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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre14g02832 ATGTCACAATCCAAACGCTTGTTTTTCACTTTGTTCTTAAACACCTCGTTCCTTTTCTTGTTTTGTGTTTTTCTTGTTCTTCACTTTGAATCCTCTGAACATGTTTTTCTTAGAACCAAAACCAACAACAAAGTCAAAAACAAAAACTTTGTCTTTAGTGTTGTTAGTAATGATATTGATGAAGATTGTAAGAGTTTTCATAGTTTAAGTGATTATAAAGCTAAATGCTTTTACCTTAAATCAAACAACCCATGTGTCTCACAAGGCTATGTTGATTATCTTTACCTTTTCTATTGCAAAATTGGAAATTTCCCTTTATTGGGTCATACCCTTTTGTTTCTATGGCTATTGGTTCTCTTCTATCTTCTAGCTAATACAGCTTCTGAATACTTTTGTCCTTCTCTTGATAATCTCTCCAAAGTTTTGAGACTTTCACCAACAATTGCTGGTGTTACTCTTCTCTCTCTTGGTAATGGTGCTAATGATGTTTTTGCTACACTTGTTTCTTTCAAAGGTAATGGAACACAAGACATTGGTTTCAACACTGTTCTTGGTGGTGGTTCCTTTATTTCATGTGTTGTTGTGGGAATTATAAGTATATCAGTTAGACATAAAGGGATTCGTGTTAAAAAATCTGCTTTGATAAGAGATGTTTGTTTTCTTCTCTTTGTTCTTGTTTGTCTTTTCACTATCTTCATCAGTGGTGAAATCAATGTTGTTGTAGCAATTGGTTTTTGTTTGATGTATGTGGTCTATGTTGGTGTTGTTTATGTCTCATCTAGTAAAAGAAAAGGTCTTTGTGATGAAGATGCTGAAATTGAAACTGAAAGTGATTATGGTGATGATTCAAGGAATGGTAACTGCAATGATTTAAGTGTTCCTCTACTTGGTTACATGGAGAAAGGAATGATTCATTGTACTTCAAATGGTGCTCAAGAATGTGAGTTTAAAATTGACAAGAATTGTTGCAATGAAAAATCTTCATTTTGTAGAATATTAGTTTGTGTCTTGAATATGCCACTTTACTTGCCTAGAAGATTAACAATTCCTGTTATTTGTGAAGAAAAATGGTCTAAGGTATATGCAGTTTCATCAGCTATATTATCACCAGTTTTATTAGCTTTTCTTTGGATTCCAAACAATGAAAACAGTTTCTCAAGTTCATCAAGCTTAATAGTTTATGGAATTGGATTATTGGTTGGAATGATATTAGGAGTAACAGCAATTTTCACAACTGAGTCATCAAATCCACCAAAAAAGTGCTTATTACCATGGTTAGCTGCAGGGTTTGTGATGAGTGTGACATGGAGTTACATTTCAGCTCAAGAATTAGTAGGATTGTTAGTTTCACTTGGTTTCATATGTGGTGTTAATCCATCAATACTTGGATTAACAGTACTTGCTTGGGGGAATTCAATTGGTGATTTAGTGACTAATTTGACAATGGCTTTAAATGGTGGACCAGAGGGGGCTCAAATAGCAATTTCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATATTCAATACAGTTATTGGATTAGGTTTATCACTTGTTACCACAACTTGGTGTGAGTACCCTTCATCTATTGTGATACCTAAAGATCCATATTTGTGGGAAACATTGGCATTTTTGGTTATTGGATTGATTTGGGCACTTGTTGTTTTGATTAAAAGAGATATGAAGCTTGATGCAATGTTAGGTGGAGGACTTTTAGCTATTTACTTTAGTTCTCTTATTCTTAGGCTTATTCAAACACTTGGAACACTTCAATTTAAGGATATGTTAGTGTGA 1782 0.3373 MSQSKRLFFTLFLNTSFLFLFCVFLVLHFESSEHVFLRTKTNNKVKNKNFVFSVVSNDIDEDCKSFHSLSDYKAKCFYLKSNNPCVSQGYVDYLYLFYCKIGNFPLLGHTLLFLWLLVLFYLLANTASEYFCPSLDNLSKVLRLSPTIAGVTLLSLGNGANDVFATLVSFKGNGTQDIGFNTVLGGGSFISCVVVGIISISVRHKGIRVKKSALIRDVCFLLFVLVCLFTIFISGEINVVVAIGFCLMYVVYVGVVYVSSSKRKGLCDEDAEIETESDYGDDSRNGNCNDLSVPLLGYMEKGMIHCTSNGAQECEFKIDKNCCNEKSSFCRILVCVLNMPLYLPRRLTIPVICEEKWSKVYAVSSAILSPVLLAFLWIPNNENSFSSSSSLIVYGIGLLVGMILGVTAIFTTESSNPPKKCLLPWLAAGFVMSVTWSYISAQELVGLLVSLGFICGVNPSILGLTVLAWGNSIGDLVTNLTMALNGGPEGAQIAISGCYAGPIFNTVIGLGLSLVTTTWCEYPSSIVIPKDPYLWETLAFLVIGLIWALVVLIKRDMKLDAMLGGGLLAIYFSSLILRLIQTLGTLQFKDMLV 593
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre14g02832 593 Gene3D - 328 579 IPR044880 -
Trre14g02832 593 Gene3D - 144 269 IPR044880 -
Trre14g02832 593 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 14 587 - -
Trre14g02832 593 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 426 578 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre14g02832 593 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 113 257 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre14g02832 Trre-Chr14 29722892 29724673 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre14g02832 53 584 Antiporters AT5G17850 53.731 9.86e-167 484
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre14g02832 K13754 - gmx:100787016 764.222