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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre4g03526 ATGGCACCTTTCATTTTCACTTCTAACTCCAAACCACAACCAAAAAAATTCACTCTTCTCCTCAACACATCCTTCCTCTTCCTCCTAGTTTTTTGCCTCAAACTTTATATCAATCCTTCAAATTCTAATTCTCATTTTCATCATGTTTCCTCAAAACTCTTCAACCATGCTAGAATCCTCACTAGTGATATCATAGTTGATTCATGCACTGAACTTCACAAATACTCAAATTACACCTCTAAGTGCTTATATGTCAAAACACATTCTGATTGTAGATCAAAAGGTTACATAAACTACCTTCAAATCTTTTATTGCAATCTTGGAAATTCACCAATTCTTGGTCACACGTTACTTGGTTTATGGCTTGTAGTTTTGTTCTATCTTTTAGCCGACACGGCTTCAAATTACTTTTGCACCTCCCTAGAAGGTTTGTCTAACATCTTAAGACTATCTCCAACCATAGCTGGAGTAACTTTACTCTCTCTTGGTAATGGTGCTCCTGATTTCTTTGCTAGTGTTGTTTCTTTCACAAGTTCAAATAATGGCGCGGTTGGTTTAAATAGCATTTTGGGAGGTGCATTTTTCGTTTCCACATGTGTTTTGGGAGTCATAAGTTTTTTAGTTAGTTCCAAATCTTATGATGTTGAAATTGACAAGGCTAGTTTCATTAGAGATGTCATTTTCTTCCTTTTCTCTTTGTTAGTTCTTCTAATCATCATTGCCATTGGGAAAATTAGCCTTTTCGGTTCAATTTGCTATCTTTCCATCTATTTTCTCTATGTTTGTGCTGTCTCAGCCACACATTTCTACTACGAAGTCGATAAAAAAGAGTTAGTTGAATCTTCATCGTCTTTTGATGATTTAGTTGAATCCGGCATACCATTATTAGGCTATGTCGATGATGATACTGATAATGATTCTAATCAGAAACCAATTATACGAAATCAAGTTGGTATTGTTAATGAAGAGACAAAAAAGGAAGAAATTTTTTCTAGCACTTACTACTTGTGGAAGTTTCTAGAAGTACTTGAATTACCACTTTGTTTACCGAGAAAACTAACTATACCCGTTGTGAGTGAAGAAAATTGGTCGAAACCATATGCAGTTATATCGGTTACCCTAGCGCCGATTTTATTTGCAATTCTTTGTAATACACAAATGGAAAATGTGGATTCAAAGAGTACTTTAGTTGCATATTTAACATCATCATTAATTGGTATTGTTTTTGGAAACATGGCATGTGTGACAACAAAAAGTACAAGACCACCTAGAAGATGTTTGTTTCCTTGGCTAGCTGGTGGATTTTCAATGAGTGTGACATGGACTTATATAATTGCTGAGGAACTTGTTTCACTTTTGATATCAATTGGATATGTAATTGGTGTTAGTCCTTCAATTTTAGGGTTAACCGTTTTAGCTTGGGGAAATTCTCTAGGTGATTTGATAGCAAATGGTGCTATGGCTAAAAATGGTGGTGTTGATGGTGCACAAATAGCTGTTTCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATGTTTAATATTTTGATGGGATTAGGGTTACCTCTTGTTCTTTCAGCTTGGGGTGAATACCCTAATTCTTATGTTGTTCCTAAGGATAGTTCACTTTTGGGGACAATTTTGTTTTTAATGGTAGGGGTACTTTGGTCACTTGTTGTATTGGTTAAGAAGAATATGAGGCTTGATAAGTTTTTAGGGGCTGGTCTCTTGACCATTTACCTTTGCTTTTTGTTTTTAAGGTTAGCTATGGCTATTGGTGTTCTTAATTAA 1779 0.353 MAPFIFTSNSKPQPKKFTLLLNTSFLFLLVFCLKLYINPSNSNSHFHHVSSKLFNHARILTSDIIVDSCTELHKYSNYTSKCLYVKTHSDCRSKGYINYLQIFYCNLGNSPILGHTLLGLWLVVLFYLLADTASNYFCTSLEGLSNILRLSPTIAGVTLLSLGNGAPDFFASVVSFTSSNNGAVGLNSILGGAFFVSTCVLGVISFLVSSKSYDVEIDKASFIRDVIFFLFSLLVLLIIIAIGKISLFGSICYLSIYFLYVCAVSATHFYYEVDKKELVESSSSFDDLVESGIPLLGYVDDDTDNDSNQKPIIRNQVGIVNEETKKEEIFSSTYYLWKFLEVLELPLCLPRKLTIPVVSEENWSKPYAVISVTLAPILFAILCNTQMENVDSKSTLVAYLTSSLIGIVFGNMACVTTKSTRPPRRCLFPWLAGGFSMSVTWTYIIAEELVSLLISIGYVIGVSPSILGLTVLAWGNSLGDLIANGAMAKNGGVDGAQIAVSGCYAGPMFNILMGLGLPLVLSAWGEYPNSYVVPKDSSLLGTILFLMVGVLWSLVVLVKKNMRLDKFLGAGLLTIYLCFLFLRLAMAIGVLN 592
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre4g03526 592 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 21 591 - -
Trre4g03526 592 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 431 584 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre4g03526 592 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 120 263 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre4g03526 592 Gene3D - 361 585 IPR044880 -
Trre4g03526 592 Gene3D - 150 293 IPR044880 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre4g03526 Trre-Chr4 42189420 42191198 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre4g03526 67 592 Antiporters AT5G17860 52.182 1.41e-176 509
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre4g03526 K13754 - gmx:100818583 807.364