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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre10g04570 ATGAATCAGACAATAGATGCAACGAGTGTAAAATATTTTACAAATTTGATATTAGACAGAACAATTTTCAATTGTTCAAGCATTAATACAACCTTATCAGATAAAGATTTGAGATTCTTAGTTATAAATGTGTGTGCTGATTTACCACCTAAGGTTGTATCTGATGGCATTTGGGCTAATCATGATCAAGGTGTTAAGCCTATGAAATCAACTTTGCCATTATTAGAGTTACAAATTCTTACAATCTTTGCCATTACACAATGTTTCCATTTGGTACTCAGACGCCTTGGAGTCCCTTATTTCGTTTCACAAATCATGGCTGGTTTAGTTTTAGGACCATCTTTCAAGATATCAAATACATGGACAGAATTCAAAAACTACTTGTTTCCATATGGTACTGAAGATGTAATAAGTGTAATATCCATAATTGGCTATGGATTTTTCCTGTTTCTAAATGGTGTTAAAATGGATCTCACTATGATAACAAGAACAGGTAGAAAAGCATGGACAATAGCATTTTGTTCCTTTGTCATTCCAACAGTTCTTGGTCTTACAATCATTTACAGATTCTTAGGATATTGGAACAATTACCTCGGAGAGTATGAAGCAAAAAATCTCCCGGTTATAGTTATCGGACAAAGTGGATGTTACTTTGCTGTCATAGCGTCTTTGCTCTCTGATCTTGAGATTCTTAACTCGGAACTTGGACGCTTAGCACTCTCAACGGCTTTGGTTATGGATGCTTTCAACTCAATTTTTTCAGGATTCGGCACAGCTGCAATTAGCAGCCTTAAAACTGATTCACATGATGATGGTAGCGGAAAAGGACCTATTGCAGCTCTTTTAACCAGTTTCTATTACTTCTGTTTTCTGGTATTGACTCCTCTTCTGTTGCGTCCGATAATGAAGCAGTTCGTTAGAAACACACCAGAAGGTAGACCAGTGAAGAAATTATACACAAATATTGTGTTCATTATGGCTCTTGCAGTTGGAATGTTTGGAACTGTGGCAAACCAAAGTATTTTAGCTGGATTGCTAGTTCTTGGTCTTATTGTACCTGAAGGTCCTCCATTAGGAACAGAAATGATTAAGCAATTGGAATTGTTTAGTACTTGGTTCCTTTGTCCTATTTTTATCACAAGTTGTGCCATGAAGGTTGATATTGGTGTACATGTTGATAGAAGGTTGATTCTTGTTTGGCTTTTGATTATTGTTATTGTTCATTTGTTTAAAATGTTGATGACAATTGGAATTTGTTGGCATTGTAACATGCCTAAGACTGATGGTTTGTGCTTAGCTCTCATGTTAAGTTGCAAGGGTGTTGTGGATTTTTGCACCAATGTGTTTCTTCATGATGCCATGCTTATGAGCAATGAATCATTATCTGTTATGACTATAAATGTGTTGGTGATGGGAACCATGGCGCGTATTGGTGTGAAGTTCTTGTATGATCCATCACGAAAATATGCAGGTTATCAAAAAAGGAACATCATGAACTTGAAACCAAACTCAGATCTTAGGATAGTTTCTTGCATTCACAAACCAAGTCACATAATTCCAATCAAGAATGTTATTGACATTTGCAATCCAACAAAAAGCAATCCATTGGTAGTTCATGTCTTGCATCTCATGGAACTCGTTGGACGATCCTCTCCAATTTTCATCTCACATCGCCTTCAAGAGCGATTTGGTTCAGGTCGTCACACTTTCTCTGAGGATGTCATTGTTACCTTTGATCTTTTCGAACATGACAATGCCGGTACTGTATCAGTGAGTACCTATACAGCTATATCGCTGCCACGGTTCATGCACGACGATATTTGTTATCTTGCATTGGACAAACTTGCATCGATGATCATTCTTCCTTTTCACCTGAGATGGTCAGAAGATGGTTCTGTTGAATCGGCGGACGAGAACATAAGGTCATTGAACACCAAAGTTCTCGAAAGAGCACCTTGTTCAGTAGCAATCCTTGTGAATAGGGGATGCTCTTCTACTACAAATGACATTGGTGATACAAAGCAAATTGCCATGATATTCATAGGGGGTCCAGACGACAGAGAAGCGCTGTGTTTCGCCAAAAGAACAATCAAAGATGATACTTATCACTTGGTTGTGTATCACTTGGTTTCAACAATCAAGAATGATGAGTTCACTAATTGGGATATTATGCTTGATGAGGAGGTACTAAAGGGTGTTAAGGGAGTTTATGGTAGAATAGATAATGTGACATATGAAAAAATTGGTGTTGAAAACACTTCAGATACAACTGCGTTTATCTCCGATATAGCGAATCAACATGATTTCATTATAGTTGGAAGACGTAACGGGGCAAAATCATCTCAAACACAAGCACTTGAAAATTGGACAGAATATCCTGAATTAGGTGTAATTGGAGATTTGCTTGCTTCACAAGATACTAATACCAAGGCTTCAATATTAGTTGTGCAGCAACAAATAATGCCTAAGTCATGA 2475 0.3733 MNQTIDATSVKYFTNLILDRTIFNCSSINTTLSDKDLRFLVINVCADLPPKVVSDGIWANHDQGVKPMKSTLPLLELQILTIFAITQCFHLVLRRLGVPYFVSQIMAGLVLGPSFKISNTWTEFKNYLFPYGTEDVISVISIIGYGFFLFLNGVKMDLTMITRTGRKAWTIAFCSFVIPTVLGLTIIYRFLGYWNNYLGEYEAKNLPVIVIGQSGCYFAVIASLLSDLEILNSELGRLALSTALVMDAFNSIFSGFGTAAISSLKTDSHDDGSGKGPIAALLTSFYYFCFLVLTPLLLRPIMKQFVRNTPEGRPVKKLYTNIVFIMALAVGMFGTVANQSILAGLLVLGLIVPEGPPLGTEMIKQLELFSTWFLCPIFITSCAMKVDIGVHVDRRLILVWLLIIVIVHLFKMLMTIGICWHCNMPKTDGLCLALMLSCKGVVDFCTNVFLHDAMLMSNESLSVMTINVLVMGTMARIGVKFLYDPSRKYAGYQKRNIMNLKPNSDLRIVSCIHKPSHIIPIKNVIDICNPTKSNPLVVHVLHLMELVGRSSPIFISHRLQERFGSGRHTFSEDVIVTFDLFEHDNAGTVSVSTYTAISLPRFMHDDICYLALDKLASMIILPFHLRWSEDGSVESADENIRSLNTKVLERAPCSVAILVNRGCSSTTNDIGDTKQIAMIFIGGPDDREALCFAKRTIKDDTYHLVVYHLVSTIKNDEFTNWDIMLDEEVLKGVKGVYGRIDNVTYEKIGVENTSDTTAFISDIANQHDFIIVGRRNGAKSSQTQALENWTEYPELGVIGDLLASQDTNTKASILVVQQQIMPKS 824
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre10g04570 824 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 52 819 - -
Trre10g04570 824 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 84 473 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre10g04570 824 Gene3D - 75 490 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre10g04570 Trre-Chr10 54564636 54567265 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre10g04570 44 816 Antiporter Super Family AT3G44900 37.345 2.23e-162 491
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Trre10g04570 K26731 - mtr:11429863 1229.16