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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre15g00775 ATGAAGGCTCTGAATGGGTTATTGGGATTAAGACGCAAAAAAATTCATGGGGTTTTCAATGGTTTGTGTGCTTTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTACAATAGGGAAGATATAATTCGTAATCCACTTCTTAGAGAATCTGCATATTTGGTTAATCATCATGGTTTATCTCAAAATTTGATTTTGAATGATGGGGTTTCTGTGATTCACCGTAGAATGGTTGAGATTAGTGCTAACACTTCAAGTGTAGATGATGACAATGATTTGGTTGTTAATAGGCCTGGGTTGTGTGTTGGATTGCTTCAACATGATGGTTATAGAAGCTCTTGTGAATTCTTAAAGGTCAATCCTCTGTGTACTTCTGAAGGGTATGTTGATTACTTGAGGTTTTTCTATTGTAAATGTCAAAATTTTAGGGTTCTTGGTTATCTAGTATTGGGTGTTTGGCTTGCTGCTTTGTTTTATCTCCTGGGGAATACTGCTGCAGATTATTTTTGTCCTTCACTCGAGCATCTTTCAAGGCTCTTGAAATTGCCTCCGACTGTTGCTGGTGTTGTGTTGCTTCCACTTGGGAATGGGGCACCTGATGTGTTTGCTAGTATAGCTTCGTTTGTTGGGACTGATACGGGTGAAGTTGGTCTTAACAGTGTGTTAGGTGGTGCTCTTTTTGTTACTACTGTTGTTGTTGGAACTGTTTCTCTTTGTGTTGCAGAGAGGGAGGTTCAAATTGATCGACGATGCTTTATACGGGATCTGAGTTTCTTTCTGTTCACTCTTTTTTCACTGCTTTTGATTTTGTTTGTTGGTAAGATAGGTATTGGGGCAGCAATTGCTTTTGTATCGATTTATATTGTTTATGCATTCATTGTTGCTGCCAATGAGATATTGCGGAAACATGCACGGAGGTTGAAATTGGATGCAGTGACACCTATGCTTCCTGTCCAAGGAAGTGTGTTCTCGATTGGTTCTGAAGAGGATACTACTATATATAGCTCTTTGCTTGACTTAGACATTGAGAGTGATCCTCCCCGTCTCCCTCCTTCCTTGCCTCAATGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATATATTCAAACCAGTCAAGTAAAATCAATTTTTTAGAGGATGAAAGGCCTCCTTGGGGATGGAGTGATGGATCCACGGAAAACACCAGGCCGTCGTTCACTGTATCAAAGCTTTTTTTACTCATGGAGATGCCACTTGCAATTCCTAGACGCCTAACAATTCCAGTGGTTCACGAGGAAGTATGGTCGAAGCCATTCGGTATAGCCAGTGCTTCATTGGCTCCCATTCTCTTGGCCTTTTTGTTTAGCACCCAAGATAATGTGAGTTCTACAAGTATTATACTTGCTTATTGTTTTGGTGTTTCTTTTGGATGCACCCTTGGTGTTCTTGCATACAAATACACCGAACCTGATCGTCCGCCGTCTCAGTACTTGATTCCTTGGGTTCTTGGAGGATTCATCATGAGCATAGTGTGGTTCTACATAATAGCAAATGAACTTGTGGCTCTGTTAGTAGCATTCGGTCTAATGTTTGGAATTAATCCATCAATTCTGGGATTAACTGTATTAGCATGGGGAAATTCAATGGGAGATTTAATGTCAAATGTCGCATTGGCATTGGATGGGCAAGATGGAGTTCAGATAGCTTTATCTGGATGCTTTGCAGGTCCTATGTTCAACACACTTGTTGGTTTGGGGATCTCCTTGCTGCTTGGTGCATGGTCAAAGAAACCTTCTTCTTACGTAGTGCCTAAAGACGGTAGCTTATTTTACACCATGGGATTTCTTATCACAGGACTTCTATGGTCACTTATTGTCTTACCGCGCAACAACATGCATCCTAGCAAAATATTAGGAATGGGTCTCATCGCCCTTTATATGCTATTTCTTTCTTTCAGAGTGTGTACTTCTATGGGGATAATAACAATGGCTGGTTTGAGTTAG 1959 0.4058 MKALNGLLGLRRKKIHGVFNGLCALVVFFFFYNREDIIRNPLLRESAYLVNHHGLSQNLILNDGVSVIHRRMVEISANTSSVDDDNDLVVNRPGLCVGLLQHDGYRSSCEFLKVNPLCTSEGYVDYLRFFYCKCQNFRVLGYLVLGVWLAALFYLLGNTAADYFCPSLEHLSRLLKLPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFASIASFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTTVVVGTVSLCVAEREVQIDRRCFIRDLSFFLFTLFSLLLILFVGKIGIGAAIAFVSIYIVYAFIVAANEILRKHARRLKLDAVTPMLPVQGSVFSIGSEEDTTIYSSLLDLDIESDPPRLPPSLPQWMWSSNVAIYSNQSSKINFLEDERPPWGWSDGSTENTRPSFTVSKLFLLMEMPLAIPRRLTIPVVHEEVWSKPFGIASASLAPILLAFLFSTQDNVSSTSIILAYCFGVSFGCTLGVLAYKYTEPDRPPSQYLIPWVLGGFIMSIVWFYIIANELVALLVAFGLMFGINPSILGLTVLAWGNSMGDLMSNVALALDGQDGVQIALSGCFAGPMFNTLVGLGISLLLGAWSKKPSSYVVPKDGSLFYTMGFLITGLLWSLIVLPRNNMHPSKILGMGLIALYMLFLSFRVCTSMGIITMAGLS 652
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre15g00775 652 Gene3D - 177 310 IPR044880 -
Trre15g00775 652 Gene3D - 424 640 IPR044880 -
Trre15g00775 652 FunFam Cation/calcium exchanger 5 424 640 - -
Trre15g00775 652 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 20 646 - -
Trre15g00775 652 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 147 289 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre15g00775 652 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 487 638 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre15g00775 Trre-Chr15 5703164 5705122 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre15g00775 96 644 Antiporters AT5G17850 42.315 1.14e-123 376
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre15g00775 K13754 - gmx:100796101 1080.09
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Trre15g00775 15 5703164 5705122 Trre15g00775 15 5703164 5705122 ECH