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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr6g1215 ATGTCACAATCCAAACGTTTGTTTTTCACTTTGTTCTTAAACACCTCGTTCCTTTTGTTGTTTTGTGTTTTTCTTGCTCTTCACTTTGAATCCTCAGAACATGTTTTTCTTAGGAACAAAACCAACAACAAAGTCAAAAACAAAAACTTTATCTTTAGTGTCAGTGATGATATTGATGAAGATTGTAAAAGTTTTCATAGCTTAAGTGATTATAAAGCTAAATGCTTTTACCTTAAATCAAACAACCCATGTGTCTCACAAGGCTATGTTGATTATCTTTACCTTTTCTATTGCAAAATTGGAAATTTCCCTTTTTTGGGTCATACCCTTTTGTTTCTATGGCTATTGGTTCTCTTCTATCTTCTAGCTAATACAGCTTCTGAATACTTTTGTCCTTCTCTTGATAATCTCTCCAAAGTTTTGAGACTTTCACCAACAATTGCTGGTGTCACTCTTCTCTCTCTTGGAAATGGTGCTAATGATGTTTTTGCTACATTTGTTTCTTTCAAAGGTAGTGGAACACAAGGCATTGGTTTCAACACTGTTCTTGGTGGTGGTTCCTTTGTTTCATGTGTTGTTGTGGGAATTATAAGTATATCAGTTAGACATAAAGGGATTCGTGTTAAAAAATCGGCTTTGATAAGAGATGTTTGTTTTCTTCTCTTTGTTCTTGTTTGTTTGTTCACTATCTTCATTAGTGGTGAAATCAATGTTTTTGTGGCAATTGGTTTTTGTTTGATGTATGTGGTTTATGTTGGTGTTGTTTATGTCTCATCTAGTAAAAGAAAAGGTGTTTGCGATGAAGATGCTGAAACTGAAACTGATTATGATGATTCAAGGAATGGTAATTGCAATGATTTAGGTGTTCCTCTACTTGGTTATATGGAGAAAGGAATGATAAATGGTGCTGAAGAATGTGAGTTTAGAATTGAGAAGAATTGTTGCAATGAAAAATCATCATTTTGTAGAATTTTACTCTATGTTTTGAATATGCCACTTTACTTACCTAGAAGATTAACAATTCCTGTTATTTGTGAAGAAAAATGGTCTAAGCTATATGCAGTTTCATCAGCTATATTATCACCACTTTTGTTAGCTTTTCTATGGATTCCAAACAATGAAAGTTTCTCAAGTTCATCAAGCTTAATAGTTTTTGGAATTGGATTATTGATTGGAATTATCTTAGGAGTAATAGCAATTATCACAACTGAGTCATCAAATCCACCAAAAAAGTACTTATTACCATGGCTAGTTGCAGGTTTTGTGATGAGTGTGACATGGAGTTACATTTCAGCTCAAGAATTAGTAGGATTGTTAGTTTCACTTGGTTTCATATGTGGTGTTAATCCATCAATACTTGGATTAACAGTACTTGCTTGGGGGAATTCAATTGGTGATTTAGTGACTAATTTGACAATGGCTTTAAATGGTGGACCAGAGGGGGTTCAAATAGCAATTTCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATCTTCAACACAGTTATTGGATTAGGTTTATCTCTTGTTACCACAACTTGGTGTGAGTACCCTTCATCTATTGAGATACCTAAAGATCCATATTTGTGGGAAACATTGGCATTTTTGGTTATTGGATTGATTTGGGCACTTGTTGTTTTGATCAGAAGAGATATGAAGCTTGATGCAATGTTAGGTGGAGGACTATTAGCTATTTACTTTGTTTCTCTTATTCTTAGGCTTATTCAAACATTAGGGTCACTTCAATTTAAGGATATGTTAGTGTGA 1755 0.3385 MSQSKRLFFTLFLNTSFLLLFCVFLALHFESSEHVFLRNKTNNKVKNKNFIFSVSDDIDEDCKSFHSLSDYKAKCFYLKSNNPCVSQGYVDYLYLFYCKIGNFPFLGHTLLFLWLLVLFYLLANTASEYFCPSLDNLSKVLRLSPTIAGVTLLSLGNGANDVFATFVSFKGSGTQGIGFNTVLGGGSFVSCVVVGIISISVRHKGIRVKKSALIRDVCFLLFVLVCLFTIFISGEINVFVAIGFCLMYVVYVGVVYVSSSKRKGVCDEDAETETDYDDSRNGNCNDLGVPLLGYMEKGMINGAEECEFRIEKNCCNEKSSFCRILLYVLNMPLYLPRRLTIPVICEEKWSKLYAVSSAILSPLLLAFLWIPNNESFSSSSSLIVFGIGLLIGIILGVIAIITTESSNPPKKYLLPWLVAGFVMSVTWSYISAQELVGLLVSLGFICGVNPSILGLTVLAWGNSIGDLVTNLTMALNGGPEGVQIAISGCYAGPIFNTVIGLGLSLVTTTWCEYPSSIEIPKDPYLWETLAFLVIGLIWALVVLIRRDMKLDAMLGGGLLAIYFVSLILRLIQTLGSLQFKDMLV* 585
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr6g1215 584 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 112 256 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tpr6g1215 584 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 417 569 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tpr6g1215 584 PANTHER CATION CALCIUM EXCHANGER 2 578 - -
Tpr6g1215 584 Gene3D - 339 571 IPR044880 -
Tpr6g1215 584 Gene3D - 143 267 IPR044880 -
Tpr6g1215 584 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 2 578 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr6g1215 Tpr-Chr6 12412532 12415235 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr6g1215 59 578 Antiporters AT5G17850 53.321 1.32e-163 476
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr6g1215 K13754 - gmx:100787016 747.273