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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Tpr4g2908 ATGGCTGAAACTAGAGTAAATGCAAGCATTACCGATGTTACAAATAATGGAACAATATGGATATGTGAACACATGTTCAGGTATCAAAGGTCAAAAGGAATTTTCTTTTATGATAATCCATTTAGTTTCACATTGCCAGTGCTTTTTCTTCAAACAACCTTAGTTTCTGTCTCTACCACAATTTTACAGCTTATACTTGAACCAATTGGGACGAGTAGTTTCTTTCCGCAACTGCTGGCAGGCTTGGTACTAGGACCATCAGTTATTGGACAAAATGAGTTCATAAAAAAATGGCTATTCCCACCAAAAACATTCTACATAAGTGAGACAATTGCATTTTTTGGGAGCATGATGTATATGTTCTTAATTGGAGTAAAAATTGATATAAGTAGTGTTACAAGAACAGGGAAAAAAGCTTGGGCAATTGGAATATTTTCATTTATTATACCACTAATGTTAAGCTTATTAATTGCACTTTTTCTAAGAAAAACATTATTAACCCCCGACAAAGGTCTCTACGAGTCTATATTTTCCATTGTATTTATCTTTTCAACGGGTTCATTTCACGTCACTACAATTCTCTTAGCCGATTTAAAATTATTAAGCTCCGAAATGGGGCGATTAGCAATTTCTTCATCCTTGATAAGTGGATTCATTTCGATATTGTGGGTTACGTGTTTGTCAACATTGAAACAATCAGAAACAAAGAAAGACAACGGTCCTTTTAATTGGATGACAATGTCTTTCATCGTTATGATTCTCGTCATCATATATGTTCTACGACCGATAATGTTATGGATGATACGAAAAACACCTGAAGGAAAACCGATTAAAGAATCGTACATATTTTCGGTATTTTTAATGGTATTAAGCTGTGCATTATTTGGCGAATATATAGGACAACATTTTATGATTGGGCCTATTGTTTTTGGTATGGCTGTACCTGATGGTCCTCCATTAGGGTCTGCATTGACTGAAAAATTGGATGCATTGGTGTCAACAATTTTTTTGCCATTGTATTTTCTTTATAGTGGTATTAGATTTGATCTTTATATAATTGATGCTCAAAGCTTTGCAATTGTGCAAGTTGTTGGTATAGTTTCAAGCATTGGGAAGATTGTAGGAACTTTGTTGCCTTCAATTTATTGGAAGATGCCATTTACAGATGTTCTATCTTTAGGACTACTTATGAGTACTCAAGGCATCACACAATTGCTTTACTTGCAGTCTTCTCTACACCTTAATATTATAGATGAACAGTCATATGGCAATGCATTGATAGCTCTACTATGGTTGACAGGAGCTACAACACCAATTATTAAATTCCTATATGAGCCATCTAAGAGGTACTTGTCTTTAAATAGAAGAACCATTGAACAATCAACTTCAGATATTGAATTACGTCTCATGGCATGTATACACACTCAAGATGACACATCATCCATAATCAATCTTCTTGAAATGTCAAACCCTTCATTGGAAAATCCAATTTGTTTCTATGTCTTACATCTACTTCAACTAAAAGGAAGATCTGCACCTCTTTTTATAGATCATCAACCATCAAGCAAAAAGTTGAATGCACCGCATTCAAATCATTCTCAAAACATAATAAATGCCTTTAGATCGTATGAGAAACAAAAATCGAACAATGTGGTTGTCAAAGTCTTCACAACGATCTCGCCTTATGAGACGATGCACGATGAGATATGTATGCAAGTTGATGAGAAAAGAGTTTGTTTGTTGATCGTGCCTTTTCATAGACAATGGAGACCAACCGGGGTTACAGAATCGGCTCAGCCTATTCGAGCCTTAAATCGTCATCTTCTCAGAATGGCACCTTGTTCAGTTGGGATTCTAATCGAACGCGGCACTTTGTGTAGGAACAACCCTTTAACATCTGTCTTGTTTTATAGTGTTGGAATAGTTTTTATAGAAGGAGCCGACGATCGCGAAGCGTTAGCTTACGCAATGCGAATGGCTAATCATCCGAACGTCAGGATAACCCTAGTTCGATTAATGGAACCTCGAAAGAAAAATAGGAACTTAATGCATCGGGATCCAGATGGCGATTTAATTCATAGGTTTAAAGTGGAGTGTATTCAAATTAAACGACACGATTATCGAGAGGAAATCGTAAGAGATAGTGTTGAAATGATAAATGTAATAAGGTCACTTGATGGTTGTTTTGATTTGGTTTTGGTTGGTAGAAGACATGCAACTGAATCTAATTTGTTTAGTGGATTAACTGAATGGAATGAGTTTCCAGAACTTGGTCCTATTGGAGACATGTTAGTGGCTTCTGATTCTACTTTTGATGGTTCAGTTTTGGTGATTCAACAACAAAAGAGATCAGGGGTTGGTTATCATGATTTGAGTTTAGATTCAGGTATCAATACAATGCAAGAATCAATAACAATTGTGGAAGTACCTCGTGAGAGAAAGGTGTGGCCAATTGCTTAA 2460 0.3585 MAETRVNASITDVTNNGTIWICEHMFRYQRSKGIFFYDNPFSFTLPVLFLQTTLVSVSTTILQLILEPIGTSSFFPQLLAGLVLGPSVIGQNEFIKKWLFPPKTFYISETIAFFGSMMYMFLIGVKIDISSVTRTGKKAWAIGIFSFIIPLMLSLLIALFLRKTLLTPDKGLYESIFSIVFIFSTGSFHVTTILLADLKLLSSEMGRLAISSSLISGFISILWVTCLSTLKQSETKKDNGPFNWMTMSFIVMILVIIYVLRPIMLWMIRKTPEGKPIKESYIFSVFLMVLSCALFGEYIGQHFMIGPIVFGMAVPDGPPLGSALTEKLDALVSTIFLPLYFLYSGIRFDLYIIDAQSFAIVQVVGIVSSIGKIVGTLLPSIYWKMPFTDVLSLGLLMSTQGITQLLYLQSSLHLNIIDEQSYGNALIALLWLTGATTPIIKFLYEPSKRYLSLNRRTIEQSTSDIELRLMACIHTQDDTSSIINLLEMSNPSLENPICFYVLHLLQLKGRSAPLFIDHQPSSKKLNAPHSNHSQNIINAFRSYEKQKSNNVVVKVFTTISPYETMHDEICMQVDEKRVCLLIVPFHRQWRPTGVTESAQPIRALNRHLLRMAPCSVGILIERGTLCRNNPLTSVLFYSVGIVFIEGADDREALAYAMRMANHPNVRITLVRLMEPRKKNRNLMHRDPDGDLIHRFKVECIQIKRHDYREEIVRDSVEMINVIRSLDGCFDLVLVGRRHATESNLFSGLTEWNEFPELGPIGDMLVASDSTFDGSVLVIQQQKRSGVGYHDLSLDSGINTMQESITIVEVPRERKVWPIA* 820
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Tpr4g2908 819 Pfam Sodium/hydrogen exchanger family 54 436 IPR006153 GO:0006812|GO:0015299|GO:0016021|GO:0055085
Tpr4g2908 819 PANTHER CATION/H + ANTIPORTER 16 818 - -
Tpr4g2908 819 PANTHER CATION/H+ EXCHANGER 2 16 818 - -
Tpr4g2908 819 Gene3D - 47 451 IPR038770 -
       

Duplication type information

Select Gene Chromosome Start End Duplicated_type
Tpr4g2908 Tpr-Chr4 33010964 33014932 Dispersed/Wgd
       

Functional genes information

Select Gene Gene_start Gene_end Function Ath_gene Identity(%) E-value Score
Tpr4g2908 31 811 Antiporter Super Family AT2G13620 35.229 4.05e-165 498
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Tpr4g2908 - - mtr:MTR_5g074380 1219.14