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4764
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre1g01452 4764 ProSiteProfiles Zinc finger RING-type profile. 4718 4752 IPR001841 -
Trre1g01452 4764 Gene3D Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) 4693 4763 IPR013083 -
Trre1g01452 4764 SMART ring_2 4718 4751 IPR001841 -
Trre1g01452 4764 MobiDBLite consensus disorder prediction 4610 4642 - -
Trre1g01452 4764 SUPERFAMILY RING/U-box 4717 4758 - -
Trre1g01452 4764 SUPERFAMILY ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase 31 135 IPR036890 -
Trre1g01452 4764 PANTHER SACSIN 9 1919 - -
Trre1g01452 4764 Pfam Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) 4718 4757 - -
Trre1g01452 4764 SUPERFAMILY ATPase domain of HSP90 chaperone/DNA topoisomerase II/histidine kinase 1384 1566 IPR036890 -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre1g01452 Trre-Chr1 10975680 10998785 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre1g01452 4674 4762 C3H Transcription Factor Family AT1G73950 33.333 3.98e-09 60.5
       

Pathway information


Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre1g01452 K17592 - gmx:100789980 7932.79