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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr5g0426 ATGGCACCTTCCATTTTCACTTCTAACTCCAAACCACAACCAAAAAAACTCACTCTTCTCCTCAACACATCTTTCCTCTTCCTCCTATTTTTTTGCCTCAAACTTTATATCAATCCTTCAAATTCTAATTCTCATTTTCATCATGTTTCCTCAAAACTCTTCAACCATGCTAGAATCCTCACTAGTGATATCATAGTTGATTCATGCACTGAACTTCACAAGTACTCAAATTACACCTCTAAGTGCTTATATGTCAAAACACATTCTGATTGTAGATCAAAAGGTTACATAAATTATCTTCAAATCTTTTATTGTAACCTTGGAAATTCACCAATTCTTGGTCACACGTTACTTGTTTTATGGCTTGTAGTTTTGTTCTATCTTTTAGCCGACACGGCTTCAAATTACTTCTGCACCTCCCTAGAAGGTTTGTCTAATATCTTAAGACTATCTCCAACCATAGCTGGAGTAACATTACTCTCTCTTGGTAATGGTGCTCCTGATTTCTTTGCTAGTGTTGTTTCTTTCACAAGTTCAAATAATGGCGCGGTTGGTTTAAATAGCATTTTGGGGGGTGCATTTTTTGTTTCCACATGTGTTTTGGGAGTCATAAGTTTTTTAGTTAGTTCCAAATCTTATGATGTTGAAATTGACAAGGCTAGTTTCATTAGAGATGTCATTTTCTTCCTTTTCTCTTTGTTCATTCTTCTCATCATCATTGCCATTGGAAAAATTAGCCTTTTTGGTTCAATTTGCTATCTTTCCATCTATTTTCTATATGTTTGTGCTGTCTCGGCCACACATTTCTACTACGAAGTCGATAAAAAAGAATTAGTTGAATCTTCATCGTCTTTTGATGATTTAGTTGAATCCGGCATACCATTATTAGGCTATGCCGACGATGATATTGATAATGACAATGATTCTAATCAGAAACCAATTTTACGAAATCAAGTTGGCGTTGTTAATGAGGAGACAAAAAAAGAAGAAATATTTTCTAGCACTTACTACTTATGGAAGTTTCTAGAAGTACTTGAATTACCACTTTGTTTACCGAGAAAACTAACTATACCCGTTGTGAGTGAAGAAAATTGGTCGAAACCATATGCAGTTATATCAGTTACCCTAGCGCCAATTTTATTTGCAATTCTTTGTAATACACAAATGGAAAATGTGGATTCAAAGAGTACTTTAGTTGCATATTTAACATCATCATTAATTGGTATTGTTTTTGGAAACATGGCATGTGTGACAACAAAAAGTACAAGACCACCTAGAAGATGTTTGTTTCCTTGGCTAGCTGGTGGATTTTCAATGAGTGTGACATGGACTTATATAATTGCTGAGGAACTTGTTTCACTTTTGATTTCAATTGGATATGTAATAGGTGTTAGTCCTTCAATTTTAGGGTTAACTGTTTTAGCTTGGGGAAATTCTCTAGGTGATTTGATTGCAAATGGTGCTATGGCTAAAAATGGTGGTGTTGATGGTGCACAAATAGCTGTTTCAGGTTGTTATGCTGGTCCTATGTTTAATATTTTGATGGGATTAGGGTTACCTCTTGTTCTTTCAGCTTGGGGTGAATACCCTAATTCTTATGTTGTTCCTAAGGATAGTTCACTTTTGGGGACAATTTTGTTTTTGATGGTAGGGGTACTTTGGTCACTTGTTGTATTGGTTAAGAAGAATATGAGGCTTGATAAGTTTTTAGGGGCTGGTCTCTTGACCATTTACCTTTGCTTTTTGTTTTTAAGGTTAGCTATGGCTATTGGTGTTCTTAATTAA 1785 0.3507 MAPSIFTSNSKPQPKKLTLLLNTSFLFLLFFCLKLYINPSNSNSHFHHVSSKLFNHARILTSDIIVDSCTELHKYSNYTSKCLYVKTHSDCRSKGYINYLQIFYCNLGNSPILGHTLLVLWLVVLFYLLADTASNYFCTSLEGLSNILRLSPTIAGVTLLSLGNGAPDFFASVVSFTSSNNGAVGLNSILGGAFFVSTCVLGVISFLVSSKSYDVEIDKASFIRDVIFFLFSLFILLIIIAIGKISLFGSICYLSIYFLYVCAVSATHFYYEVDKKELVESSSSFDDLVESGIPLLGYADDDIDNDNDSNQKPILRNQVGVVNEETKKEEIFSSTYYLWKFLEVLELPLCLPRKLTIPVVSEENWSKPYAVISVTLAPILFAILCNTQMENVDSKSTLVAYLTSSLIGIVFGNMACVTTKSTRPPRRCLFPWLAGGFSMSVTWTYIIAEELVSLLISIGYVIGVSPSILGLTVLAWGNSLGDLIANGAMAKNGGVDGAQIAVSGCYAGPMFNILMGLGLPLVLSAWGEYPNSYVVPKDSSLLGTILFLMVGVLWSLVVLVKKNMRLDKFLGAGLLTIYLCFLFLRLAMAIGVLN* 595
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr5g0426 594 Gene3D - 363 587 IPR044880 -
Tpr5g0426 594 Gene3D - 150 293 IPR044880 -
Tpr5g0426 594 PANTHER CATION/CALCIUM EXCHANGER 1 7 594 - -
Tpr5g0426 594 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 433 586 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tpr5g0426 594 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 119 263 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tpr5g0426 594 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 7 594 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr5g0426 Tpr-Chr5 6516339 6518346 Tandem
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr5g0426 67 594 Antiporters AT5G17860 52.075 5.76e-176 507
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr5g0426 K13754 - gmx:100818583 785.793