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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre3g03614 ATGGCTATCACAAACTCTTTGTCCAAATACATGACTTTGTTCATGAACACCTCTATCCTTTTGGTGATTTTTGTTTTCATGATTATTCACTTCAACACACCAAAAGAACTTGGTCTAGTTGTGAGGAACAATCACTCTACCTTTGTTGATGGAAGTGATGATGAACAAGATTGCAATAAATTAGACAACATAGGTAACAACAAAGACAAGTGTTTGTACCTTAAATCCAACAATTCATGTGTCTCACAAGGCTACATTGATTACCTTTACATTTTCTATTGCAAATTTGGAAAATTTCCTTTATTAGGTTACACCCTTTTGTTTCTTTGTCTCTTAGTTCTTTTTTATTTGTTGGCTAATACAACTTCTTATTATTTTTGTCCTTCACTTGAAAAATTGTCCAAATTGTTAAAATTGTCACCAACAATTTCTGGTGTCACTCTTCTCTCTCTTGGTAATGGTGCTTGTGATGTTTTCTCTAGTCTTGTTTCTTTTCAAGAAAGTGGGACTCGTAATGTTGGTTTAAACACAATTATTGGAGGTGTTTTTTTTGTGTCATGTGTTATTGTTGGGATAATTAGTATTTCAATTCATCAAAGAAATGTTCATGTTATAAAGTATGATTTTGTAAGAGATGTTTGTGTTCTACTTTTTGTTCTTCTTTGTTTGTTTTGTGTTTTGATCGTTGGTGAGATTAATTTATTTGGAGCAATTTGTTTTTGTTTGATTTATGTTGTTTATGTAATTTTTGTTTATGTCTCTTCTACTAAATGGAAAGATGGTGAGAGGGGTAATGATGGTATTTCAAGTTATAGTAATGATGATCAATTGAATTTGAATGTGCCTCTTAATGATGTGAAGAGAAGATCCATTGATTGTGTTGAAAATGATATTCAAGAATACGATTTAGGTTTGGAGAAAAATTGTTGCAACATGAAATCTTCAATATGTAGAATTTCACTTTGTGTTCTTGAGATGCCACTTTACTTGCCAAGGAGATTAACTATTCCTATTATATGTGAAGAGAAATGGTCAAAGGTATATGCAATTTCTTCAATGATATTAGCACCACTTCTCTTATCTTTTCTATGGAACACTCATAAGGGATATAGTATGTCAAGCACAAATATTATTGTTTATGGAATTGGATTATTGGTTGGAATTATATTTGGTGTAGGAGCATTTTTCACAACAGAAATGTTAGTGCCACCAAAAAAGTGTTTATTTATGTGGCTTGTAGGAGGGTTTATAATGAGTGTGACATGGAGTTACATTATAGCTCAAGAGTTGGTTGGATTGTTGGTTTCAATTGGTTTCATATGTAGAATAAGTCCTTCAATTTTAGGGTTAACCATTCTTGCTTGGGGTAACTCAATTGGTGATTTGATCACAAATTTAACAATGGCTTTAAATGGTGGACAAGAGGGGGTTCAAATAGCAATCTCAGGTTGCTATGCTGGTCCTATTTTTAATACTCTTGTTGGATTAGGAATTTCTCTTGTAAGTTCTACTTGGTCACAATATCCACAACCTATTTTGATTCCTAAAGATCCATATCTATGGGAGACATTGGTGTTTTTGGTGTTTGGATTGGTTTTTGCACTTTTGGTTTTGTTGAAAAAAGATATGAAACTTAATGGAGTATTAGGAGGAGGGCTTTTAGTTGTTTACTTCATTTCTTTGTTTTTGAGGTTGATTCAAACACAAGGGGGTCTCCAATTTTATGATATGTAA 1734 0.3241 MAITNSLSKYMTLFMNTSILLVIFVFMIIHFNTPKELGLVVRNNHSTFVDGSDDEQDCNKLDNIGNNKDKCLYLKSNNSCVSQGYIDYLYIFYCKFGKFPLLGYTLLFLCLLVLFYLLANTTSYYFCPSLEKLSKLLKLSPTISGVTLLSLGNGACDVFSSLVSFQESGTRNVGLNTIIGGVFFVSCVIVGIISISIHQRNVHVIKYDFVRDVCVLLFVLLCLFCVLIVGEINLFGAICFCLIYVVYVIFVYVSSTKWKDGERGNDGISSYSNDDQLNLNVPLNDVKRRSIDCVENDIQEYDLGLEKNCCNMKSSICRISLCVLEMPLYLPRRLTIPIICEEKWSKVYAISSMILAPLLLSFLWNTHKGYSMSSTNIIVYGIGLLVGIIFGVGAFFTTEMLVPPKKCLFMWLVGGFIMSVTWSYIIAQELVGLLVSIGFICRISPSILGLTILAWGNSIGDLITNLTMALNGGQEGVQIAISGCYAGPIFNTLVGLGISLVSSTWSQYPQPILIPKDPYLWETLVFLVFGLVFALLVLLKKDMKLNGVLGGGLLVVYFISLFLRLIQTQGGLQFYDM 577
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre3g03614 577 Gene3D - 318 565 IPR044880 -
Trre3g03614 577 Gene3D - 139 270 IPR044880 -
Trre3g03614 577 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 17 572 - -
Trre3g03614 577 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 109 252 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre3g03614 577 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 412 564 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre3g03614 Trre-Chr3 46682242 46683975 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre3g03614 14 570 Antiporters AT5G17850 50.441 9.64e-159 464
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre3g03614 K13754 - gmx:100813848 689.493