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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre11g01252 ATGGCCGATACTCGTTGGTTTTTAGGAAATTCTTTGCCTGTATTGCAGATACAGATGTGTTTGATCTTTTTTGGAACTCTTTTCTTCAAATCTATATTATGTCGTTTTGGAATCCCCAAGTTCACATCTATGAGCATTGTTGGTCTAATATTTGCCGCTACATTCAATAATAATTGGACTGGAAAAATGAAGATGTTATTTTCCTTTGAATCACAAGAAAATCTAGGACTAATATCAATATTTGGTTACATGCTTTTCCTATTCTACATTGGTGTCAAAACAGATATGAGTGTTGTCCACAAAACTAAAAGTGGTGTAACCAACATAGGTTCTATTGCTATAATAGCTCCATATCTATGTAGTATGGTTGTTCTAAATTCCTACTCATCAAAATACCTACAACCTTTGGAAGTGAACATCCTTGGAGCTATCATTGGATTGTTCTGTATGGTGTCTTTTCCTGTAATTTCCTCAACTTTAAGTGATATAAAGATTCTCAATTCAGAATTGGGTCGAATCGGTCTATCAGCATCATTAGTTAGTGAGATTTTCAATGTGTTCTTAGCATCATTGATAACATTTTCTAAATTATACGAAGAGCGTGGTCAAAAGAATGCTTTGATTTGCGTTGCAGCCGCTATCTTCTATATACTCATGGTTATATTCATTATTCGACCTGCGATGTTTTGGATTATAAAACAAACACCGGAAGGTTCGCATGTGAGTGATAACTATGTCTATAGTATACTCATACTAACTTTGTTTTCGGGCTATGCTTCATATAAATTCGGATTCTTTGTACTCTTTGGACCGTTTATATTGGGTTTGGCTGTTCCAGAAGGACCTCCATTAGGCACAGCTATTGTCAAAAAAATCGAAACTGTTGTTAATGAGATTTTCTTGCCAATATTTGTGACTACATGTTGTATGAGGGTAGATTTGGCAGATTTGATGGTTTGGAGAAATGAAATAGATGGAAGTGTTGATTATTTTATGGTGCAAACTGTGGTTATTGTTGAAGTCATTGTTCTTGTCAAATTTATTGCTTGTATGGTAATTCCTTTACGTTTTGGGATGCCATGGAATGATGCTATTTGTTTATCTTTGATTATGAGTTCTAAAGGTGTTGTGGAAATGGCTGCTTTCTCTTTGGTCAGAGATTCTAAAGGTCTACCAGACAACATTTATTCATTATTGATGATGTGCATCATAGTAAACGGAACATTAATTCCGATGATGTTGCGTTATATGTACGATCCAACAAAGAAATACGCCGGTTACACAAAGAGAAACATAATAGATCTAAAAAGTAACTCGGAATTTCGAGTTTTAACATGTATTCATAGACCAGACAACATTCCAGCAACAATAAATCTTCTAGAAGCAACATATCCAACAAAAGAAGAACCAATTTGCACTTATGCACTTCAACTTGTTGAATTAATAGGAAGAGCTTCACCAATTTTCATCTGTCATAATCTTCAAAGAAAGAAGAAATTAAATTCAAACACATCAATGGCAGATAAGTTACTAGAATCATTTCAAAGTTTTGAAAGAGAGTTCGAAAATTGTTTAGTTGTCAATGCATTCACAGCTATCTCGCCACTAGAAATGATGTACGACGATATCTGTACATTAGCACTGGATAAGTATACATCGCTTATTATTCTTCCTTTTCATCGAAAATGGTCTTGCGATGGTAACTCTATCGAGCTAGAAGATGAGTCATTAAGGGATATAAACTATAGAGTTATGGAAAGAGCACCATGTTCCGTTGGTGTTTTAATCGAACGAGCACAAATGACACATATTTTTTCACCGGAAACACCATATAAAGTGTGTTTGTTATTTATAGGTGGGAAAGATGATAGAGAAGCACTCTTTTTCACAAAGAGAATGTCTAAGAATCCACATGTTAAACTTACTGTGGTTCGATTCTTGTCATCCGATGATGTTGATGAAGATTCGAACGGAAATGCAGGTTGGGAGTGTTTACTTGATAATGAACTATTAGATGAAATTAAGACAAAGAATAAAATTGGTAATGTTAGTGTTACATATATTGAAGAAAAAGTGAAAGATGGACCACAAACAGCATTGATTATAAGATCTTATGTAACAGAATTTGATTTGATTATTGTTGGGAGACATGCTGGAGTTGAAACTCCTCAAACTTGTGGATTGTTGCAATGGAGTGAGTATCCTGAACTTGGTGTTTTGGGAGATTTGTTGGTTTCTACTGATGCTGGTGGAAAAGCTTCTGTTTTTGTTATACAGCAACAAAGAACAGCCAAGGATGTTTAA 2304 0.3464 MADTRWFLGNSLPVLQIQMCLIFFGTLFFKSILCRFGIPKFTSMSIVGLIFAATFNNNWTGKMKMLFSFESQENLGLISIFGYMLFLFYIGVKTDMSVVHKTKSGVTNIGSIAIIAPYLCSMVVLNSYSSKYLQPLEVNILGAIIGLFCMVSFPVISSTLSDIKILNSELGRIGLSASLVSEIFNVFLASLITFSKLYEERGQKNALICVAAAIFYILMVIFIIRPAMFWIIKQTPEGSHVSDNYVYSILILTLFSGYASYKFGFFVLFGPFILGLAVPEGPPLGTAIVKKIETVVNEIFLPIFVTTCCMRVDLADLMVWRNEIDGSVDYFMVQTVVIVEVIVLVKFIACMVIPLRFGMPWNDAICLSLIMSSKGVVEMAAFSLVRDSKGLPDNIYSLLMMCIIVNGTLIPMMLRYMYDPTKKYAGYTKRNIIDLKSNSEFRVLTCIHRPDNIPATINLLEATYPTKEEPICTYALQLVELIGRASPIFICHNLQRKKKLNSNTSMADKLLESFQSFEREFENCLVVNAFTAISPLEMMYDDICTLALDKYTSLIILPFHRKWSCDGNSIELEDESLRDINYRVMERAPCSVGVLIERAQMTHIFSPETPYKVCLLFIGGKDDREALFFTKRMSKNPHVKLTVVRFLSSDDVDEDSNGNAGWECLLDNELLDEIKTKNKIGNVSVTYIEEKVKDGPQTALIIRSYVTEFDLIIVGRHAGVETPQTCGLLQWSEYPELGVLGDLLVSTDAGGKASVFVIQQQRTAKDV 767
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre11g01252 767 Gene3D - 14 425 IPR038770 -
Trre11g01252 767 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 8 762 - -
Trre11g01252 767 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 20 414 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre11g01252 Trre-Chr11 12174008 12177053 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre11g01252 7 762 Antiporter Super Family AT5G22900 36.157 9.62e-171 510
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre11g01252 K26731 - gmx:100785558 1029.62