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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre12g01184 ATGAGCATTGTTGGTCTAATCTTTGCAGCTACATTCAATAATAATTGGACTGGAAAATTGAAGATGATATTTTCCTTTGATTCACAAGAAAATCTAGGACTAATATCAATATTTGGTTACATGCTTTTTCTTTTCTACATTGGTGTCAAAACTGATATGAGTGTTGTCCATAAAACAAAAAATGGTGTGACAAACATAGGTTCTTTTGCTATAATAGCTCCATATCTATGTAGTATGGCGGTTCTAAATTCCTACTCATCAAAATACCTACAACCTTTGGAAGTAAACATCCTTGGAGCTATCATTGGATTGTTCTGTATGGTATCATTTCCTGTGATTTCCTCAACTTTAAGTGATATAAAGATTCTCAATTCAGAATTGGGTCGAATCGGTCTATCAGCATCATTAGTTAGTGAGATTTTCAATGTGTTCTTAGCATCATTGATAACATTTTCTAAATTATACGGAGAGCGTGGTCCAAAGAATGCTTTGGTTTGTGTTGCAGCCGCTATCTTGTATATACTCATGGTTATATTCATTATTCGACCCGCGATGTTTTGGATAATAAAACAAACACCAGAAGGTTCACATGTGAGTGATAACTATGTCTATAGTATACTCATATTAACTTTGTTCTCAGGTTATGCTTCATATAAATTTGGATTCTTTGTACTCTTTGGACCATTTATATTGGGTTTGGCTATTCCAGAAGGACCTCCATTAGGCACAGCTATTGTTAAAAAAATTGAAACTGTTGTTAATGAGATTTTCATGCCAATATTTGTGACTACATGTTGTATGAGGGTAGATTTGGCAGATTTGATGGTTTGGAGAAATGCAAGTGATGGAAGTGTTGATTATTTTATGGTGCAAACTGTGGTTATTGTTGAAGTCATTGTTGTTGCCAAATTTATTGCTTGTATGATAATTCCTTTACGCTTTGGGATGCCATGGAATGATGCTATTTGTTTATCTTTAATTATGAGTTCCAAAGGTGTTGTGGAAATGGCTGCTTTCTCTTTGATCAGAGATTCCAAAGGTCTACCAGATAACATTTATTCATTATTGATGATGTGCATCATAGTAAACGGAACATTAATTCCAATGATGTTGCGTTATATGTACGATCCCACAAAGAAATACGCCGGTTACACAAAGAGAAACATAATAGATCTAAAAAGTAACTCAGAACTTCGAGTTTTAACATGTATTCATAGACCAGACAACATTCCAGCAACAATAAATCTTCTAGAAGCAACATATCCAACAAAAGAAGAACCAATTTGCAATTATGCACTTCAACTTGTTGAATTAATAGGAAGAGCTTCTCCAATTTTCATCTGTCATAATCTTCAAAGAAAGAAGAAATTAAATTCAAACACATCAATAGCAGATAAGTTACTAGAATCATTTCAAAGTCTTGAAAGAGAGTTCGAAAATTGTTTAGTTGTCAATGCATTCACAGCTATCTCGCCACTAGAAATGATGTACGACGATATATGTACATTAGCACTCGATAAGTATACATCGCTTATCATACTTCCTTTCCATCGAAAATGGTCTTGTGATGGTAACTCGATCGAGCTAGAAGATGAGTCATTAAGGGATATAAACTATAGAGTTATGGAAAGAGCACCATGTTCCGTTGGAGTTTTAATCGAGCGAGCACAAATGGCACATATATTTTCACCGGAAACGCCGTATAAAGTGTGTTTGTTATTTATAGGGGGGAAAGATGATAGAGAAGCACTTTTTTTCACAAAGAGAATGTCTAAGAATCCACATGTTAAACTTACCGTGGTTCGATTCTTGTCATTCGATGCTGTTGATGAAGATTCGAACGGAAATGGTTGGGAAGGTTTACTTGATAATGAACTATTGGATGAAATAAAGACAAATAATAAAATTGGTAATGTTAGTGTTAGATATGTTGAGGAAAAAGTGAAAGATGGACCAGAAACAGCATTGATTATAAGATCTTATGTAACTGAATTTGATTTGATTATTGTTGGGAGACAAGCTGGAGTTGAAACTCCTCAAACTTCTGGATTATTGCAATGGAGTGAGTATCCTGAACTTGGTGTTTTGGGTGATTTGTTGGTTTCTACTGATGCTGGTGGAAAAGCTTCGGTTTTTGTTATACAACAACAAAGAACAGCTATGGATGTTTAA 2172 0.3448 MSIVGLIFAATFNNNWTGKLKMIFSFDSQENLGLISIFGYMLFLFYIGVKTDMSVVHKTKNGVTNIGSFAIIAPYLCSMAVLNSYSSKYLQPLEVNILGAIIGLFCMVSFPVISSTLSDIKILNSELGRIGLSASLVSEIFNVFLASLITFSKLYGERGPKNALVCVAAAILYILMVIFIIRPAMFWIIKQTPEGSHVSDNYVYSILILTLFSGYASYKFGFFVLFGPFILGLAIPEGPPLGTAIVKKIETVVNEIFMPIFVTTCCMRVDLADLMVWRNASDGSVDYFMVQTVVIVEVIVVAKFIACMIIPLRFGMPWNDAICLSLIMSSKGVVEMAAFSLIRDSKGLPDNIYSLLMMCIIVNGTLIPMMLRYMYDPTKKYAGYTKRNIIDLKSNSELRVLTCIHRPDNIPATINLLEATYPTKEEPICNYALQLVELIGRASPIFICHNLQRKKKLNSNTSIADKLLESFQSLEREFENCLVVNAFTAISPLEMMYDDICTLALDKYTSLIILPFHRKWSCDGNSIELEDESLRDINYRVMERAPCSVGVLIERAQMAHIFSPETPYKVCLLFIGGKDDREALFFTKRMSKNPHVKLTVVRFLSFDAVDEDSNGNGWEGLLDNELLDEIKTNNKIGNVSVRYVEEKVKDGPETALIIRSYVTEFDLIIVGRQAGVETPQTSGLLQWSEYPELGVLGDLLVSTDAGGKASVFVIQQQRTAMDV 723
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre12g01184 723 Gene3D - 2 382 IPR038770 -
Trre12g01184 723 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 4 718 - -
Trre12g01184 723 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 3 371 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre12g01184 Trre-Chr12 11730153 11733182 Dispersed/Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre12g01184 3 718 Antiporter Super Family AT5G22900 35.686 5.36e-163 489
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre12g01184 K26731 - gmx:100785558 989.178