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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr5g2208 ATGAAGGCTCTGAATGGGTTATTGGGATTAAGAAGCAAAAAAATTCATGGGGTTTTCAATTGTTTGTGTGTTATGGTTGTGTTCTTCTTTTTTTACAATAGGGAAGATATAATTCGTAACCCACTTCTTAGACAATCTGCATATTTGGTTAATCATAATGGTTTATCTCAAAATTCGATTTTGAAAGATGGGGTTTCTGTGATTCACCGTAGATTGGCTGAGATTAGTGCTAACACTTCAACTATAGATGATGACAAAGATTTGGTTGTTAATAAGCGTGGATTGTGTTTTGGATTGCTTCATCATGATGGTTATGGTAGTTCTTGTGAATTCTTAAAGGTCAATCCTCATTGCACTTCTGAAGGGTATATTGATTACTTGAGGTTTTTCTATTGTAAATGTCAAAATTTTAGGGTTCTTGGTTATCTAGTATTGGGTGTTTGGCTTGCTGCTTTGTTTTATCTCTTGGGGAATACTGCTGCGGATTATTTTTGTCCTTCGCTTGAGCATCTCTCAACGCTGTTGAAATTGCCTCCAACTGTTGCTGGCGTTGTGTTGCTTCCACTTGGGAATGGGGCGCCGGATGTGTTTGCTAGTATAGCTTCGTTTGTTGGGACTGATACCGGTGAAGTTGGTCTTAACAGTGTGTTAGGTGGTGCTCTTTTTGTTACAACTGTTGTTGTTGGAACTGTTTCTCTTTGTGTTGCAGAGAGGGATGTTCAAATTGATCAACGGTGCTTTATACGGGATCTGAGTTTCTTTCTGTTCACTCTTTTTTCACTGCTTTTGATTTTGTTTGTTGGTAAGATTGGTATTGGGGCAGCAATTGTGTTTGTATCGATTTATGTTGTTTATGCATTCATTGTTGCTGCCAATGAGATATTGCGGAAACATGCACGGAGGTTGAAATTGGATGCCGTGACACCTATGCTTCCTGTCCAAGGAAGTGTGTTCTCGATTGGTTGTGAAGAGGATACTAGTATATATAGCTCTTTGCTTGACTTAGACATTGAGAGTGATCCTCCCCGTCTCCCTCCTTCCTTGCCTCAATGGATGTGGTCTTCAAATGTGGCAATATATTCAAACCCGACAAGTAAAATCAGTTTTTTAGAAGATGATAGGCCTTGGGGATGGAGTGATGGATCCACGGAAAACACCAGGTTGTCGTTCACTGTATCGAAGCTCTTTTTACTCATGGAGATGCCACTTGCAATTCCTAGACGCCTAACAATTCCAATGGTTAACGAGGAAGATTGGTCGAAGCCGATCGGTATAGCCAGTGCTTCATTGGCTCCCATTCTCTTGGCCTTTTTGTGGAGCACCCAAGATAATGTGAGTTCTACAAGTATTATGCTTGCTTATTGTTTTGGTATTTCTGTTGGATGCACCCTTGGTGTTCTTGCATACAAATACACAGAATCTAATCGTCCGCCGTCTCATCATTTGATTCCCTGGGTTCTTGGAGGATTTGTTATGAGCATAGTGTGGTTCTACATAATAGCAAATGAACTTGTGGCTCTGTTAGTAGCATTTGGTGTAATTTTCGGAATTAATCCATCAATTCTGGGATTAACTGTATTAGCATGGGGAAATTCAATGGGAGATTTAATGTCAAATGTTGCATTGGCATTGGATGGGCATGATGGAGTTCAGATAGCTTTATCTGGATGCTTTGCAGGTCCTATGTTCAACACACTTGTTGGTTTGGGGGTCTCGTTGCTGCTTGGTGCAGTTTCAAAGAAACCTTCTCTGTACGTGGTGCCTGAAGACGGTAGCTTATTTTACACCATGGGATTTCTTATCACAGGACTTCTATGGTCACTTGTTGTTTTACCGCGCAACAACATGCAACCCAGCAAAATGTTAGGAATGGGTCTCATTGGCCTTTATATGCTATTTCTTTCTTTCAGAGTCTGTACTTCTATGGGGATAATAACAATGGCTGGTTTAAGTTAG 1956 0.4049 MKALNGLLGLRSKKIHGVFNCLCVMVVFFFFYNREDIIRNPLLRQSAYLVNHNGLSQNSILKDGVSVIHRRLAEISANTSTIDDDKDLVVNKRGLCFGLLHHDGYGSSCEFLKVNPHCTSEGYIDYLRFFYCKCQNFRVLGYLVLGVWLAALFYLLGNTAADYFCPSLEHLSTLLKLPPTVAGVVLLPLGNGAPDVFASIASFVGTDTGEVGLNSVLGGALFVTTVVVGTVSLCVAERDVQIDQRCFIRDLSFFLFTLFSLLLILFVGKIGIGAAIVFVSIYVVYAFIVAANEILRKHARRLKLDAVTPMLPVQGSVFSIGCEEDTSIYSSLLDLDIESDPPRLPPSLPQWMWSSNVAIYSNPTSKISFLEDDRPWGWSDGSTENTRLSFTVSKLFLLMEMPLAIPRRLTIPMVNEEDWSKPIGIASASLAPILLAFLWSTQDNVSSTSIMLAYCFGISVGCTLGVLAYKYTESNRPPSHHLIPWVLGGFVMSIVWFYIIANELVALLVAFGVIFGINPSILGLTVLAWGNSMGDLMSNVALALDGHDGVQIALSGCFAGPMFNTLVGLGVSLLLGAVSKKPSLYVVPEDGSLFYTMGFLITGLLWSLVVLPRNNMQPSKMLGMGLIGLYMLFLSFRVCTSMGIITMAGLS* 652
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr5g2208 651 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 486 637 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tpr5g2208 651 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 147 289 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tpr5g2208 651 Gene3D - 177 309 IPR044880 -
Tpr5g2208 651 Gene3D - 422 639 IPR044880 -
Tpr5g2208 651 PANTHER CATION/CALCIUM EXCHANGER 4 11 647 - -
Tpr5g2208 651 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 11 647 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr5g2208 Tpr-Chr5 43055712 43058314 Dispersed/Transposed
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr5g2208 84 643 Antiporters AT5G17850 42.553 1.26e-121 371
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr5g2208 K13754 - gmx:100796101 1029.24
       

Event-related genes

Select Gene_1 Chr_1 Start_1 End_1 Gene_2 Chr_2 Start_2 End_2 Event_name
Tpr5g2208 5 43055712 43058314 Tpr5g2208 5 43055712 43058314 ECH