LGRPv2

Gene search

Sequence information

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	Trre4g01638	ATGGCCTCAAACTTGTGTAGCTGCTTCTTTATCGTCGTCGTGTTATCAATCCTCTTTGCAACGCGGACAACATCTCAGCCACAAACATCAGATGCATGCAATGGAATATTCCTGTCGTACGCCTACACCGGCGGCACAAGGCTACCGCCGAACATATCGGACACAGTGGAGCAACCCTATCGGTTTGAGTCGACATTAACGGTGCTCAACAACGGACTCGTGGAGCTGAAGTCTTGGAAGGTATTCGTTGGGTTTCGGCACCAAGAGTGGTTGGTGTCTGCATCCAATGCGATCCTCTCGGACGGGACAAGCATCCCCAGCGCAGTTGGGAACGGCACCATTTTTGCAGGATCTTCTGTAATTGATTTGAAGACAGCTGCGGCAACTGCAGGCGACTTAACACAAATGCAGGTTCAGGTAAAGATGGTGGGGACAACATTAGGAGTTGCGCCACCAAGCGTTCCTATGCCTTCTACCATAAACCTTGCTAATGATGGATTCATATGCGGTGAACCCGCTTCTCAAGGGAACAATGAAACTCATGTATGTTGCAAAAGTGATCCTAATTTCAAGACAAAAATCACACCAAATGAAAAATTTCTACCTAGACAAAATGGTGACCTTACCATAATGTATGATGTGATCAAAGCATACAATTCCAATTATTGGTCAGAAGTAACAATTTCAAATCATAATCCTCTAGGACGTCTTGACAATTGGAAATTAAGCTGGAATTGGACAAATGATGAATTTATCCATACAATCAAAGGTGCTTATCCATTAACTATAGATTCTTCTAACTGTATTTTTGGTTCACAGGGTGAATTTTACAAGGAACTTGATTTTTCTAATGTATTGAATTGTGAAAAAAGACCTACAATAATTGATTTACCTCCAACAAGGTTCAATGATACACAACTTGGTAAAGTGCCATTTTGTTGTAGGAATGGTACTATATTACCACCATATATGGACCTTAGTAAGTCAATTTCAAGGTTTCAAATAAATGTCTTTAAAATGCCACCAAATATCAATCGGTCAAACCTTATACCGCCGCAAAATTGGGAAATTAAAGGTGAACCGATTAACCCTAATTACAAATGCGGCGCACCGATTAGGGTTAGTCCTAGTCAATCTGAAGATCCAACAGGGTTACCTTCAAACATATCTTCAATTGCAAGTTGGCAAGTTGTGTGCAACATAACTAAGTCATTATCAAAAAGTGATTCTCCTAAATGTTGTGTGTCATTTTCAGCTTATTATAATGAATCAGTTATTCCTTGTAATACATGTGCATGTGGATGTCCTAGTAATCAAGAGAGAACATGTAGTGCTAATACACCAGCTATGTGGCTTCCACCAAAAGCACTTCTTGTTCCATTTGAGAATAGAAGTAAAATAGCACATGATTGGGCTAAGTACAAAAAATTACAAGTACCTAACCCTATACCATGTGGTGATAATTGTGGTGTGAGTATAAATTGGCATGTAAACACAGATGATAAAAAAGGTTGGACTGCAAGGATCACAATTTTTAACTGGGGTGAGACGAATTTCGCCGATTGGTTTGCTGCGGTACAAATGGACAAAGCTGCAATAGGTTTTAAGGAAATGTATTCATTCAATGGAAGCTTATTAGAGAGATTAAACACTACAATATTCATGCAAGGTAAGAAAGGATTGAACTTTCTTGTAGCGGAAGCAAATGGGTCGAACCCTCGAAGAGATCCGAGGGTGCCTGGGAAACAACAGTCGGTAATTTTGTTTACGAAGAAAAAAAAGGATGAAATCAATGTCGCTGGTGGTGATGGTTTTCCTAGTAAAGTGTTCTTCAATGGAGAGGAATGCTCTCTCCCTTCGGTGTATCCAAGCAATGGTTTGAGGAATGAATTTTCCTCGGTTACTATTACGATCCTAATATTGTTGTCAATCATCTTGATGCAACAATGGTGA	1953	0.3994	MASNLCSCFFIVVVLSILFATRTTSQPQTSDACNGIFLSYAYTGGTRLPPNISDTVEQPYRFESTLTVLNNGLVELKSWKVFVGFRHQEWLVSASNAILSDGTSIPSAVGNGTIFAGSSVIDLKTAAATAGDLTQMQVQVKMVGTTLGVAPPSVPMPSTINLANDGFICGEPASQGNNETHVCCKSDPNFKTKITPNEKFLPRQNGDLTIMYDVIKAYNSNYWSEVTISNHNPLGRLDNWKLSWNWTNDEFIHTIKGAYPLTIDSSNCIFGSQGEFYKELDFSNVLNCEKRPTIIDLPPTRFNDTQLGKVPFCCRNGTILPPYMDLSKSISRFQINVFKMPPNINRSNLIPPQNWEIKGEPINPNYKCGAPIRVSPSQSEDPTGLPSNISSIASWQVVCNITKSLSKSDSPKCCVSFSAYYNESVIPCNTCACGCPSNQERTCSANTPAMWLPPKALLVPFENRSKIAHDWAKYKKLQVPNPIPCGDNCGVSINWHVNTDDKKGWTARITIFNWGETNFADWFAAVQMDKAAIGFKEMYSFNGSLLERLNTTIFMQGKKGLNFLVAEANGSNPRRDPRVPGKQQSVILFTKKKKDEINVAGGDGFPSKVFFNGEECSLPSVYPSNGLRNEFSSVTITILILLSIILMQQW	650

Annotation information

Select	Seq ID	Length	Analysis	Description	Start	End	IPR	GO
	Trre4g01638	650	PANTHER	COBRA-LIKE PROTEIN 7	22	645	-	-
	Trre4g01638	650	Pfam	COBRA-like protein	222	402	IPR006918	GO:0010215\|GO:0016020

Duplication type information

Select	Gene	Chromosome	Start	End	Duplicated_type
	Trre4g01638	Trre-Chr4	13423921	13426221	Wgd

Functional genes information

Select	Gene	Gene_start	Gene_end	Function	Ath_gene	Identity(%)	E-value	Score
	Trre4g01638	33	623	COBRA Gene Family	AT4G16120	62.290	0.0	790

Pathway information

Select	Query	KO	Definition	Second KO	KEGG Genes ID	GHOSTX Score
	Trre4g01638	-		-	vum:124836920	984.171