Gene search

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre16g00775 ATGAAGGCTCTGAATGGGTTATTGGGATTAAGACGCAAAAAAATTCATGGGGTTTTCAATGGTTTGTGTGCTTTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTACAATAGGGAAGATATAATTCGTAATCCACTTCTTAGAGAATCTGCATATTTGGTTAATCATCATGGTTTATCTCAAAATTCGATTTTGAAAGATGGGGTTTCTGTGATTCACCGTAGAATGGTTGAGAATAGTGCTAACACTTCAAGTGTAGATGATGACAAAGATTTGGTTGTTAATAGGCCTGGATTGTCAATCCTCAGTGCACTTCTGAAGGATTATTTTTGTCCTTCACTCGAGCATCTTTCAAGGCTCTTGAAATTGCCTCCGACTGTTGCTGGTGTTGTGTTGCTTCCACTCGGGAATGGGGCGCCTGATGTGTTTGCTAGTATAGCTTCGTTTGTTGGGACTGATACGGGTGAAGTTGGTCTTAACAGTGTGTTAGGTGGTGCTCTTTTTGTTACTACTGTTGTTGTTGGAACTGTTTCTCTTTGTGTTGCAGAGAGGGAGGTTCAAATTGATCGACGATGCTTTATACGGGATCTGAGTTTCTTTCTGTTCACTCTTTTTTCACTGCTTTTGATTTTGTTTGTTGGTAAGATAGGTATTGGGGCAGCAATTGCTTTTGTATCGATTTATATTGTTTATGCATTCATTGTTGCTGCCAATGAGATATTGCGGAAACATGCACGGAGGTTGAAATTGGATGCCGTGACACCTATGCTTCCTGTCCAAGGAAGTGTGTTCTCGATTGGTTCTGAAGAGGATACTACTATATATAGCTCTTTGCTTGACTTAGATATTGAGAGTGATCCTCCCCGTCTCCCTCCTTCCTTGCCTCAGTGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATATATTCAAACCAGTCAAGTAAAATAAGTTTTTTAGATGATGAAAGGCCTCCTTGGGGATGGAGTGATGGATCCACAGAAAACACCAGGTCGTCGTTCACTGTATCAAAGCTTTTTTTACTCATGGAGATGCCACTTGCAATTCCTAGACGCCTAACAATTCCAATGGTTCACGAGGAAGTATGGTCGAAGCCGTTCGGTATAGCCAGTGCTTCATTGGCTCCCATTCTCTTGGCCTTTTTGTTTAGCACCCAAGATAATGTGAGTTCTACAAGTATTATACTTGCTTATTGTTTTGGTGTTTCTTTTGGATGCACCCTTGGTGTTCTTGCATATAAATACACCGAATCTGATCGTCCTCCGTCTCAGTACTTGATTCCCTGGGTTCTTGGAGGATTCATTATGAGCATAGTGTGGTTCTACATAATAGCAAATGAACTTGTGGCTCTGTTAGTAGCATTCGGTCTAATGTTTGGAATTAATCCATCAATTCTGGGATTAACTGTATTAGCATGGGGAAATTCAATGGGAGATTTAATGTCAAATGTTGCATTGGCATTGGATGGGCAAGATGGAGTTCAGATAGCTTTATCTGGATGCTTTGCAGGTCCTATGTTCAACACACTTGTTGGTTTGGGGATCTCGTTGCTGCTTGGTGCATGGTCAAAGAAACCTTCTTCTTACGTAGTGCCTAAAGACGGTAGCTTATTTTACACCATGGGATTTCTTATCACAGGACTTCTATGGTCACTTATTGTTTTACCGCGCAACAACATGCATCCTAGCAAAATATTAGGAATGGGTCTCATCGCCCTTTATATGTTATTTCTTTCTTTCAGAGTGTGTACTTCTATGGGGATGATAACAATGGCTGGTTTAAGTTAG 1785 0.4067 MKALNGLLGLRRKKIHGVFNGLCALVVFFFFYNREDIIRNPLLRESAYLVNHHGLSQNSILKDGVSVIHRRMVENSANTSSVDDDKDLVVNRPGLSILSALLKDYFCPSLEHLSRLLKLPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFASIASFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTTVVVGTVSLCVAEREVQIDRRCFIRDLSFFLFTLFSLLLILFVGKIGIGAAIAFVSIYIVYAFIVAANEILRKHARRLKLDAVTPMLPVQGSVFSIGSEEDTTIYSSLLDLDIESDPPRLPPSLPQWMWSSNVAIYSNQSSKISFLDDERPPWGWSDGSTENTRSSFTVSKLFLLMEMPLAIPRRLTIPMVHEEVWSKPFGIASASLAPILLAFLFSTQDNVSSTSIILAYCFGVSFGCTLGVLAYKYTESDRPPSQYLIPWVLGGFIMSIVWFYIIANELVALLVAFGLMFGINPSILGLTVLAWGNSMGDLMSNVALALDGQDGVQIALSGCFAGPMFNTLVGLGISLLLGAWSKKPSSYVVPKDGSLFYTMGFLITGLLWSLIVLPRNNMHPSKILGMGLIALYMLFLSFRVCTSMGMITMAGLS 594
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre16g00775 594 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 97 588 - -
Trre16g00775 594 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 429 580 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre16g00775 594 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 97 231 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre16g00775 594 Gene3D - 119 252 IPR044880 -
Trre16g00775 594 Gene3D - 367 582 IPR044880 -
Trre16g00775 594 FunFam Cation/calcium exchanger 5 366 582 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre16g00775 Trre-Chr16 5900975 5902933 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre16g00775 105 588 Antiporters AT5G17860 41.031 1.04e-111 343
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre16g00775 K13754 - gmx:100796101 889.412