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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre10g04573 ATGAATATGAATCAGACAATAAATGCAACGAGTGTAAAATATTTTACAGATTTGATATTAGAGAGGACAATTTTCAACTGTTCAAGTATTAATGCAACCTTATCAGATAAAGACTTGAGATTTTTAGTCGTAGATGTATGTGTTGATTTACCACCTAAGGTTGTATCTGATGGCATTTGGGCTAATCATGATCAAGGTGTAAAGCCTATGAAATCAACTTTGCCATTATTAGAGTTGCAAATTCTTACAATCTTTGCCATTACACAATGTTTCCATTTGGTACTCAAACGCCTTGGAGTCCCTTATTTCGTTTCACAAATCATGGCTGGTTTAGTTTTAGGACCATCTTTCAAGATATCAAATACATGGACTGAATTCAAAAACTACTTGTTTCCATATGGTACTGAAGATGTAATAAGTGTAATATCCATAATTGGCTATGGATTTTTCCTGTTTCTAAATGGTGTTAAAATGGATCTCACCATGATAACAAGAACAGGTAGAAAAGCATGGACAATAGCATTTTGTTCCTTTGTCATTCCAACTGTTCTTGGTCTTACAATGAGTTACAGATTCTTAGGATATTGGAACAATTACCTCGGAGAGTATGAAGCAAAAAATCTCCCGGTTATAGTTATCGGACAAAGTGGATGTTACTTTGCTGTCATAGCTTCTTTGCTATCTGATCTTGAAATTCTTAACTCGGAACTTGGTCGTTTAGCACTCTCAACGGCTTTGGTTATGGATGCTTTCTACTCGATTGTTTCAGGATTTGGCACAGCTGCAATTAGCAGCTTAAAAACGGATTCACATGATGATGCTAGTGGGAAAGGACCTATTGCGGCTCTTTTAACAAGTTTCTATTACTTCTGTTTTCTGGTATTGACTCCTTTTTTGTTGCGTCCAATAATGAAGTGGTTTGTTAGAAACACACCAGAAGGTAGACCAGTGAAGAAAGAATACACAAATATTGTGTTCATTATGGCTCTTGCAGTTGGAATGTTTGGAATTGTGGCAAACCAAAGTGTTTTAGCTGGATTGTTAGTTCTTGGTCTTATTGTGCCTGAAGGTCCTCCCTTAGGAACAGAAATGATTAAGCAATTGGAATTGTTTAGTACTTGGTTCCTTTGTCCTATTTTTGTCACAAGTTGTGCTATGAAGGTTGATATTGGTGTACATGTTGATAGAAGTTTGATTCTTGTTTGGCTTTTGATTATTGTTGTTGTTCATTTGCTTAAAATGTTGATGACAATTGGAATTTGTTGGTGTTGTAACATGCCAAAGATTGATGGATTGTGCCTAGCTCTCATGTTAAGTTGTAAGGGTGTTGTGGATTTTTGCACCAATGTGTTTCTTCATGATGCCATGCTTATGAGCAATGAATCATTATCTGTTATGACTATAAATGTGTTGGTGATGGGAACCATGGCGCGTATTGGTGTGAAGTTCTTGTATGACCCTTCAAGAAAATATGCAGGTTATCAAAAAAGAAACATCATGAACTTGAAACCAAACTCAGAGCTTAGGATAGTTTCATGCATCCACAAGCCAAGTCACATAATTCCCATAAAAAATGTTCTTGACATTTGTAGTCCTACATCAAGCAATCCATTGGTTGTTCATGTCTTGCATCTAATGGAACTCGTCGGAAGATCCTCTCCCATTTTCATCTCACATCGCCATCAAGAGCGAGTCGATTCAGGTCGCCACACTTTCTCCGAGGATGTCATTGTTACCTTTGATCTTTTCGAACACGACAATGCTGGTACTGTATCGGTGAGTACCTACACAGCTATATCGCCGCCGCGTTTCATGCACGATGATATATGCTATCTTGCATTGGACAAACTTGCATCCATTATCATTCTTCCTTTTCATCTAAGATGGTCAGAAGATGGTTCTATTGAATCGGCAGACGAGAACATAAGATCTTTGAACACCAAAGTTCTTGAAAGAGCACCTTGTTCAGTAGCAATCCTTGCCAATAGGGGGTGCTCTTCTACTACCAACGGCATTGGTAATACAAAGCAAATTGCCATGATATTCATAGGGGGTCCAGACGACAGAGAAGCATTGTGTTTCGCCAAAAGGACAATCAAAGATGATACTTATCACTTGGTTGTGTATCACTTGGTTTCAACAATCAAGAATGATGAGTTCACTAATTGGGATGTTATGCTTGATGATGAGGTACTAAAGGGTGTTAAGGGAGTTTATGGTAGTGTGGATAATGTGACATATGAAAAACTTGGTGTTGAAAACACTTCAGATACCACTGCGTTTATCTCAGATATAGCAAATCAACACGATTTCATTATAGTTGGGAGACGTAACGGGATGAAATCACCTCAGACACAGGCGCTCGAAAATTGGACCGAGTATCCTGAATTAGGTGTGATTGGAGATTTGCTTGCTTCACAAGATAATAATACCAAAGCTTCAATATTAGTTGTGCAGCAACAACTAATGCCTAAGTCATGA 2481 0.3789 MNMNQTINATSVKYFTDLILERTIFNCSSINATLSDKDLRFLVVDVCVDLPPKVVSDGIWANHDQGVKPMKSTLPLLELQILTIFAITQCFHLVLKRLGVPYFVSQIMAGLVLGPSFKISNTWTEFKNYLFPYGTEDVISVISIIGYGFFLFLNGVKMDLTMITRTGRKAWTIAFCSFVIPTVLGLTMSYRFLGYWNNYLGEYEAKNLPVIVIGQSGCYFAVIASLLSDLEILNSELGRLALSTALVMDAFYSIVSGFGTAAISSLKTDSHDDASGKGPIAALLTSFYYFCFLVLTPFLLRPIMKWFVRNTPEGRPVKKEYTNIVFIMALAVGMFGIVANQSVLAGLLVLGLIVPEGPPLGTEMIKQLELFSTWFLCPIFVTSCAMKVDIGVHVDRSLILVWLLIIVVVHLLKMLMTIGICWCCNMPKIDGLCLALMLSCKGVVDFCTNVFLHDAMLMSNESLSVMTINVLVMGTMARIGVKFLYDPSRKYAGYQKRNIMNLKPNSELRIVSCIHKPSHIIPIKNVLDICSPTSSNPLVVHVLHLMELVGRSSPIFISHRHQERVDSGRHTFSEDVIVTFDLFEHDNAGTVSVSTYTAISPPRFMHDDICYLALDKLASIIILPFHLRWSEDGSIESADENIRSLNTKVLERAPCSVAILANRGCSSTTNGIGNTKQIAMIFIGGPDDREALCFAKRTIKDDTYHLVVYHLVSTIKNDEFTNWDVMLDDEVLKGVKGVYGSVDNVTYEKLGVENTSDTTAFISDIANQHDFIIVGRRNGMKSPQTQALENWTEYPELGVIGDLLASQDNNTKASILVVQQQLMPKS 826
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre10g04573 826 Gene3D - 77 492 IPR038770 -
Trre10g04573 826 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 54 821 - -
Trre10g04573 826 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 86 475 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre10g04573 Trre-Chr10 54579428 54582066 Proximal
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre10g04573 46 818 Antiporter Super Family AT3G44900 36.080 2.53e-158 480
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre10g04573 K26731 - mtr:11429863 1235.71