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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre3g03613 ATGGCACCTTTCATTTTCACTTCTAACTCCAAACCACAACCAAAAAAATTCACTCTTCTTCTCAACACATCCTTCCTCTTCCTCCTATTTTTTTGCCTCAAACTTTATATCAATCCTTCAAATTCTAATTCTCATTTTCATCATGTTTCCTCAAAACTTTTCAACCATGCTAGAATCCTTACAAGCGACATCATAGTTGATTCATGCACTGAACTTCACAAATACTCAAATTACACCTCTAAGTGCTTATATGTCAAAACACATTCTGATTGTAGATCAAAAGGTTACATTAATTATCTTCAAATATTTTATTGCAACCTTGGAAATTCACCAATTCTTGGTCACACGTTACTTGGTTTATGGCTTGTAGTTTTGTTCTATCTTTTAGCCGACACGGCTTCAAATTACTTTTGCACCTCCCTAGAAGGTTTGTCTAGCATCTTAAGACTATCTCCAACTATAGCTGGAGTAACATTACTCTCTCTTGGTAATGGTGCTCCTGATTTCTTTGCTAGTGTTGTTTCTTTCACAAGTTCAAATAACGGCGCAGTTGGTTTAAATAGCATTTTGGGGGGTGCATTTTTTGTTTCCACATGTGTTTTGGGAGTCATAAGTTTTTTAGTTAGTTCTAAATCTTATGATGTTGAAATTGACAAGGCTAGTTTCATTAGAGATGTCATTTTCTTCCTTTTCTCTTTGTTGATTCTTCTCATCATCATCGCCATTGGGAAAATTAGCCTTTTCGGTTCAATTTGCTATCTTTCCATCTATTTTCTATATGTTTGTGCTGTCTCAGCCACACATTTCTACTACGAAGTCGATAAAAAAGAATTAGTTGAATCTTCTTCGTCTTTTGATGATTTAGTTGAATCCGGCATACCATTATTAGGCTATGTTGACGATGATACTGATAATGATTCTAATCAGAAACCAATTATACGAAATCAAGTTGGTATTGGTAATGAAGAGACAAAAAAAGAAGAAATTTTTTCTAGCACTTACTACTTGTGGAAGTTTCTAGAAGTACTTGAATTACCACTTTGTTTACCTAGAAAACTAACTATACCCGTTGTGAGTGAAGAAAATTGGTCGAAACCATATGCAGTTATATCGGTTACCCTAGCGCCGATTTTATTTGCAATTCTTTGTAATACACAAATGGAAAATGTGGATTCAAAGAGTACTTTAGTTGCATATTTAACATCATCATTAATTGGTATTGTTTTTGGAAACATGGCATGTGTGACAACAAAAAGTACAAGACCACCTAGAAGATGTTTGTTTCCTTGGCTAGCTGGTGGATTTTCAATGAGTGTGACATGGACTTATATAATTGCTGAGGAACTTGTTTCACTTTTGATATCAATTGGATATGTAATTGGTGTTAGTCCTTCAATTTTAGGGTTAACCGTTTTAGCTTGGGGAAATTCTCTAGGTGATTTGATAGCAAATGGTGCTATGGCTAAAAATGGTGGTGTTGATGGTGCACAAATTGCTGTTTCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATGTTTAATATTTTGATGGGATTAGGGTTACCTCTTGTTCTTTCAGCTTGGGGTGAATACCCTAATTCCTATGTTGTTCCTAAGGATAGTTCACTTTTGGGGACAATTTTGTTTTTAATGGTAGGGGTACTTTGGTCACTTGTTGTATTGGTTAAGAAGAATATGAGGCTTGATAAGTTTTTAGGGGCTGGTCTCTTGACCATTTACCTTTGCTTTTTGTTTTTAAGGTTAGCTATGGCTATTGGTGTTCTTCATTAA 1779 0.3508 MAPFIFTSNSKPQPKKFTLLLNTSFLFLLFFCLKLYINPSNSNSHFHHVSSKLFNHARILTSDIIVDSCTELHKYSNYTSKCLYVKTHSDCRSKGYINYLQIFYCNLGNSPILGHTLLGLWLVVLFYLLADTASNYFCTSLEGLSSILRLSPTIAGVTLLSLGNGAPDFFASVVSFTSSNNGAVGLNSILGGAFFVSTCVLGVISFLVSSKSYDVEIDKASFIRDVIFFLFSLLILLIIIAIGKISLFGSICYLSIYFLYVCAVSATHFYYEVDKKELVESSSSFDDLVESGIPLLGYVDDDTDNDSNQKPIIRNQVGIGNEETKKEEIFSSTYYLWKFLEVLELPLCLPRKLTIPVVSEENWSKPYAVISVTLAPILFAILCNTQMENVDSKSTLVAYLTSSLIGIVFGNMACVTTKSTRPPRRCLFPWLAGGFSMSVTWTYIIAEELVSLLISIGYVIGVSPSILGLTVLAWGNSLGDLIANGAMAKNGGVDGAQIAVSGCYAGPMFNILMGLGLPLVLSAWGEYPNSYVVPKDSSLLGTILFLMVGVLWSLVVLVKKNMRLDKFLGAGLLTIYLCFLFLRLAMAIGVLH 592
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre3g03613 592 Gene3D - 361 585 IPR044880 -
Trre3g03613 592 Gene3D - 150 293 IPR044880 -
Trre3g03613 592 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 21 591 - -
Trre3g03613 592 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 431 584 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre3g03613 592 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 120 263 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre3g03613 Trre-Chr3 46672805 46674583 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre3g03613 67 591 Antiporters AT5G17860 51.901 4.11e-175 505
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre3g03613 K13754 - gmx:100818583 801.971