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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre1g01707 ATGGCTGAAGATTCAGGGATAGCAATTTTTGCATGTTATAATGCAACATTTAGTGCTACAAATGATATATGGATGACTGATGATGTTATTGTAAAACGTGTTCCTCTTTTGTGTCTCCAAATTGCTTATGATCTCTTGGTTGCTCGTTTTTTCTACTTCATCCTTAAGCCTATTCGTGCGCCCCTCATTGTTGCACAAATATTGGCTGGATTTTCTGTGAGTCCAACTCTCTTGGGAAATTTCAAACCGGTATTTGACTTGTTTTATGATCGACAAGGAATCCTAGCCATTGAAACCTTTGCAAACTTAGGAATATTGTACTATGTGTTCCTAAGTGGTTTAGAAATGAATTCAGACATAATCTTAAGATCAAGAAAAAAAGGTCCAAGCATAGCAGTTGCTGGCATTGTGACATCAATGTTAATTGGTGCTGTATTGCTTACTGTACAACACAAACTTGAAGATGAAAATGATGTTTTGTCACAAACACCTGAAGAAAATCATAAGCAATCCTATTTATTTTATTGTTTAGCACTTTCTGTCACCGGTTTCCCGGTCCTTGCAAGAATCTTAGCTAAGCTTAAGCTTTTGTATACAAAGCTTGGAAAAGATGTACTAACAGCAGCTATGTTAACTGATGCATATGGTTGGATTTTATTCACATTGTTGATTCCTTATTCTAATGATGACGGAAAACCTTTTCTCTCGGTAATCAGTACCTTATTGTTCATAGTTTTTTGTTTTACTGTGGTGAGACCTATCCTTACTCCAATCATTGAAAAGAAAACGAGTAAGAACACATGGCGTAAGTCGCAATTGTTGGACTTGTTAATGGGAGTGTTTATTTGTTCATTTATTACGGATTGTCTCGGTACGCATCCTATTGTCGGAGCTTTTGTGTTTGGATTGATTTTGCCTCATGGGAAGTTTGCTACTATGGTTATGGAAATGTCAGATGATTTTGTTTCTGGGATTTTATGTCCTGTCTTCTTTGCTGGATTTGGTTTTAAACTCAACATGCCTTTTCTTTTGAAGCAAAAATCTGCAGGTTTGATGATGGTGGTTGTGGTTTTGTTATGCATACCGAAAGTTTTGAGCTCTTTGATTGTTACTTTTTTCTTCGGTATGCCTGCTCGAGATGGTCTTGCCATTGGATTGCTTCTCAACACCAAAGGCATCATGGCTATCATACTACTAAATGTTGCTTGGGACAAAAGGATTTTGGATCCATATTGTTTCATGGTTATGATGCTTGCGATTATATTAATGACATTGATTGTTTCTCCCTTGATAAGTGCTATATACCAACCAAAATTCCGATTCATGCAATCGCAGTTAAGGACCATGCAAAAGCTAAGGTTCGATATGGAACTTCGAGTTATGGCATGTGTTCACAATACTAAACAAGCCAATGGCATGATCCATGTCCTTGAAGCAACAAATGCAACTAGAGTTTCGCCTATACATGTCTCGGTAGTTCACTTAGTTGAACTCACTAGATATGGCACAGCTATTCTTGTTTCACAAATGGATCATTCGGACAACACTGTTGGAACAGAAACAACGAACTCTGGATCACAATCGGAGTTTGAGAGCATAACTGATGCATTTGAAGAATTTGTAAAACATTACAATGCTGTTAGAGTTGACACATCAAATGTTGTCTCATCCTACACAACTATCCATGAAGATATATACAACGTAGCTGAAGAGAAACGCACAAGCTTGATTCTCCTTCCCTTTCACAAAGAGTACTCAACAATAGAAGGTGGTTTAGAAATAATCAACAATCAACATTGTGAGATAAACAAAAATGTTTTAGAACAAGCACCTTGTTCTGTAGGGATATTTGTGGATCGCGGTTTAGGATCATTATTAGAAACAAAAATGCGCATTATAATGATCTTCATTGGAGGACCTGACGATCGTGAAGCCTTGTCAATTGCGTGGAGAATGGCAGGGCATTCAGGAACAGAATTACATGTTGTGAGGATTCATTTGTTAGGTGAGTCCACAGAAAAAAACAAAGCGAAAATGAAAAAATTAAAGTCTCATCATGGAATATTATCGCCGGTTATGGACAGTGTGATGCAAAAAGAGTTAGATGAAAAGTACTTAATTTCCTTCAGGCACAAGGCAGTGAACAATAATGATTCTATTGTTTATTCAGAGAAGGAAGTGCATTCGGATATTGGCGAAGATATACCAACACTTTTGAATGAGATCGATAAACATGGATATGATCTGTATATTGTTGGACAAGGAAGTGGTAAGAACACGAAGATTTTTTCAAGGTTGTTGGAATGGTGTGACCATCCTGAACTTGGTGTTATTGGAGACATATTAGCTTCAACTAGTTTTGGTTCACAATCTTCTGTGCTTATTGTGCAACAATATATGGTTGGGAGAAAAACTTTTGTTAAACAATCTCATTGTAAATTGAAAACTGGTCCTGAAATTTTGTAG 2466 0.3686 MAEDSGIAIFACYNATFSATNDIWMTDDVIVKRVPLLCLQIAYDLLVARFFYFILKPIRAPLIVAQILAGFSVSPTLLGNFKPVFDLFYDRQGILAIETFANLGILYYVFLSGLEMNSDIILRSRKKGPSIAVAGIVTSMLIGAVLLTVQHKLEDENDVLSQTPEENHKQSYLFYCLALSVTGFPVLARILAKLKLLYTKLGKDVLTAAMLTDAYGWILFTLLIPYSNDDGKPFLSVISTLLFIVFCFTVVRPILTPIIEKKTSKNTWRKSQLLDLLMGVFICSFITDCLGTHPIVGAFVFGLILPHGKFATMVMEMSDDFVSGILCPVFFAGFGFKLNMPFLLKQKSAGLMMVVVVLLCIPKVLSSLIVTFFFGMPARDGLAIGLLLNTKGIMAIILLNVAWDKRILDPYCFMVMMLAIILMTLIVSPLISAIYQPKFRFMQSQLRTMQKLRFDMELRVMACVHNTKQANGMIHVLEATNATRVSPIHVSVVHLVELTRYGTAILVSQMDHSDNTVGTETTNSGSQSEFESITDAFEEFVKHYNAVRVDTSNVVSSYTTIHEDIYNVAEEKRTSLILLPFHKEYSTIEGGLEIINNQHCEINKNVLEQAPCSVGIFVDRGLGSLLETKMRIIMIFIGGPDDREALSIAWRMAGHSGTELHVVRIHLLGESTEKNKAKMKKLKSHHGILSPVMDSVMQKELDEKYLISFRHKAVNNNDSIVYSEKEVHSDIGEDIPTLLNEIDKHGYDLYIVGQGSGKNTKIFSRLLEWCDHPELGVIGDILASTSFGSQSSVLIVQQYMVGRKTFVKQSHCKLKTGPEIL 821
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre1g01707 821 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 27 799 - -
Trre1g01707 821 Gene3D - 36 441 IPR038770 -
Trre1g01707 821 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 46 430 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre1g01707 Trre-Chr1 13216382 13219204 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre1g01707 3 800 Antiporter Super Family AT2G13620 39.157 0.0 547
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre1g01707 - - psat:127095231 1132.47