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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre13g02867 ATGTCACAATCCAAACGCTTGTTTTTCACTTTGTTCTTAAACACCTCGTTCCTTTTCTTGTTTTGTGTTTTTCTTGTTCTTCACTTTGAATCCTCAGAACATGTTTTTCTTAGAACCAAAACCAACAACAAAGTCAAAAACAAAAACTTTGTCTTTAGTGTTAGTAATGATATTGATGAAGATTGTAAGAGTTTTCATAGCTTAAGTGATTATAAAGCTAAGTGCTTTTACCTTAAATCAAACAACCCATGTGTCTCACAAGGCTATGTTGATTATCTTTACCTTTTTTATTGCAAAATTGGAAATTTCCCTTTATTGGGTCATACCCTTTTGTTTCTATGGCTATTGGTTCTCTTCTATCTTCTAGCTAATACAGCTTCTGAATACTTTTGTCCTTCTCTTGATAATCTCTCCAAAGTTTTGAGACTTTCACCAACAATTGCTGGTGTTACTCTTCTCTCTCTTGGTAATGGTGCTAATGATGTTTTTGCAACATTTGTTTCTTTCAAAGGTAATGGAACACAAGACATTGGTTTCAACACTGTTCTTGGTGGTGGTTCCTTTATTTCATGTGTTGTTGTGGGAATTATAAGTATATCAGTTAGACATAAAGGGATTCGTGTTAAAAAATCTGCTTTGATAAGAGATGTTTGTTTTCTTCTCTTTGTTCTTGTTTGTCTTTTCACTATTTTCATCAGTGGTGAAATCAATGTTGTTGTAGCAATTGGTTTTTGTTTGATGTATGTGGTCTATGTTGGTGTTGTTTATGTCTCATCTAGTAAAAGAAAAGGTGTTTGTGATGAAGATGCTGAAATTGAAATTGAAACTGAAAGTGATTATGGTGATGATTCAAGGCATGGTAATTGCAATGATTTAAGTGTTCCTCTACTTGGTTATATGGAGAAAGGAATGATTCATTGTACTTCAAATGGTGCTCAAGAATGTGAGTTTAAAATTGACAAGAATAGTTGCAATGAAAAATCTTCATTTTGTAGAATATTACTTTGTGTCTTGAATATGCCACTTTACTTGCCTAGAAGATTAACAATTCCTGTTATTTGTGAAGAAAAATGGTCTAAGGTATATGCAGTTTCATCAGCTATATTATCACCACTTTTATTAGCTTTTCTTTGGATTCCAAACAATGAAAACAGTTTCTCAAGTTCATCAAGCGTAATAGTTTATGGAATTGGATTATTGGTTGGAATCATATTAGGAGTAATAGCAATTTTCACAACTGAATCATCAAATCCACCAAAAAAGTACTTATTACCATGGCTAGCTGCAGGGTTTGTGATGAGTGTGACATGGAGTTACATTTCAGCTCAAGAATTAGTAGGATTGTTAGTTTCACTTGGTTTCATATGTGGTGTTAATCCATCAATACTTGGATTAACAGTACTTGCTTGGGGGAATTCAATTGGTGATTTAGTGACTAATTTGACAATGGCTTTAAATGGTGGACCAGAGGGGGCTCAAATAGCAATTTCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATATTCAATACAGTTGTTGGATTAGGTTTATCACTTGTTACCACAACTTGGTGTGAGTACCCTTCATCTATTGTGATACCTAAAGATCCATATTTGTGGGAAACATTGGCATTTTTGGTTATTGGATTGATTTGGGCACTTGTTGTCTTGATTAAAAGAGATATGAAGCTTGATGCAATGTTAGGTGGAGGACTTTTAGCTATTTACTTTAGTTCTCTTATTCTTAGGCTTATTCAAACACTTGGAACACTTCAATTTAAGGATATGTTAGTGTGA 1785 0.3361 MSQSKRLFFTLFLNTSFLFLFCVFLVLHFESSEHVFLRTKTNNKVKNKNFVFSVSNDIDEDCKSFHSLSDYKAKCFYLKSNNPCVSQGYVDYLYLFYCKIGNFPLLGHTLLFLWLLVLFYLLANTASEYFCPSLDNLSKVLRLSPTIAGVTLLSLGNGANDVFATFVSFKGNGTQDIGFNTVLGGGSFISCVVVGIISISVRHKGIRVKKSALIRDVCFLLFVLVCLFTIFISGEINVVVAIGFCLMYVVYVGVVYVSSSKRKGVCDEDAEIEIETESDYGDDSRHGNCNDLSVPLLGYMEKGMIHCTSNGAQECEFKIDKNSCNEKSSFCRILLCVLNMPLYLPRRLTIPVICEEKWSKVYAVSSAILSPLLLAFLWIPNNENSFSSSSSVIVYGIGLLVGIILGVIAIFTTESSNPPKKYLLPWLAAGFVMSVTWSYISAQELVGLLVSLGFICGVNPSILGLTVLAWGNSIGDLVTNLTMALNGGPEGAQIAISGCYAGPIFNTVVGLGLSLVTTTWCEYPSSIVIPKDPYLWETLAFLVIGLIWALVVLIKRDMKLDAMLGGGLLAIYFSSLILRLIQTLGTLQFKDMLV 594
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre13g02867 594 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 14 588 - -
Trre13g02867 594 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 112 256 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre13g02867 594 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 427 579 IPR004837 GO:0016020|GO:0055085
Trre13g02867 594 Gene3D - 330 580 IPR044880 -
Trre13g02867 594 Gene3D - 143 268 IPR044880 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre13g02867 Trre-Chr13 28158161 28159945 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre13g02867 59 585 Antiporters AT5G17850 53.861 1.84e-167 486
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre13g02867 K13754 - gmx:100787016 766.533