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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre15g00774 ATGAAGGCTCTGAATGGGTTATTGGGATTAAGACGCAAAAAAATTCATGGGGTTTTCAATGGTTTGTGTGCTTTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTACAATAGGGAAGATATAATTCGTAATCCACTTCTTAGAGAATCTGCATATTTGGTTAATCATCATGGTTTATCTCAAAATTTGATTTTGAATGATGGGGTTTCTGTGATTCACCGTAGAATGGTTGAGATTAGTGCTAACACTTCAAGTGTAGATGATGACAATGATTTGGTTGTTAATAGGCCTGGGTTGGTTCTTGGTTATCTAGTATTGGGTGTTTGGCTTGCTGCTTTGTTTTATCTCCTGGGGAATACTGCTGCAGATTATTTTTGTCCTTCACTCGAGCATCTTTCAAGGCTCTTGAAATTGCCTCCGACTGTTGCTGGTGTTGTGTTGCTTCCACTTGGGAATGGGGCACCTGATGTGTTTGCTAGTATAGCTTCGTTTGTTGGGACTGATACGGGTGAAGTTGGTCTTAACAGTGTGTTAGGTGGTGCTCTTTTTGTTACTACTGTTGTTGTTGGAACTGTTTCTCTTTGTGTTGCAGAGAGGGAGGTTCAAATTGATCGACGATGCTTTATACGGGATCTGAGTTTCTTTCTGTTCACTCTTTTTTCACTGCTTTTGATTTTGTTTGTTGGTAAGATAGGTATTGGGGCAGCAATTGCTTTTGTATCGATTTATATTGTTTATGCATTCATTGTTGCTGCCAATGAGATATTGCGGAAACATGCACGGAGGTTGAAATTGGATGCAGTGACACCTATGCTTCCTGTCCAAGGAAGTGTGTTCTCGATTGGTTCTGAAGAGGATACTACTATATATAGCTCTTTGCTTGACTTAGACATTGAGAGTGATCCTCCCCGTCTCCCTCCTTCCTTGCCTCAATGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATATATTCAAACCAGTCAAGTAAAATCAATTTTTTAGAGGATGAAAGGCCTCCTTGGGGATGGAGTGATGGATCCACGGAAAACACCAGGCCGTCGTTCACTGTATCAAAGCTTTTTTTACTCATGGAGATGCCACTTGCAATTCCTAGACGCCTAACAATTCCAGTGGTTCACGAGGAAGTATGGTCGAAGCCATTCGGTATAGCCAGTGCTTCATTGGCTCCCATTCTCTTGGCCTTTTTGTTTAGCACCCAAGATAATGTGAGTTCTACAAGTATTATACTTGCTTATTGTTTTGGTGTTTCTTTTGGATGCACCCTTGGTGTTCTTGCATACAAATACACCGAACCTGATCGTCCGCCGTCTCAGTACTTGATTCCTTGGGTTCTTGGAGGATTCATCATGAGCATAGTGTGGTTCTACATAATAGCAAATGAACTTGTGGCTCTGTTAGTAGCATTCGGTCTAATGTTTGGAATTAATCCATCAATTCTGGGATTAACTGTATTAGCATGGGGAAATTCAATGGGAGATTTAATGTCAAATGTCGCATTGGCATTGGATGGGCAAGATGGAGTTCAGATAGCTTTATCTGGATGCTTTGCAGGTCCTATGTTCAACACACTTGTTGGTTTGGGGATCTCCTTGCTGCTTGGTGCATGGTCAAAGAAACCTTCTTCTTACGTAGTGCCTAAAGACGGTAGCTTATTTTACACCATGGGATTTCTTATCACAGGACTTCTATGGTCACTTATTGTCTTACCGCGCAACAACATGCATCCTAGCAAAATATTAGGAATGGGTCTCATCGCCCTTTATATGCTATTTCTTTCTTTCAGAGTGTGTACTTCTATGGGGATAATAACAATGGCTGGTTTGAGTTAG 1830 0.4104 MKALNGLLGLRRKKIHGVFNGLCALVVFFFFYNREDIIRNPLLRESAYLVNHHGLSQNLILNDGVSVIHRRMVEISANTSSVDDDNDLVVNRPGLVLGYLVLGVWLAALFYLLGNTAADYFCPSLEHLSRLLKLPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFASIASFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTTVVVGTVSLCVAEREVQIDRRCFIRDLSFFLFTLFSLLLILFVGKIGIGAAIAFVSIYIVYAFIVAANEILRKHARRLKLDAVTPMLPVQGSVFSIGSEEDTTIYSSLLDLDIESDPPRLPPSLPQWMWSSNVAIYSNQSSKINFLEDERPPWGWSDGSTENTRPSFTVSKLFLLMEMPLAIPRRLTIPVVHEEVWSKPFGIASASLAPILLAFLFSTQDNVSSTSIILAYCFGVSFGCTLGVLAYKYTEPDRPPSQYLIPWVLGGFIMSIVWFYIIANELVALLVAFGLMFGINPSILGLTVLAWGNSMGDLMSNVALALDGQDGVQIALSGCFAGPMFNTLVGLGISLLLGAWSKKPSSYVVPKDGSLFYTMGFLITGLLWSLIVLPRNNMHPSKILGMGLIALYMLFLSFRVCTSMGIITMAGLS 609
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre15g00774 609 Gene3D - 134 267 IPR044880 -
Trre15g00774 609 Gene3D - 381 597 IPR044880 -
Trre15g00774 609 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 95 603 - -
Trre15g00774 609 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 104 246 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre15g00774 609 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 444 595 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre15g00774 609 FunFam Cation/calcium exchanger 5 381 597 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre15g00774 Trre-Chr15 5703164 5705122 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre15g00774 114 601 Antiporters AT5G17850 42.073 3.34e-110 340
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre15g00774 K13754 - gmx:100796101 980.319