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Sequence information


Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Trre10g01027 ATGGGTGGTAGTGTTGGGCATTCAATTGCATGTTATCAAGTGGACGTGCGTAATCCAAGTCGAATATGGCAAACTGAAAAAATTCTAACAACTGAGCTCTCTGTTCTTGCCATTCAACTTGTCTTTACTGTAGTTTTGTCTCGTTTCTTATTTTTTATCTATAAACCTCTTCATCAACCTCGTCTCATTTCTCAAATCTCTGTTGGTTTTCTACTAATTCAAGTACTTGGGATATTTCCATCTATTTTCGTCTTTATTTATCCTGCATCGGGGGTGCTTAACATTGACGTTCTAACACATACTGGTATTGTATACTACGCATTCCTTAGTGGTTTGGAGATGAATTTGAATACCATTTTACATGCAACGAGGAAAGCCGCAACCATTGCGATTTCAGGAATCATCTTCCCAATATTGATGGGACCAATTTTATATGCTCTACATCGAAAAGTTTATGCCAATGGTGTTGTATATCCACTTGAAGAAAGTACGATGAATGCTTATATACTATGGACTTTAGTTCTCACTGTAACAGGTTTTCCAGTTGTAGTTCACTCACTTTCTGAGCTCAAACTTCTTTATACTGGTCTTGGTAAGGATGCATTAACGGCAGCTATGATAAGTGACACATATGCTTGGATTTTATTCACATTATTTGTTCCATTTTCAATTAATGGTACAAGGGCAATATACTCGATATTAAGCACCATAATATTTGTTTTCATATGCATCTACATGGTGCGTCCTATCGCTGTAAAAGTCATTGATCAAAACACAGAAAAAGATGAATGGGATAATAACCAATTACTCTTTGTGGTGATGGGAATTTTCGTTTGTGCATACATAACGGATAGTCTTGGCACACATGGCGTTGTTGGGGCTTTTGTGTACGGTTTGATTTTACCTCACGGTAAATTTGCTGACATGGTGGCGTCAATGACTGATGATTTTGCTGGCGCATTTCTTGCGCCTCTCTTCTTTAGTGGCAGTGGAATGCGACTCTCGATGAGTACCATTTTGGTCCAGAAGAATTGGCCTTTGACTCTTATGGTTATAATCTTGTTGTGTCTTCCAAAGATTTTAAGCACTTTGTTTGCCACTTTCTTTTTTGGCATGCGTATTCGTGATGGTTTTGCTCTAGGCTTAATTCTTAATACAAAAGGTGCCGTTGCACTAATAATGCTCAATACTGCTTGGGATAAATCGATTCTTTCTGGACCAACTTACACTATCTTAACCTCTGGAGTCCTTTTAATGACTATAGTGGTGCCTCCCATTGTTAATGCCATATACAAGCCTAGAAAGCGATTTGAGCAAAACAAGCTAAAGACTATACAAAAGCTAAGACTTGATGCAGAGCTTAGAATTCTAGCATGTGTTCACAATACTCGACAGGCTGCAGGGATTCTTAGCCTCATCGAATCTTTTAATCCCACTAGACTTTCACCTATACATGTTTTTTCACTTTACCTTGTTGAGCTCACAGGACGTGTGGGTGCACTTGTTGCAGCTCATATGGAGAAGCCTAGTGGCCAACCTGGAGCACAAAATCTTACAAGATCCCAGGAAGAGCTAGAAAGCATTAACGGCACCTTTGGAGCATTTGGAGAAAAATATGATGCTGTCAGAGTGGAAACATTAAATGTTGTGTCATCTTATGCAACCATTCACGAGGATATATACAACTCCGCTAATGATAAACGAACAAGTTTGATTATCCTTCCATTCCACAAACAAGTAAGTTCAGAAGGTGAACTTGAAACAACGAATATTGTGCACAAAGATATAAACGTGAATGTGATGCAAAGTGCACCTTGCTCTGTGGGAATCTTTGTTGATCGTGATCTTGGGCTATTATCAAAAATGAAATTTTGTGTTTGTATGATATTTATTGGAGGTCCTGACGATCGTGAAGCCTTAGCTGTTGCATGGAGGATGGCTAGGCACCCAGGAACTCAATTATCAGTGGTTCGAATGCTCTTGTTTGATGAAGCTGCAGAAGTAGACACCTCATGTCACACTGAAGCACAAGGCATACTATCTGTTGTAATGGATAGTGATATGCAAAATGACTTAGATGACGAGTACGTGAATTCTTTTAGACTCACAGCAGTAAACAACAATGATTCTATATCCTATTCAGAGGTTGATGTTCATTCAGGTGAAGATATTCCCATAGTCCTCAATGAGCTAGAGAATTTTGGCTGTGATTTATACATAATTGGACAAGGGAATCGTAGGAGCTCTCGGGTCTTTTCAAATTTATTGGATTGGTGTGATTGTTCAGAACTTGGAGTTATAGGGGATATGTTGGCCTCAAACAATTTTGGTTCTCGCTCATCTGTGCTAGTTGTGCAACAATATGGGTATGGAGGAATGGTTTTGCGAAATCAACACAGCCACATGACAACTAATAACAATGGTATTGAGGCACTTGTCGTGAAGACTGAATAA 2454 0.39 MGGSVGHSIACYQVDVRNPSRIWQTEKILTTELSVLAIQLVFTVVLSRFLFFIYKPLHQPRLISQISVGFLLIQVLGIFPSIFVFIYPASGVLNIDVLTHTGIVYYAFLSGLEMNLNTILHATRKAATIAISGIIFPILMGPILYALHRKVYANGVVYPLEESTMNAYILWTLVLTVTGFPVVVHSLSELKLLYTGLGKDALTAAMISDTYAWILFTLFVPFSINGTRAIYSILSTIIFVFICIYMVRPIAVKVIDQNTEKDEWDNNQLLFVVMGIFVCAYITDSLGTHGVVGAFVYGLILPHGKFADMVASMTDDFAGAFLAPLFFSGSGMRLSMSTILVQKNWPLTLMVIILLCLPKILSTLFATFFFGMRIRDGFALGLILNTKGAVALIMLNTAWDKSILSGPTYTILTSGVLLMTIVVPPIVNAIYKPRKRFEQNKLKTIQKLRLDAELRILACVHNTRQAAGILSLIESFNPTRLSPIHVFSLYLVELTGRVGALVAAHMEKPSGQPGAQNLTRSQEELESINGTFGAFGEKYDAVRVETLNVVSSYATIHEDIYNSANDKRTSLIILPFHKQVSSEGELETTNIVHKDINVNVMQSAPCSVGIFVDRDLGLLSKMKFCVCMIFIGGPDDREALAVAWRMARHPGTQLSVVRMLLFDEAAEVDTSCHTEAQGILSVVMDSDMQNDLDDEYVNSFRLTAVNNNDSISYSEVDVHSGEDIPIVLNELENFGCDLYIIGQGNRRSSRVFSNLLDWCDCSELGVIGDMLASNNFGSRSSVLVVQQYGYGGMVLRNQHSHMTTNNNGIEALVVKTE 817
       

Annotation information


Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Trre10g01027 817 Gene3D - 34 441 IPR038770 -
Trre10g01027 817 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 41 428 IPR006153 GO:0006812|GO:0015297|GO:0016020|GO:0055085|GO:1902600
Trre10g01027 817 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 26 788 - -
       

Duplication type information


Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Trre10g01027 Trre-Chr10 8185301 8188128 Tandem
       

Functional genes information


Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Trre10g01027 4 810 Antiporter Super Family AT2G13620 37.001 9.06e-177 528