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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr5g0425 ATGGCTATCACAAATTCTTTATCCAAATACATGACTTTGTTCATCAACACCTCTTTCCTTTTGGTTATTTGTGTTTTCATGATTATTCACTTCAACACACCAAAAGAATTTGGTGTACTTGTAAGGAACAATCAATCTACCTTTGATGATGAAAGTGATGATGAACAACAAGATTGCAATATATTAGACAACATAGGTAACAACAAAGACAAGTGTTTGTACCTTAAATCCAACAATAATTCATGTGTCTCTCAAGGATACATTGATTACCTTTTAATTTTCTATTGCAAATTTGGAAAATTCCCTTTATTGGGTTATACCCTTTTGTTTCTTTGTCTATTAATTCTTTTTTATTTGTTGGCTAATACAACTTCTTATTATTTTTGTCCTTCACTTGAAAACTTGTCCAAATTGTTAAAATTATCACCAACAATTTCTGGTGTCACTCTTCTCTCTCTTGGTAATGGTGCTTGTGATGTTTTTTCTAGTCTTGTTTCTTTTCAAGAAAGTGAGACACGTAATATTGGTTTAAACACAATTATTGGAGGTGTTTTTTTTGTGTCATGTGTTATTGTTGGAATAATTAGCATTTCAATTCATCAAAGAAATGTTCATGTTATAAAGTATGATTTTGTAAGAGATATTTGTGTTTTACTTTTTGTTCTTCTTTGCTTATTTTGTGTTTTGATCATTGGTGAGATTAATTTTCTTGGAGCAATTTGTTTTTGTTTGATTTATCTTGTTTATGTATTTTTTGTTTATGTCTCTTCTACTAAATGGAAAGATGGTGAAAGGGGTAATGATGGTATTTCAAGTTATGGTACTAATGATCAATTGAATTTGAATGTGCCTCTTAATGATGATGTGGAGAAAAGATCCATTGATTGTGTTGAAAATGGTATTCAAGAATATGATTTGAATATAGAGAAAAATTGTTGCTACATGAAATCTTCAATATGTAGAATTTCACTTTGTGTTCTTGAGATGCCACTTTACTTGCCAAGAAGATTAACAATTCCAATTATATGTGAAGAAAAATGGTCAAAGGTATATGCAATTTTTTCAATGATATTAGCACCACTTCTCTTATCTTTTCTATGGAACACTCATAAGGGATATAGCATTTCAAACACAAATATTATTATTTATGGAATTGGATTATTGGTTGGAATTATATTTGGTGTAATAGCATTTTTCACAACGGAAATGTTAGTGCCACCAAAAAAGTATTTATTTATTTGGCTTGTAGGAGGGTTTATAATGAGTGTGACATGGAGTTACATTATAGCTCAAGAGTTGGTTGGATTGTTGGTTTCAATTGGTTTCATATGTAGAATAAGTCCTTCAATTTTAGGGTTAACTATTCTTGCTTGGGGTAACTCAATTGGTGATTTGATGGCAAATTTAACAATGGCTTTAAATGGTGGACAAGAGGGGGTTCAAATAGCAATTTCAGGTTGCTATGCTGGTCCTATTTTTAATACTCTTGTTGGATTAGGAATTTCTCTTGTAAGTTCAACTTGGTCACAATATCCACAACCTATTGTGATTCCTAAAGATCCTTATCTATGGGAGACATTGGTGTTTTTGGTGTTTGGATTGGTTTTTGCACTTTTGGTTTTGTTAAAAAAAGATATGAAACTTGATGGAGTATTAGGAGGAGGACTTTTAGTTGTTTACTTCATTTCTCTGTTTTTGAGGTTGATTCAAACACAAGGGTATCTCCAATTTTATGACATGTAA 1743 0.3092 MAITNSLSKYMTLFINTSFLLVICVFMIIHFNTPKEFGVLVRNNQSTFDDESDDEQQDCNILDNIGNNKDKCLYLKSNNNSCVSQGYIDYLLIFYCKFGKFPLLGYTLLFLCLLILFYLLANTTSYYFCPSLENLSKLLKLSPTISGVTLLSLGNGACDVFSSLVSFQESETRNIGLNTIIGGVFFVSCVIVGIISISIHQRNVHVIKYDFVRDICVLLFVLLCLFCVLIIGEINFLGAICFCLIYLVYVFFVYVSSTKWKDGERGNDGISSYGTNDQLNLNVPLNDDVEKRSIDCVENGIQEYDLNIEKNCCYMKSSICRISLCVLEMPLYLPRRLTIPIICEEKWSKVYAIFSMILAPLLLSFLWNTHKGYSISNTNIIIYGIGLLVGIIFGVIAFFTTEMLVPPKKYLFIWLVGGFIMSVTWSYIIAQELVGLLVSIGFICRISPSILGLTILAWGNSIGDLMANLTMALNGGQEGVQIAISGCYAGPIFNTLVGLGISLVSSTWSQYPQPIVIPKDPYLWETLVFLVFGLVFALLVLLKKDMKLDGVLGGGLLVVYFISLFLRLIQTQGYLQFYDM* 581
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr5g0425 580 Gene3D - 141 272 IPR044880 -
Tpr5g0425 580 Gene3D - 322 568 IPR044880 -
Tpr5g0425 580 PANTHER CATION CALCIUM EXCHANGER 1 576 - -
Tpr5g0425 580 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 111 254 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tpr5g0425 580 Pfam Sodium/calcium exchanger protein 415 567 IPR004837 GO:0016021|GO:0055085
Tpr5g0425 580 PANTHER NA+/CA2+ K+ INDEPENDENT EXCHANGER 1 576 - -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr5g0425 Tpr-Chr5 6513924 6516347 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr5g0425 14 573 Antiporters AT5G17850 50.794 2.00e-158 463
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr5g0425 K13754 - gmx:100813848 675.241