTGGTGAGATTAATTTATTTGGAGCAATTTGTTTTTGTTTGATTTATATTGTTTATGTAATTTTTGTTTATGTCTCTTCTACCAAATGGAAAGATGGTGAAAGGGGTAATGATGGTATTTCAAGTTATGATAATGATCAATTGAATTTGAATGTGCCTCTTAATGATGATGTGAAGAAAAGATCCATTGATTGTGTTGAAAATGGTATTCAAGAATATGATTTAAATATAGAGCAAAATTGTTGCCACATGAAATCTTCAATATGTAGAATTTCACTTTGTGTTCTTGAGATGCCACTTTACTTGCCAAGGAGATTAACAATTCCTATTATATGTGAAGACAAATGGTCAAAGGTATATGCAATTTCTTCAATGATATTAGCACCACTTCTCTTATCTTTTCTATGGAACACTCATAAGGGATATAGTATTTCAAGCACAAATATTATTGTTTATGGAATTGGATTATTGGTTGGAATTATATTTGGTCTAATAGCATTTTTCACAACGGAAATGTTAGTGCCACCAAAAAAGTGTTTATTTATTTGGCTTGTAGGAGGGTTTATAATGAGTGTGACATGGAGTTACATTATAGCTCAAGAGTTGGTTGGGTTATTGGTTTCAATTGGTTTCATATGTAGAATAAGTCCTTCAATTTTAGGGTTAACCATTCTTGCTTGGGGTAACTCAATTGGTGATTTGATCACAAATTTAACAATGGCTTTAAATGGTGGACAAGAGGGGGTTCAAATAGCAATTTCAGGTTGCTATGCTGGTCCTATTTTTAATACTCTTGTTGGATTAGGAATTTCTCTTGTAAGTTCAACTTGGTCACAATATCCACAACCTATTTTGATTCCTAAAGATCCATATATATGGGAGACATTGGTGTTTTTGGTGTTTGGATTGGTTTTTGCACTTTTAGTTTTGTTAAAAAAAGATATGAAACTTGATGGAGTATTAGGAGGAGGGCTTTTAGTTGTTTACTTCATTTCTTTGTTTTTGAGGTTGATTCAAACACAAGGGGGTCTCCAATTTTATGATATGTAA 1734 0.3149 MPIKNSLSKYMTLFMNTSFLLVICVFMIIHFNTPKELSVVVSNNHSTFDDGSDDEQDCNKLDNIGNNKDKCLYLKSNNSCVSQGYIDYLYIFYCKFGKFPLLGYTLLFLCLLVLFYLLANTTSYYFCPSLEKLSKLLKLSPTISGVTLLSLGNGACDVFSSLVSFQESETRNIGLNTIIGGVFFVSCVIVGIISISIHQRNVHVIKYDFVRDVCVLLFVLLCLFCVLIIGEINLFGAICFCLIYIVYVIFVYVSSTKWKDGERGNDGISSYDNDQLNLNVPLNDDVKKRSIDCVENGIQEYDLNIEQNCCHMKSSICRISLCVLEMPLYLPRRLTIPIICEDKWSKVYAISSMILAPLLLSFLWNTHKGYSISSTNIIVYGIGLLVGIIFGLIAFFTTEMLVPPKKCLFIWLVGGFIMSVTWSYIIAQELVGLLVSIGFICRISPSILGLTILAWGNSIGDLITNLTMALNGGQEGVQIAISGCYAGPIFNTLVGLGISLVSSTWSQYPQPILIPKDPYIWETLVFLVFGLVFALLVLLKKDMKLDGVLGGGLLVVYFISLFLRLIQTQGGLQFYDM 577
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre4g03527 577 Gene3D - 321 565 IPR044880 -
Trre4g03527 577 Gene3D - 139 270 IPR044880 -
Trre4g03527 577 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 16 572 - -
Trre4g03527 577 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 412 564 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre4g03527 577 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 109 252 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre4g03527 Trre-Chr4 42192037 42193770 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre4g03527 14 570 Antiporters AT5G17850 50.534 5.09e-163 474
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre4g03527 K13754 - gmx:100813848 677.552